Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_003106_8                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus tokodaii str. 7 RefSeq :NC_003106 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_003106_8
DR consensus (24 bp) : CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCNumber of repetitions :122
Begin Position : 2684986 End Position : 2692869

2684986CTTCCAATTTCATCGAGGAATATCCTTACACTACTGCGACTTAGGCTAATGACGTTAATGCTCTAAG 2685052
2685053CTTTCAATTCCATTGAGGATTATCGGGACAATATACTATTTACAAATGCCACTAGCATTGATTT 2685116
2685117CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATTTTCAATTACTAGTACAGCACATAGTGACGGAAATTATAC 2685182
2685183CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGTAAAAATCCCGAGATAAAGCCTATCATTATCAAATT 2685243
2685244CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGTTGAATATTAATGGTAATGAAAATGCTATGTATGCAGTAAG 2685309
2685310CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCCTTATCCTAGTGACAAGAATGCTCTTTATATAGTAAG 2685372
2685373CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAACATGCTTATAGATTTGGTTGAACTTATATGGTAACTGCGA 2685438
2685439CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAGTGTTAGTTGTTATAGTACTCGTAGCAGATATTGTTGCTG 2685504
2685505CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGTTCCTTTGACTTCATCGATTAACAAACCGCTATGATCTAA 2685570
2685571CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAAAGAAAGAAAAGAAGTACAAGGATTTTGCAGTATTACCATTTAATAAT 2685644
2685645TTTCTAATTCCTTCAGGTATTATAGGGAAGTACAAGGATTTTGCAGTATTACCATTTAATAAT 2685707
2685708TTTCTAATTCCTTCAGGTATTATAGGGAAGTACAAGGATTTTGCAGTATTGGAAGA 2685763
2685764CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGAGGGTGGACTTCCCCGTGTTCGATTCGCCGTATAATATTAAATAT 2685834
2685835CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAGTTAGTCCCCGATTCAAAAGTCGTTGAGGAGCTACTTCG 2685898
2685899CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCACCAAAAAGGATCCAACCACCATCATAATCCTCAGAATCTGT 2685966
2685967CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTTTAACACTTTTTTGTTTTATCATACACCTCACCCTATT 2686030
2686031CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCGAATCTTTTATTCGTGTCAAAAACCGTGCCGTCTAGGTCA 2686095
2686096CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAAATATAGGAATATATCCTAACGTCTACGTTCCCCTCCGTA 2686161
2686162CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCACGGGACTTTCTGGGCAACGACACGTTTTGGTTCAGAACG 2686225
2686226CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTGGGTATGTGTTGAAGTACAGATACGGGTTTGGGGTT 2686287
2686288CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCAAATTTTCCATAAGAACTATTCAACATCAGTTTAGCTAA 2686351
2686352CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAAAATACGCTATCAAATTGCCTAAGCGTCTCAATTACATT 2686416
2686417CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTCTTAACGAAACTGAATCCAGGGGAACAGTTACGTTTAT 2686480
2686481CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCGTTATATGAAGAATAAGTACTATGTTGCGACTGTAAAAC 2686544
2686545CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCCCTCTAGTCCACTCAAACGTCCATAATGCTGCAATTAA 2686608
2686609CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCAGGAGGTTTAGGTAAGTTAGTTAAGTCAGTTAGTAGGTA 2686672
2686673CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAAAAAAGCTCTACGTAACTGAAAGGGGCTTAATAATTGCTA 2686738
2686739CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCAATGAGTGCTACTGTGCCGTTTGTTGATGATATATCTAGT 2686803
2686804CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAATCCCTTGGCGGGAATTTTGGAAACCTAGAAGATTCAAGAAT 2686870
2686871CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAATATTTTTCTTATCTGGCAATACTTAAGAAATTGAGAATAT 2686936
2686937CTTTCAATTCCATTAAGGATTTCACATCTGAAAACGTTTGCTGGTGTCAAAGGTCGTTCCGTCA 2687000
2687001CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCTATTGCGTGATCCACATAATCTCTAATCTCATATAGCA 2687064
2687065CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTTATTTTTCTAAGCGTTTAAAATTATTTCGTTATTTATAGA 2687130
2687131CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCACAGGCGGAGGCTTTAGCTTTGGAGGCGGGAAAGGAGGAAG 2687195
2687196CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAAATGTAAAAGTATATGACATCTTTGTCACACCAGGTGA 2687259
2687260CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTTTTTTGAACTCATTATAAATAGAGACTGGTACCAAAA 2687322
2687323CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAGAAAGTTCTAGTTATGAAATAACAGAGGTGTTGAAAAA 2687386
2687387CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTACTCAACTAAAGAGAACGTGGATAAGGTAATAATAAA 2687449
2687450CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTAGGAGTGGGCTTTTAAATTTCTATCCTTCAATTTCTGA 2687513
2687514CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCCGTATTGATTTGCTGTCTCCTCCTCCCTTCACCGATACCG 2687578
2687579CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTTGTAATGCGTATATCGTACATAGAGCAAAAATGGAGAAAC 2687644
2687645CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTAGCGTGATAGACGATATCTTAAGTGAGGCTAGGAAGTAC 2687709
2687710CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGTATACGGAAATATTGAAGTTACAAATGGCGTAACAAAAC 2687774
2687775CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTATACTCTTTGAAACACATGGCATGTGAAAAAATT 2687834
2687835CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAGAAATATGAAGAACTGTTAAACGAGTATAACGGGTTAA 2687897
2687898CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGGAATGTGGCACCACGCTGAGATTATCATCAACAATAAT 2687960
2687961CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGGGATATTACATAGTTCAATAATAAATTAAGGGAAAAACTAT 2688027
2688028CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCGGTCTGGATTAACATTTAGTGGTTGTATGAAAATAAAAAA 2688092
2688093CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTTCTATCAAGTCAAGTACTGACAAATCAACTACAAATCTGAA 2688159
2688160CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATTATAGTAATTGTTTTAGTAATCATTTTGATAGCTGTGAT 2688224
2688225CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCCTATAGGTGTTACAAAATTCAGCCCCTTCTGATGGGGAT 2688288
2688289CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTTGATCTACTACCAGTTCATTTATTCTCTCAATAAAGAA 2688352
2688353CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAATCGTTCTTCTACGTATACGACAGTTTGGGACTTCATAG 2688417
2688418CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTATACTTCCTCCCCGTCAGAAGAAAATTTAGACGGGGGGATAG 2688484
2688485CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAAATCGTTGTAATAGACGAGGCACATAGAATACTCGCTAGAA 2688551
2688552CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAGGAAGACTGGGGAAATATTGATTCTGCAGGGGAGGACAAAG 2688617
2688618CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATACCGTCACGTAGTAAACGTGGCTTAAAACATTACACTA 2688681
2688682CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATGTCAGTATTTTGAACTCTGTCCTTAAGGTAACTTTGTC 2688745
2688746CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGGTTTCCTACTTTTACACCATCTTTATATAAAGATATAA 2688808
2688809CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCACGACCTGGTCTTTTTACCGCATCACTCAGGCTTTT 2688869
2688870CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTAGAGAAGGAAAGAAAATCTATGTAGAATTAACAGAGAA 2688933
2688934CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGGAACGTGGACATTAGGATATACAGTTACATCTATTTCTTTC 2688999
2689000CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCACACGCAGATATTATGCTTCTTACAGACGTGGTCAAGAG 2689062
2689063CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTATCACTCAACGGAATATCGGAATATGAATCAAGAG 2689123
2689124CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGGGAATGTTTCGTAGACGTCGTAACGTCTGACAAAGTGAGAT 2689190
2689191CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAACTTATGCAAATCTCATCTATGACGCGAGAAATAATATGTA 2689256
2689257CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAGGAGTGGAAATATAGTTTTGACTCAGTGAGGGTAAATGTGTA 2689323
2689324CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGATTGTTTTTATATTCACTTGGTATAAAAGAATATTGTACAAATTTCTCAAT 2689400
2689401CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTATCGCTGGAATAGTAGGAAATATTCTCTCACTTTAT 2689461
2689462CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCAAAAAATTAGTTAGAAAAAACTGACTTAAGAAATAGTCTTATTAA 2689531
2689532CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAGTGTTAGATAGACAGATCGGTAGTAAAGTGCCTGTCGTATTCG 2689599
2689600CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTATTGATGCTTTCGCCATTGAACCTATAGACGAAAAGAAGATCA 2689668
2689669CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATACATAATACATAATAATCAGAAAAAGGGCAAAAGAGCATGAT 2689736
2689737CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGGAGATAGTTGAGAGTTATGATTCTGATACTTATGCTTACC 2689802
2689803CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGTAGCTGGATTTCTAGGGTACTATTTTGCACCAAGCAATA 2689866
2689867CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTTCTCTTCAGAAGAACAGAATTGAAGTGAAAGCGAAAAG 2689930
2689931CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAACATTTTCTGTAACAATTGTATAACAATTGGTTATAATGA 2689996
2689997CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTCAGCTTATCTGAGTACTTCAAGAAAATATCGTTAAGCCT 2690061
2690062CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGAATATAAAATCCAATATCTTAAAGTTGTAGTTATAAATCATGT 2690130
2690131CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGAAAAACTGAAAAATGACGGTTGGGAAGTAATTTGGACTAT 2690196
2690197CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAAGGAATTCTGCAGAAATTTAGACGAACTTAATCAAGTAT 2690260
2690261CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTATCTTCTCTAAAGGACCCACGTAAAGATACCTTAACTT 2690324
2690325CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGGAAAAAAGTCTTATAATAATCATCTTTATAGTAGT 2690385
2690386CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTGTTCATAAAAGAAGTAGTGATGGCAAGAAATCCTATACT 2690450
2690451CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAACGGGTTAAGCCCAACAATGTTCATAACACCAGCAAATGTA 2690516
2690517CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATCCAGGCTTATATGCGAGGTGGCATTTAGAGGGGTTAAAA 2690581
2690582CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCGCTGTAATAGGTGCTAGGATACTTACTAGACAACTTGG 2690645
2690646CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAAATGCTCAAATACTTAATCTCTCAGCGTGGCCTAAAT 2690708
2690709CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCACAACCAAAATGATCTATTTACCAATGTGATACTCATAA 2690771
2690772CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTAATTATCATCAGAGAAAATTAGCAGAAATGAATGAGAGAAACG 2690839
2690840CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGTTCCCTTGACTTCATCAATTAACAAACCGCTATGGTCAAG 2690905
2690906CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCAAACACGTCACCCTCAAGGTATGCTGGTGATTGTAATGA 2690970
2690971CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGAGCGGGTACACTAAGAGGGAAATAATAGCAGTATTGAGAAAGCA 2691039
2691040CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTAGGTACAGTGTCTCAATTGATAATCCCGCTTATTTTAGACT 2691106
2691107CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATCTGACAAAAAAAGAGAGATATTCTATGATATTTGTTGT 2691170
2691171CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCTATTTTATCGTTTGTCAAAACTTCATCGAGTGATAT 2691232
2691233CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATATCTAATGTGTTGCTTTAGTGATACTGACGACGAAAA 2691295
2691296CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCTATACCCGGAAGAGTTTGCTAAGATTGACGAATTTTGCAG 2691361
2691362CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGTATATCAGAAAGTTCTTTGCGACACAAATGCTAAGTTT 2691424
2691425CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTAATTCCATTTAAGCAACAAATTCAAACGTTTCTAGAGTC 2691489
2691490CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGTTTAATTTTTTCTGACTGGAGACCGTCTAAGGATTATGT 2691553
2691554CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAATAGCCTAATGAGGTGAGGGATATGAAGAAAAGGAGTT 2691616
2691617CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCGAGAGGTCTGTCGTCATAAGACGGGCACTCTCGGAATTCTTG 2691684
2691685CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCGTTAATATTTCAGCAGTTTCCGGGACAGTGTATTTG 2691746
2691747CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGAAAGAGCTGAAGGACTTAGATAGTTTAGTAAATATTGTTAA 2691813
2691814CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCACGATCTCGTCATAGATTCCTCCACGTAATAATAAAAAG 2691876
2691877CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTGACCAGATGACACTTTCATTACCATCATCAAGAGCTGTT 2691941
2691942CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCGCAAAACCGTAATAGATTTCGAACTTCCTCTTCTGCCCTTT 2692007
2692008CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGAAATAGCTAAGTACTTTGATAGTTTCCCCTTCTTGCTCA 2692071
2692072CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTGATAGGGCTTTACCTCAGCCATGATAAGTTACCTTATTTTT 2692137
2692138CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCGGTGGAGGAATATCTGGAAGCACTCTATTCTGGGTTGCAGT 2692202
2692203CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCCGGTTCTAGCAAACCCTCTACCGCTAACGTTTCCAAGAAA 2692267
2692268CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCATAACACAGTTGTTGAGGAGTGCTGCTGAATTGGAAAGC 2692330
2692331CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCAGAGGTAGGAAGTAAAAAAAAGATATTCAAAATTACAGAAAA 2692397
2692398CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCCCAGCGAAAAGCCTAGACACTCCTCGAACTGCTCTACCAA 2692462
2692463CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTCAGCCTCCTCAGGTTTTATAACAATTTTGGTTGGCCC 2692524
2692525CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCTTATGTCAGTAGTCTTGACATTAAAATTAAGATGTATGA 2692587
2692588CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCACCAGTTCCGGAGCTAGTTGACGTTTGACCGCCAGTTCC 2692651
2692652CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTTTCTTGAGGTAGACAAACTCTGAAATATTTTTAAACTT 2692715
2692716CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCCTACAGAAAGCTAAGATGATAAGGGCCTACCTTATTGT 2692777
2692778CTTTCAATTCCATTAAGGATTATCAATATCATATTAGGGGATTTTCCCTAACTCCTCTCGTAAAAGTT 2692845
2692846CTTTCAATTCCATTAAGGATTATC2692869
Left flanking sequence : Till position 2684986 (length bp)
TTCCTATTTAGGGATAGGGAAGAGTAGGGGAATAGGCCTTGGGGAAGTTGTGGTTAAGATAAAAAGTTAA
TCAGAAACCTCTGAGACCTAATAACTTTAT
Right flanking sequence : From position 2692869 (length bp)
TGATTGTTTTTATATTAGTTCTTATGTTATTTTCTTCGTTTCTGCTATATAAGCTTTTCTCTGTTAAAAT
TACCGAATGCATATGTTTCGCACAAACGTT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp