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CRISPRs details
NC_003413_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_003413_5                                                                                                                 
top
Strain :
Pyrococcus furiosus DSM 3638
RefSeq :
NC_003413 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_003413_5
DR consensus (30 bp) :
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
Number of repetitions :
31
Begin Position :
623119
End Position :
625176
623119
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
AGGTGGTTAGACGGGTGGTTTGCTGGAGACTTAGGACT
623186
623187
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GCAGTCCAGTACAAAGGCACAATTCTCGGTGGAATACT
623254
623255
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CTCCTTACAATAAGCTCACCGTTGCTGATGTTGTCGGC
623322
623323
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TTGTAAGGAGACCAAGACCACAGGTTTATAGGGGACTCA
623391
623392
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
ATGGTGATTATGGCGACACTATTGAGTGGTTCGTT
623456
623457
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
AGCTGAGAAGGTGTCGAGGGATGTGAAGGCTAGGT
623521
623522
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GCGGGAGCAAGGTGTTGCAAACCTTGATAGAGTTCCA
623588
623589
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TGGGCATTGATTTCGACATTGCAAAAATTTTTCATTGC
623656
623657
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TCGGAGTTACCGATTGCTGAAGTAAATGAGAGATTCAAGATA
623728
623729
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GTTGTTAATGTATTCGTTGAGGCAGGGAAGTATAAGG
623795
623796
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GACTTTTGTATTACAAAATCAGCGTAGTTTACTATCAG
623863
623864
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
ACAAACACAGAAAAGAAGCCAAAGTTATTGAGATTA
623929
623930
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TAGCTAATGTCCATGAGAGTGTGTGAAAAGCTAGTGAA
623997
623998
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GCCAAGCTAGTTATTGATGTGTTGCATACCGTATACAC
624065
624066
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GCCAAGCTAGTTATTGATGTGTTGCATACCGTATACAC
624133
624134
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TATTCATGGCATGTGGCAATGTTTCTTGATAGGGCACT
624201
624202
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CTTTCTTTGCATCTTTTGTATATCCCTTAGACCCAAATCT
624271
624272
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TTAATTCTTGGGAAAAACAGGGATTATATTATCCAC
624337
624338
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
AGGAACGGTCTCCAAGAGGACTTGGCGAATTACGTGAC
624405
624406
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TATTTTGTCCTACTTTGTATGACAATGTCTTATGTGG
624472
624473
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
ATATAATAGGTATGTAGATAAATCACCCTCTGAGAAGG
624540
624541
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CGAATTCGATAGATTCGAGAAGCTTGTAAGGGTAGAGA
624608
624609
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CTATTATATATACAGATGTCTTGCATTATGATGCTTA
624675
624676
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CGCTATGATATGCTGACGGATGAGGAGTATGCTGAGA
624742
624743
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TGAAAATAGTGGACGTCATCCCTCCAAGCCAAGTGCCT
624810
624811
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
TATGACTCTGACACAGGTACTAAAATCGAGGAGTTCC
624877
624878
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CACAAGCACTAGTCCTGCTAGCGTTTTCAGGAGTGGT
624944
624945
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
ACGAGCATTAGGACTGTGTTATTGTTTTGATCTTTT
625010
625011
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
GTGAGCGCCCTCAAGTACTACGTGAACCATTCCCCTT
625077
625078
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
CTCAATGCAAAGGGCTCACCGCTGCTGGTGAGTATGGTC
625146
625147
CTTTCAATTCTATTTTGGTCTTATTGTAAC
625176
Left flanking sequence : Till position 623119 (length
bp)
ATTTTCTATAAACTTTTTTTAAAGCTTTTGAGGGGTTTTTAGAGCTAAATACCTGCTTAAGTGCTTAAGT
AATTTTAGTGTAAGGCTTATTGAAAGCTTT
Right flanking sequence : From position 625176 (length
bp)
AGGGGGCTTTTTCGCCCCAATACTCCTATGGAGTAATTATATCACTTGAATTTATAACCCTTACGGGGCA
TCCAACTTACCCAGCAACCCCCCATTTATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp