Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_000909_8                                                                                                                 top


Strain : Methanocaldococcus jannaschii DSM 2661 RefSeq :NC_000909 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_000909_8
DR consensus (30 bp) : GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACNumber of repetitions :15
Begin Position : 428572 End Position : 429572

428572GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTAACATAACAAAAATTCATCAAGTGTTTTACATTTTATGTG 428642
428643GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTAATTCTATTTTTTATTTCAGTTTTGTCAATTTCTGAT 428711
428712GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACAATAATATAAGTTGGCCAATCATTTCTCGGATGGTCAACA 428781
428782GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACCGAAACAGATATATTAGGAAATTATATTGATGATAT 428847
428848GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTTGGCAATTTATATAGCTCAATTGCGTATTCTTTCTT 428915
428916GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACATGAACTCTTTTAAATTATCTCTTTTACTACCCCTACAAATTCCC 428990
428991GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTATTTACCTAATATTTTGATTAAATACTAAAAATTCT 429057
429058GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTTTTAGGTAGGATACTGAGGGCTGTAAGTTTTTTT 429123
429124GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTCAGAATTCTCATCTGCATATTGCTTCATTATTCTCTTTAACGTTA 429199
429200GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACGAGTGTGGATATGTTGAAGATTTTGGAGTTGATTATTGTGGTG 429272
429273GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTATAACATAAGATTTTTATGTGTTCTTTTTGTTTTCT 429340
429341GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACATACTCAGATTTTGTTGTATGATTTGCATCTTTATTTT 429408
429409GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTCGGTTATCAAAAAGTTTAAATTTATGATAGGAAT 429474
429475GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAACTTTTTAACGAGAGTTTTCAGAGCATTTAGCTTTTTTGA 429542
429543GTTAAAATCAGACCGATTCGGAATGGAAAC429572
Left flanking sequence : Till position 428572 (length bp)
ATTTATATTATGAGATAGTTATTTATCCTTAGAAAAATGTGGTGTAGAAAAGCTTAAATATTAGGAGAGT
AGTATAAATTATATTGTGGATAAGCCTCCT
Right flanking sequence : From position 429572 (length bp)
TAAGCTTCACCTTTTAACAAATAATAAGCACTTGATTAAAATCATATCTCTTAGAGAATAAATTATGCTC
TTTTTAGTACAAAATAGTTATTAATAAAAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp