Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_006449_1                                                                                                                 top


Strain : Streptococcus thermophilus CNRZ1066 RefSeq :NC_006449 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_006449_1
DR consensus (36 bp) : GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACNumber of repetitions :42
Begin Position : 625101 End Position : 627844

625101GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAGAACGTATTCCAAAACCTCTTTACGATTA 625166
625167GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTAACTGTTATCAAAATGATAAGATAGTCT 625232
625233GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCGTTGATGTTTATTCAAGTAAAATAATTAA 625298
625299GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCCTTTCACGGGTAGCACACTAACATACAC 625364
625365GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGTTGGCAATGCAAACAACCTTTATGAACCG 625430
625431GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTATTTCCTTGCGATAACGTTCCACCTTT 625496
625497GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAGATTATAAGGAACACAACCAACTATATAG 625562
625563GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACACGACATCAAGCTGATTGTCTTCTACATAA 625628
625629GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTGGAATACTGAATGTTTTACTGAAAATC 625694
625695GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACACACCACTATCTTTTCCTCCTGAAAATGAA 625760
625761GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGTAATTCCACGAAATTATCAACCTTATGCA 625826
625827GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTGGAGGATTGCCCCATATTCCCAAGAGT 625891
625892GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGAGAGGCGTTAAATATAGAAATGCAAGATT 625957
625958GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTTAACGTCATCAGTCCACCGCCTTAAAT 626023
626024GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCACCTCTTTCGATGGAAAGGTATCCTTCTA 626089
626090GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGACCAAAGTTTGATTATAGAGCTATACACC 626155
626156GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACACCATCATTCTTACCATTACAACTGTAATG 626221
626222GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATACGAATTCGGTTCGCACAATTACAATTC 626287
626288GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTATCAACGCAATCATTACAACAACTTCAAACA 626355
626356GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATCTACGTGTCAATACATATCACAAAACAG 626421
626422GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATTTTTAGAAATTTCTGATATAATAATGA 626486
626487GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTGTTGGAACAAGGACGACTTGGTAAACTA 626552
626553GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCATATTAAGCTGACTGGGCCTAATGCTTTT 626618
626619GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTCATAGCATACCGTAGTTGTAAAATCTAT 626684
626685GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACATTTAGGGAATGAAATTGATAAGACTG 626750
626751GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACATGAGAAACTGTAGAAAACAAGCAATA 626816
626817GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGGTGAAGATGGCAGTCATAAATGGCACATT 626883
626884GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAAGGGTTGAAAAATGTTGGTATATCAAACG 626949
626950GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTCTGGTAGTGGATTTAGTCAAACAGATGT 627015
627016GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTCCATAGAGCGTCTTAAACAAAGAATAGTC 627081
627082GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGTTGGCAATGCAAACAACCTTTATGAACCG 627147
627148GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACCATATTAAGCTGACTGGGCCTAATGCTTTT 627213
627214GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTCATAGCATACCGTAGTTGTAAAATCTAT 627279
627280GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACATTTAGGGAATGAAATTGATAAGACTG 627345
627346GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACAACATGAGAAACTGTAGAAAACAAGCAATA 627411
627412GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGGTGAAGATGGCAGTCATAAATGGCACATT 627478
627479GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTATGATTGAATGACATGGTTGTATAAGTA 627544
627545GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTTTCTTTAGGAATACCAGGGAGTTCAGCTT 627610
627611GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACTGGCAGAGATTACACAGCAACGGAAACAGC 627676
627677GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACGGGTATCATTGTATCTAGTGATGGACCTGA 627742
627743GTTTTTGTACTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAACATTTGAAAAATGCACAACAGCGTTTGATAG 627808
627809GTTTTTGTATTCTCAAGATTTAAGTAACTGTACAGT627844
Left flanking sequence : Till position 625101 (length bp)
GGAACTATTACATAAATTTTTAGAAAGTAAGGATTGACAAGGACAGTTATTGATTTTATAATCACTATGT
GGGTATAAAAACGTCAAAATTTCATTTGAG
Right flanking sequence : From position 627844 (length bp)
TTGATTCAACATAAAAAGCCAGTTCAATTGAACTTGGCTTTTTAAAATACACGATAAACATAAGGATTGT
CAGGCTGACTAACCTCTTTAATCTCAGTCA

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp