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NC_003106_7
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NC_003106_7                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus tokodaii str. 7
RefSeq :
NC_003106 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_003106_7
DR consensus (24 bp) :
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
Number of repetitions :
105
Begin Position :
2671254
End Position :
2678042
2671254
GCATAATTTCCATTATGGATTAGC
ATTTTTAGAAACTTAGCTGTAAGAGAAATAGATGTTGTTTC
2671318
2671319
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTACAGTAAAAGAGAAGTACTAACGTTGATGAGGAAACAT
2671382
2671383
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACTTGTGATTGAATCTCGTATAATTTAAGCTTGGCATCATA
2671447
2671448
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTAGACTGAGTTAAATTGTACATGCCTAAAATATAATTAATA
2671513
2671514
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTCGATTTCATTAACAACTTTCCTGAGGAGGACGAGTTT
2671576
2671577
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAAGTGCTTACGATTTATCTGGAACCCCTCTCGTCGGGTGT
2671641
2671642
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAAGCTGCAGAGAATAGCTAGGTTAGTCCAGGGTAAGCAAACA
2671708
2671709
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GTTACAACTATTACAATTTTTGGAATTTTCTTCTACAATTAA
2671774
2671775
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGGGTCGTGGAAGTAATCAGAGAGACTTACTGCGAATACTGTG
2671841
2671842
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TAACTCATTTGTGTTTGTTAATAAGTTTTGACGTAGTCT
2671904
2671905
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GTACACTATCGTAGATTTTCCGTACTCATAATCAATTTCA
2671968
2671969
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACGCAAGTGCCCACGATACCTGGGGCGATGGCGTTGATGCAA
2672034
2672035
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CATCTTGCATGCTGCATACGTTTCATAAAAATGAGGATCAA
2672099
2672100
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CCAGAGATTGAATTAGCTGAATTATATTCTTTTACATGTAC
2672164
2672165
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CGTAGACGGGTGAACCGTAGTAAGAAGGACTATTAGTAGGTGCCC
2672233
2672234
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTACGTTACGAATCAGAATTCACAATATGTAATGTATGTAAA
2672300
2672301
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAGAAGTTGATGAGACTTATGATGTTAACATTTGGTATCAAAA
2672368
2672369
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GTGAGAGCTTTTTAATAAGTACTAGCGTATTCTATTTACCC
2672433
2672434
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GCAGGTAGTATTATGCAAGGTCCAATCAGGGTTATA
2672493
2672494
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TACCACTTGTATTGTTGTACTACTATTTAACCATAAAATTTCCATTA
2672564
2672565
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CAAACTTCTATTATTATGTTGTTTGGTCTTCAAGTGAC
2672626
2672627
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATTAATTGCTAATGTTAAAGGATCTTTCTCTTTAATTCTAAA
2672692
2672693
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAGAATAAAGATTGTTAGATTTCTAGTTTTCAACAATTGT
2672757
2672758
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAAGAATAATAAGTTATTATGACTACTCAGAAGTCGTGA
2672821
2672822
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATTGAATAATTGTAGAATCTTAAAGCTTGTCAGTCTATAGAT
2672887
2672888
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GGAAGATGTTATCCTTTTTTTAAAAGTTTTAAGATTTAGTAGT
2672954
2672955
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAGAGGAGCGGGCTTAACGGTATTGTAATTGTTATAAAAA
2673018
2673019
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TAAGATAAAGTCTATTTTTTTATCAGAATTTCCAGATGCTAAATTTG
2673089
2673090
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACATTAAGATATATTAATATTGCCAAACTTATGGAAAGTAA
2673154
2673155
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATTCTTCTAATTCTTCTAACATAGATATTAATAAACTCAA
2673218
2673219
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTGCTTATTTTGTAGAAAAACTCTACAGGGAGGGAAGAGCGTTA
2673287
2673288
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GCGAATGCTTCTTCTAATTGGTATAGTGTTGTAATAAA
2673349
2673350
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GGGAGTCAGTAATTTTGCCTAAGCCATTGCACGTATAAG
2673412
2673413
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACGCTTAGACCAGATAGAAAAGAGACTCAAGAAGAAAA
2673474
2673475
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATATAATGATTGCGTCCAAGAAGTGGCATTAGATGATGT
2673537
2673538
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTGCAAATAGGGAAGATGCAGTAAAGTATTACATTACATT
2673601
2673602
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAGATTAAAAAGTTTAGAAGTATACCTTAATTATTAGTTTT
2673666
2673667
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCATCTGTGGAATTTGTAATTGAGGATAGCTAAAGTT
2673727
2673728
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AATGAGTTATGAAGAAGTTTGTTCTTTTATAAAAGAAAAAG
2673792
2673793
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTCCTTTCTCTAGTCCTTGCCCTATCAAACACTGTTATAAC
2673857
2673858
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AATATGAGGATGAGGTATCTGAGGGTAGCGCTTACAAGGCT
2673922
2673923
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AATGTTTACGGTAATACTTATGAGTATACCAGTACTAC
2673984
2673985
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTAATACTTATTATAGCTACAGTTATTATTGCCCTTATAGTTATA
2674053
2674054
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTATTTTTCTAGATGGTGGAAACGGTAAGGCATAATAGAA
2674118
2674119
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TACACTTAACGATATCCCAATTTACAAAATAATAAA
2674178
2674179
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CACCCCTCAGCAGTACTTAGCAGCAGTCAGCTCTCTTAA
2674241
2674242
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTGGTGCACTAACGGGTGCTGTGGTAGGTTCATTTGTTCC
2674305
2674306
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTGTTGTGTTCTCTCTCTTTGCGATCTCTTCTAGTTTCT
2674368
2674369
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAATTATGATCCTTCACTAGACCAAAAGGAAGAAGAC
2674430
2674431
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GACACGATAAATCATTCCGATATTAACAAAAAAATAGAT
2674493
2674494
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TATCGTTTTGAACTTTGCATGGACGGTATGTATAACTCTAA
2674558
2674559
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATTTTTAACGTAATTTTGGCTCAGAAAGACGTGACAAAAATGG
2674625
2674626
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGACTTATTAGAACAGCTAGTGTATGCTATAAATCCAAACA
2674690
2674691
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATTATCTCCACATGATATACGCCGTAGCGGGGCATATTGG
2674754
2674755
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TAGAAACTTAGACGAAATAACAGAGAAATACGATATACAAC
2674819
2674820
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGACATGAAAGCGACAAAACGCCAAATAGAATTAATAAAG
2674883
2674884
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CGATTATTTATATATGCTCTTTGTGCTGTCGGCAGTGAG
2674946
2674947
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTGCCAGCTTACTCATCTTAGCCCACCTCCAACAACTTA
2675010
2675011
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTTCTGATTACGATAGACCTTTCCAGTTTATGTGTGTTACAAT
2675077
2675078
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAGTCAAGTGAGCCTCTGTTCCTTAAAGAAAATACAATG
2675141
2675142
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACTTTATACGTATCCCCGCTTGTCGGCACCTTAACTGATTCT
2675207
2675208
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAAATAGCACCAGGAAGGAGACTATACCACCGGGTTATGAT
2675272
2675273
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GACCTCAGTTTAATGATATGACCTAGTTTTTACTTCCCAGTTAACT
2675342
2675343
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTACTACTGATGATGGGAAAGCGTCAGAAGGATCTAAATTAAC
2675409
2675410
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AACTGCCCTGAGCGTGATGTTAAACTCCCCAGTTTAATAG
2675473
2675474
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTGGTGAGGTTAGAATGCATGATGTAATACGTTTAGGAGAA
2675538
2675539
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GAGACTGATTACTAGAAGAATTAAATAATTTTTGCATATCTTG
2675605
2675606
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATCTCATGTTGATATTCTTCTTTAGCCTTCTCTAGAGCCATTTC
2675673
2675674
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTGCTCTGGTACTAGTACAACTCTCTTTTGCCATCT
2675733
2675734
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TACATATTTCTGCTGTAGCTGCCATTTATATCATCTTACTT
2675798
2675799
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACTATTACTCAAAGTATCCGTGATTATTATTACAATCAA
2675861
2675862
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATCGCGGGCTGCTGGGTCAAGTTCAGACATGTGATGAGCGTAA
2675928
2675929
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTATTATAGAGAAGAGATAGTACTTTTGCTTCTGGAGTT
2675992
2675993
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TAAAAATTTTCCAATTTGAGGATTTCTATCATACTAAATATAT
2676059
2676060
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTGGAGAACCACCCTGAGCTTTCCGAAATCGTTAACAATACG
2676125
2676126
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTCTGCACTAGAAGAACCATGCTCTTTATCAGAATTGT
2676187
2676188
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AGCCAGCGAAGGATATGCAGTGATCGTTCATCATACTGAT
2676251
2676252
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CCCTCGCTTAAACAGAAACTGTTAGAGCAAGGCATAATTACAGA
2676319
2676320
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTAAAGGCGGTGCACCGCTACCCCCGTTTGCGGTAATGTAAAA
2676386
2676387
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGTTCATATTTCATATTTGCAATCTTCAAAATTTCCATAAA
2676451
2676452
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AGCACCGAGTATAGCACCTTCATTAGCTTCCTGAAGGACCTG
2676517
2676518
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATAAACCAAAGAAGTGACATTTACGAATACTACTTTGAGTT
2676582
2676583
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CCAAAACTAATGAGTATCATAATCGAGTCACCAGATCAT
2676645
2676646
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CACAGGTATCGCGAGGTCAGGGTTTGCTTTAACGAAATA
2676708
2676709
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCTGCATTGTGTTATGATAAATACGGTCAGCTTGCACGAGT
2676773
2676774
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AAAGTTGAAGTAAAGGTTGTTAAATCATTAGAAAAATTGCCTA
2676840
2676841
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CTCTATCCGGAAGAGTTTGCTAAGATTGACGAATTTTGTAG
2676905
2676906
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGTTCAAGGAGAAAGCAATAATCAAGGTAAGACAAACTGT
2676969
2676970
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TACAGTCCTGTCGACGTAACATTTCGCTTTGCGTAAGCAATACTGT
2677039
2677040
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ATCGGTAACTCATCATAATAAGTAGCATAAACTACTCCA
2677102
2677103
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGT
ATAGTCGTTATCTATAGCGTCCTGAATCCTCTCTAAAGCGT
2677167
2677168
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
GAAATCCAAAGGAGAAAGGAGAAAAAAGCGGAAATTTTA
2677230
2677231
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AACCAGTTTGAGGAGTTCCTTAACAAGTTCATCTTCAGAG
2677294
2677295
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
CGTTCATTTTATTAGGGCAGTTGGGTATACACAAGAATTATCA
2677361
2677362
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACGGGGTATATTGTGATCTGGTTCTGACAAAGACGTTGAA
2677425
2677426
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
ACAAGGAGGAGTATCTCGAGGTTGGGGAGGTTCATATAGTTA
2677491
2677492
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AGAGCTTGATTTAGAAGGAAAAATATGGTTGTATAATATAAAATG
2677560
2677561
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AGATAGCATAATCATAATTTAGATCTTTAGCATATTTCATTA
2677626
2677627
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
AGGGAAAGGTTCAGGTTTAAGGCTTATATTTCACCGCTGAA
2677691
2677692
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TCAAATTGGGACACAAACCATAACCCCAACAATTGAAGATAA
2677757
2677758
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTAAGTAGATATTCTGCCGCAAAATTCCTATGACAATAATGTTTT
2677826
2677827
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TAATTTTGAGGGCGAAAATCGTAGGGGATGAAAGATATACG
2677891
2677892
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TTAAAATATAAAGACGTATTAAAGCTAGACGGGAAGA
2677952
2677953
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
TGCCAATAACTATGAAATCAAGATATTTGACAGATGGATAAA
2678018
2678019
CTTTCAATTCCATTATGGATTAGC
2678042
Left flanking sequence : Till position 2671254 (length
bp)
TAAGAAGTATATAATTTTAGAAAACATAGTAAAATAATAGATAACCATTGAGATAATTTTCCTTATTCAG
AATCTTTTGTTTATTGGAGCTTTTATTTAT
Right flanking sequence : From position 2678042 (length
bp)
TGCAGATTTTTATACTATTACTATTATTGTTTTCTTCGTTTCTGCTATATAAGCTTTTCTTTATGTTACA
TATTTATCATTACTGAATTTTTAGTATTCC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp