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CRISPRs details
NC_000909_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_000909_1                                                                                                                 
top
Strain :
Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661
RefSeq :
NC_000909 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_000909_1
DR consensus (30 bp) :
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
Number of repetitions :
26
Begin Position :
378
End Position :
2127
378
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
TTGCTCCTGCATTAGATGGAGGAGCGTATGTAGCGTATTA
447
448
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
TTTGCAGAGTTGTATTCTGGCAGTGCGGATATTATAA
514
515
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAA
ATCTAATACAAACAGTGAAGATACTGAATACTGCGGA
581
582
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAA
ACTGTCTCTTAACATATTCTGCAGTTTTACAACTTTCGAA
651
652
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
CATAATTGATGAGGCTAATAGAATAGCACCTAATAGA
718
719
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
ATTAATGTAATACTTTTTTATAAATTTATAATGCAAA
785
786
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
TAATTTCTACGACTTGGATTACTTCACGATGGAAATCAAA
855
856
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
ATAGAAGAATTTGATGCTTTATTTGGATGTTTGAAGA
922
923
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
CAGCTTGTGGCGATACCTTCAAGTTCAAAATTTTTCCCCATA
994
995
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
ACTAACTTTAATTATATCCCTTTCAGCTTCCTCATCATAA
1064
1065
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
TAGAAATTGTCTCAATAACTGCGTTTGTTGATGGAACA
1132
1133
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAG
CAAACAGCATTATAACAATTGATAGACAGAAATTCAGA
1200
1201
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
ATTGGTGAAGTAGTTGCTTATGACTTAGATAGTGGA
1266
1267
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
GACATAATTAAAGCATAATAATACTTTAACGCTTCTTTTAA
1337
1338
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
TATATCTCCCTCCTTAACCTTTTTTTATTTAACATTCCCAT
1408
1409
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
ATCTACTTGGAACTACAACACTCACAGGTAAATCTAAT
1476
1477
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
AAGTTAAAACAATGGTTAATGTTAAGGGGGATTAAGCTGT
1546
1547
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
GACATAATTAAAGCATAATAATACTTTAACGCTTCTTTTAA
1617
1618
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
TATTACCACCCTCTTGCTTTTAAAAAGCTTTCTAATTCTTC
1688
1689
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
AATCCAGATTTGAATTGTTCCCAAGCATTACCGAGCCA
1756
1757
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
TTTTTATCGAAACCTTCTAAAATCATATCTCATCCCCCCA
1826
1827
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
CTTATTTTAAGTTACAAAAAAGTTTATAGTGGTTAATG
1894
1895
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
CTTATTTTAAGTTACAAAAAAGTTTATAGTGGTTAATG
1962
1963
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
CTTATTTTAAGTTACAAAAAAGTTTATAGTGGTTAATG
2030
2031
ATTAAAATCAGACCGTTTCGGAATGGAAAT
CTATGTCTGTGATAGTTACAATATTATTTCCTATTTT
2097
2098
ATTAAAATCAGACCAATTCGGGATAAAACG
2127
Left flanking sequence : Till position 378 (length
bp)
TTATATTATGAAGTAGTTACTTACCCTTAGAAAAATATGGTATAGAAAAGCTTAAATATTAAGAGTGATG
AAGTATATTATGTTGTGAATGATTGCCCTA
Right flanking sequence : From position 2127 (length
bp)
TTTTTCTTTATTAAACTCAATTACTCTTTTCTACACTCTTTTATTAAAATCAGAAGAGAAATGAGCATTA
AAATAAAATACTAAAAATTCACTCAAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp