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CRISPRs details
NC_003106_6
Flanking alignement tool
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NC_003106_6                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus tokodaii str. 7
RefSeq :
NC_003106 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_003106_6
DR consensus (24 bp) :
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
Number of repetitions :
48
Begin Position :
2664097
End Position :
2667176
2664097
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATGGGTAGGTAACGTAATATAGACGATACGTCGAGAAGATTCT
2664163
2664164
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TAATAAAAAGTAGTCAGCTTCATCTATGAATATTTTTGTATT
2664229
2664230
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTAGGCTTGAAACCAATACTCTGTTTCTCACTTTCATGTTTAATT
2664298
2664299
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TCTCTTTCAAATCACTTCAGTGGGGCTAGGATATACTTAG
2664362
2664363
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AAAATGAGCTTGAAAAAATCGAAAACGAACTCAGGTTAATGAG
2664429
2664430
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CCGAATTTACCTAGTGTTGTTAGCATAAGAAGAAGTAGGA
2664493
2664494
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CCAAAGATAGGGACATGGGAGGCGCTAGCGAAGTATAAAGTT
2664559
2664560
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TGGACCAGATCGATAGCCGGGATTATAATAGATTTAATAAT
2664624
2664625
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTTATTATCATAATAATACCAGACTTTTCGTACTCTTTCC
2664688
2664689
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATTCAATATTTTGTATGGAGTTACAGCCCATACAACGTTT
2664752
2664753
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AGAACTTCGCGGTAAGGCAAACATCAATTGCAGTTTCTAGT
2664817
2664818
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
GGGGTAGCAATGCTAATTTTGGGTACTGATGATTCGGGTAAA
2664883
2664884
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CAAATGTTTTGGGTAATGATATACCACAGCTTGTAGCCTATTT
2664950
2664951
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AGGGTGTCGATATACCTAACATTCGTTCATTAGTGTTAGCGTC
2665017
2665018
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATTAATTACTATGGAATCCGTGATATCCGGATAAGGCAATCCG
2665084
2665085
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTCGTTTCACGTCTTTCATAGTTAAAAATCAGTGTGAGAG
2665148
2665149
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
GTAAATGAATTGCCTGGTCTTCTCCACTCTGACAGTTGTAGT
2665214
2665215
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATAAGCATCCCGTTATTAGGACCTAACACTACTACAGTCGT
2665279
2665280
CTTTCAATTCCATTTATTAATTTA
CCGTATCCGCTTTTGCAAA
2665322
2665323
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CCAAAGCTGATGACTGTTAAACTCGAGTCTTCAGATCA
2665384
2665385
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AGGGCGGATTAGCAGTAAACGAAAGCGATTCAGTAGAATACGATA
2665453
2665454
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTTTACAATAAGAAAATTTAACAAAGACCTGAGACAGTTTG
2665518
2665519
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AAAAATTAGAGAAGCTCGCAGAGGATGATGCTGAGACAAA
2665582
2665583
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATGAGGTAGTGGACATGCTTCGCGATGGTTCGCTAATTTGT
2665647
2665648
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CAAGATGAAGTCGCATTAATTATAAGTTATCATGATAATGAC
2665713
2665714
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AACTCATTAACTGAAAAGCCAATTGATCATCTATAACAGA
2665777
2665778
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TAATATTAACAGTAATTTTTGAGTTATTAATGATATT
2665838
2665839
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AAAAATTCAATCGCTTGTTGGTCAGCTGAACCGTCATAATATTCCAA
2665909
2665910
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTACAAAACCATTACTTTGTAATGAGTGAGATAGAGCTCCAAA
2665976
2665977
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTACATGGATTGGAGCGCTAGATGCCGGCACACTAAAAGT
2666040
2666041
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATGATTGGTGGTAAAGCTGGGGATATTTTGGCTGGTGCTGG
2666105
2666106
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
GTATTCGAAACTTAATTTGAATATCTTCCCCTTAGGGGTAG
2666170
2666171
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTTACACTAGTAAACTTAGTTACGTTAGTCTGGAAGTTCTGT
2666236
2666237
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATTTGCCCACTCTTCCAAATATGATATAGATATCTGTTTTAAT
2666303
2666304
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CAGTTATATAGTAAAAGTTACGTCGAGTATGGAAAAAG
2666365
2666366
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TCTTTATTGTGCATGACAGCCTAAATAAATATGCTCTGACTA
2666431
2666432
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CACAGCTAGAAAAGAACAGAGTTCAAGTAAAAATGAACAAA
2666496
2666497
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
AACTCAGAGTAATTACAGTTAAACTGGATGAAGAACTAGTCCAA
2666564
2666565
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTGAACTTGGTGTACCGTTAGACGTCATAGACTTTATCCA
2666628
2666629
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTAAAATATTGCTTAAGCTCTTCCTCATCGTCAATAAAT
2666691
2666692
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTACCCCTAGGGTGTCTTAAGTCAATTCTTTTCCTATTTTTTT
2666758
2666759
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTCTAAGAGCTTAACCACAAACAAATTTGACATAAAATAAGATAAT
2666828
2666829
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TGGACTACAGTCAGTCAAAATCTCTAATTCAACATTTAA
2666891
2666892
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTCTGACCAGTCGACATGGAATTTTATAGTGAATAACAT
2666954
2666955
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
ATAGGAACTAAAGATCCCTGTTGATATTTTACTCCAGTAGTAGCAT
2667024
2667025
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
CTGCTTAACAAGTTAAGCAGCAATTGTAGAGTGTTATTCTT
2667089
2667090
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
TTCTGCTTTGTCTCCTAATTTTTGTTTTATTGGCAATTC
2667152
2667153
CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC
2667176
Left flanking sequence : Till position 2664097 (length
bp)
AAAACGGGATCCATAAGGAGGTATACCATGAAGGTGAAACTAATTTTTCTTTGTATATTATTTCTGTAGC
ATTAACTTGGACATGATATTGCGGTAGCTT
Right flanking sequence : From position 2667176 (length
bp)
TGATTGTTTTTATATTAGTTCTTATGTTATTTTCTTCGTTTCTGCTATATAAGCTTTTCTTTATGTTACA
TATTTATCATTACTGAATTTTTAGTATTCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp