Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_005877_3                                                                                                                 top


Strain : Picrophilus torridus DSM 9790 RefSeq :NC_005877 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_005877_3
DR consensus (28 bp) : CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACNumber of repetitions :17
Begin Position : 61415 End Position : 62557

61415CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACTGAGCTTGATAGGGTTCTAAAGGATTTTAGAATAAAGCTTCTT 61485
61486CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACCTGATATTCGCCATAATAGTTCTCGTTGCCGCCGTTATCTTTATC 61558
61559CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACCCACATGCAAATCTATGTTGCCGTCAAAAATTACATTGAGAGCAAAAA 61634
61635CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACATCAAATCAGGGCACAAACACCTGATGGACGGTGTCCAC 61701
61702CTTCCATACTATCTATTAATTCTTAAACCTTTAAGAGCCTGGTCAATTCTCCTATTTCCGGTGATT 61767
61768CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACTGACAATAAAGGAGGTTGATTAAAATGATATATAAAAATTG 61836
61837CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACATACAATGCAATTTTTTATTCGGTCATGATTTTTTCATTATC 61906
61907CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACCCACATGCAAATCTATGTTGCCGTCAAAAATTACATTGAGAGCAAAAA 61982
61983CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACACATTATGTAAAAATGTCTGAGACAGATCAGAGAAGATCAT 62051
62052CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACAGGGCGAGGTTGTATTAAGAGGTACGCTTTACACGGAGTTA 62120
62121CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACCATCAAACAGTTTGGAAACGAAAATAAGATAATGTATGA 62187
62188CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACATAAAGTCTCGAATATTGAGGTCAAGCCTAATGCTTCCACG 62256
62257CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACCGTAGAATCAAAAGAAGACGGCAATGGCGGTTATGTAG 62322
62323CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACTAGGCGACATCGTAATAGACATAACGGGAATAACGATGG 62389
62390CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACAATGATCGGGGCGAGCTGTACAGAGCGTATAATGAATGG 62456
62457CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAACTTAGATAAATATAAATATCCATGTCCCGTGTGTGGTAGCCTAAAA 62529
62530CTTCCATACTATCTAGTAATTCTTAAAC62557
Left flanking sequence : Till position 61415 (length bp)
TATATGATTCCTGTTATATAATCAAATTTGTATATCTTACTAACCATTATAGCAATATTTTATTTGTTAC
GTAAGGAGTTGAGCGAAGTTAACTAAAAGA
Right flanking sequence : From position 62557 (length bp)
CCGTTACTAAAAAAATAATGTAAGATGGATATATAAACGTTCTTCTCCCAATTTTTATAAATTATTTAAA
AACTGTAAAAATTGTATTAAAATTCAATAA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp