Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_007181_1                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus acidocaldarius DSM 639 RefSeq :NC_007181 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_007181_1
DR consensus (24 bp) : GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACNumber of repetitions :133
Begin Position : 1650669 End Position : 1658594

1650669GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTGGAATTGGGCTAGCCCTATTTTTCTTGATA 1650728
1650729GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGTTGGTAGTGGGCAGATATCTAGCCCTGACCACT 1650787
1650788GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGATGTCGAATACCGGAGTCAAGATGTTGATGAAAA 1650847
1650848GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAATAACGAAGATTTAAGTGGTTTTGAACCAAGAGAA 1650908
1650909GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGATCACATGTTTTATCGGTAGTACATAATGTAGAAA 1650969
1650970GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAGGAGTTTGATAAACTTTTGGAATTTCTTGAGAG 1651028
1651029GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAAATATAGCAAGAGTTCTGTGGTCGCTATATTA 1651086
1651087GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAGCACGATATTTCATCATCACTGCAGTAATC 1651147
1651148GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTCAAAAATATAATGCGTAAGCTTAAATACCCAAC 1651206
1651207GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTTTATTCTATATTTGAATAAAGCATAAAGTAATC 1651266
1651267GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTAATATTAATGGCAGTAGAAGTCTCGAACAACAC 1651325
1651326GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCTCGCAATAAATGAGAGAGAGTCGGCGAGTGT 1651384
1651385GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATGTTTGTTGTATTGCTAGCGTAATATTGTATTACA 1651445
1651446GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACACAATATCTTAGTCATTACTGGAATGACTACAAC 1651505
1651506GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAGCACGATATTTCATCATCACTGCAGTAATC 1651566
1651567GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTAGTAAATTGATATAATCGGATTGAAGAGAGTG 1651625
1651626GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGGATATCTGGAAGTAATACACCAGTACTATAC 1651683
1651684GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCCATTCAACTCAAAACTTATAGAAGATTACGAAATA 1651744
1651745GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCAAATGCTAAAAATAGAAAAGGTAGGAGAGTTATTA 1651805
1651806GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGGTCTTCCAAAATTACTTAATGCTCTTGATAATAAA 1651866
1651867GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTGCTAAGGCTAATTTTGATCGATAAAGATGAAGAAGAAAG 1651927
1651928GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCTAACCCTCTCTTTTTCAACTCTTTGAAGATAAAA 1651989
1651990GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCTCCCTGATATTCACCTTCTCCATTTCCTGTAGCAA 1652050
1652051GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCAACTCTCAATTACTCATAATATTCAAACTAAAT 1652110
1652111GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTCCGACTTGCTTAAATTCAGCTTTTTTGTACAA 1652169
1652170GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAGTAGTAGCTCCGGCTGTCATTCCTAATAATAT 1652228
1652229GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAATGATATAAAAAATGAACAACAGAATATAAAA 1652286
1652287GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACAAGAATTGATGAAGTATTCAAAAGAGCGATATGAA 1652348
1652349GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTCAGAGGGCGAGATCGCAGAGTACTTGAGAATAGCG 1652411
1652412GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTTCTGCAAATGTATAATACATCAATTTTATAAT 1652470
1652471GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCATCAGCAATTATGGAAGTCGCTAGATATTACTA 1652529
1652530GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGAATGTGTACAACAGCTATAAAAAAAGAAAGAATTGT 1652592
1652593GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGGAATATCTTGCGAGGCGAGGGTGAGTGAACCT 1652652
1652653GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATAAAAGGAGATTTCATAGACTCTATTCTCAAAA 1652711
1652712GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTGTTCTAGAAGTGGCGCATTAAACGGCAGTTTTTG 1652771
1652772GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAGAGACAAAATTTCCAAGTAAGTGACTCTGAAAATT 1652832
1652833GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATATACGCTGCATAATATACGCTCTCTTACGCTAAG 1652893
1652894GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAGTGGCATACCTTATTTGTTTTGTTGAGTTATGAAG 1652955
1652956GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCATTTTCTTCATAAGTAGCATCTCTCAACAAT 1653014
1653015GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATAACAATTGTCGGTAACTTATTTAGACGCTTA 1653071
1653072GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGATACGATTACAATAAAGTTCACTTAAAGTAGAC 1653132
1653133GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGTCTATTTTTATTTTATCTTTATCTATCAGC 1653190
1653191GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTGGATAGTCAGTACCAAAAGGTACATTAAGCCACT 1653251
1653252GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCATTAATAGAATACGAAAAGCTAAAAGCAAAAAA 1653311
1653312GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGTAGATAACATCACTATATTGATAAAGAGACTCGT 1653372
1653373GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAATCATTGAACTATAATGTAGATCTTGCAGTA 1653430
1653431GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTCCAGCCCAGCCTCTTTGCAGCTTCTAGCCTAT 1653489
1653490GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCTAGTGAGACAAAAAGAACCTCAGTCTCAGAGTT 1653549
1653550GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCTTATACACATCAAGTAACACAGGCGAGTTCATC 1653610
1653611GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGCGGGATACTACTTCGCCCCAAGTTCTGTAAAGAC 1653670
1653671GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGGTGAACTGGTACAGATACATCCTTATGAAGAA 1653728
1653729GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCCATTACTGGACAAAGACTATGTCATCACAGCTGGTG 1653789
1653790GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTAACACTGGTTGAATTCGCAAGGAAAGTGATAGGT 1653849
1653850GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGATATTTAGCGTTAAAACTGCAGGAGACAGGGGCAC 1653910
1653911GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTTTTTGATATCTGTCCCTGCAGTGTCTAGTG 1653968
1653969GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTCATACTCATACCAATTGTAAGTGTTTCCTTGTGTTGA 1654032
1654033GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCTTGGAAAGACCTTAAAAAAAGGATTGATTTATT 1654091
1654092GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCGCATGCCTTAAATCGATCGTTTTCTCTACATCT 1654150
1654151GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACGCTCCATGCCCAGCTGTGCTCTCATCAACACATAG 1654212
1654213GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCGAGAAAGACTTCTACTGGGGCGCCGAATTTAAC 1654271
1654272GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGCTGAGATCCTAGCGACTTTCTACCTGCCCGAT 1654331
1654332GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGCTAAAGAACGCCCTAAGGGAAGCCTTCAAATA 1654389
1654390GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATCGCCTCACGCCATCTCTTTGGCGTGGTATAAT 1654448
1654449GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTCGCAAAAGAACTGCTAGACAAATTTGACAGTGAA 1654510
1654511GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGACTTATTTTTTGTCTTAACTTCACTACTCATTTTCT 1654572
1654573GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAACTCATTATCTTTAAGGACAAAGTCAGGGGT 1654632
1654633GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCCCCTGCGGATACTTCTGCCTCAATTTGGTCACA 1654692
1654693GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAACCTTTTCAGAGGCTTACCTCATCAATGTGGAA 1654751
1654752GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAAAAAGAAAAGGCGGGGGCGAGGGCATGGA 1654809
1654810GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTCTGTGTAACGTATCAGCAATGCGCTTTGTTATAT 1654868
1654869GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCGGATTTCCACTGTTTCCAGCCTGAGCTTGGGC 1654926
1654927GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCAAATTTTTAACAAATGTATTCCATTCTTGAAGT 1654986
1654987GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATTTTATAATGTCTGTAAAACTAAAACATTGTTTT 1655046
1655047GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGGGATCTAGCCTGGCTAGAGAGCTTGCCGCTTTAATTAA 1655111
1655112GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGGGTGCACCACCAGAAGTAGTAGAAGAGGTCGAG 1655171
1655172GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTATTGCCCACAATGTCCCGTTTTCGTTGTACAGG 1655231
1655232GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCAAGAGAAAGGAGCTAGGAAGAGGATCTTTTCCCT 1655290
1655291GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTAGGACTCGAAAAATTTATATAAAAAAAGACATT 1655350
1655351GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTCTCATCAACATTTGCTGTACAAATTTCATAATCAT 1655411
1655412GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCAGTCTTACTCAACAAGTCAGCCCTTACTTATAAT 1655472
1655473GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTCAGTCAGATACGTCTTCTTTAGCTGGCTTATGT 1655531
1655532GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGAGTGGAAGGCGTTAGACCCAGTAGCTGCCGC 1655590
1655591GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCCTGGATCTGAAGAAACATAACCATGAGATAT 1655648
1655649GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGGTCAGGAATATAGATTATTCGTACTTTGCTAT 1655706
1655707GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTCTTCAGAAAATCATCAACACGCATATACTG 1655764
1655765GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTGATTAAAATGGGTTGGTATGGCATAAAAAAT 1655822
1655823GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATCGGAATTATAGGCGGATTTTTAACAATATTCCTAACAT 1655886
1655887GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGGAGACAAAGTTTGTCTGTGCAATATATCCCAA 1655943
1655944GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAAAGAGGAACATAAGGTCTAGATCTTACCCAA 1656001
1656002GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTAATTCATCTTTATAGTGTAACTTTTTGAAATAAA 1656060
1656061GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTAAGAAAAATTCAGTCAGCAGTATTAACTACTACTA 1656123
1656124GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACACCAGTGAGAATGTCTTCCCGAAACTACAAGAA 1656183
1656184GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATTGGCAACTAAGAAGTTTGTACAAATAACATAA 1656242
1656243GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGAATAGGGGATGCGATAAACCAGTTAGCACAACAA 1656301
1656302GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGGCATATAGAATTTTTCGCTTTGTTGCCTCTTTAA 1656360
1656361GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTCAATTTTTTTCGTTTTGTCGGTGAAAATAAAA 1656419
1656420GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCTTGTGGTAACTATTCCATCGTCATCAGCAATC 1656477
1656478GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACGCATTATTGCTAATGCACGGTGCTAACAATCTAG 1656538
1656539GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTTTAAAACGGTAAATAGATAAAACCAAGAAAATG 1656597
1656598GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACGTCTTGTGCTGACTTGTAAACATCGCTGTTCTT 1656656
1656657GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGAAGTGCAAAAAAATGGCTACGGTGTACATT 1656714
1656715GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGCATTCATTAAAGACTTAACAATTCAAGAGTT 1656772
1656773GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAGTTTCTTAATTTATTACAGTTATATGAACAGC 1656830
1656831GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAATAGCCCGCAAATGTCAGTATCATCACGTTGTT 1656890
1656891GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGATTTTATGAAACATTAACTATTTATTTTATCTAT 1656950
1656951GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATTAATCAGATAGAAACTAGCAGTGTTTTTTATGTT 1657010
1657011GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACCTTCACTTATTGAAGATGGGGCTGAAACAACTTT 1657070
1657071GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTGGTTACTGATATTTTCTGAACTCCAGCAAATGT 1657129
1657130GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCGTTAAACAGACTAGGCTCAGGACAAGCATTCACT 1657188
1657189GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCCCAAATCTGTTATCTCTTTAGAATGAAATTTT 1657247
1657248GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAGTACCTTTACCTAACCAGAGCGTCGTATATTAT 1657307
1657308GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTGTAGTCTTGCGCAATACCTGCGCTCTTTAGCAGT 1657366
1657367GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGAAGCTATACAACGAGGCTATATAAATAAAATG 1657424
1657425GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTGAAGATGTCGATAGTGACGATAGCTGAGATAGT 1657483
1657484GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAAAGTAAGCCCGATAGTCCTTAGGTCAGGATCCCTTTA 1657545
1657546GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATATTTGGTCAAGTGTTTCTACAGCATTTTAAT 1657603
1657604GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGCAGAGTCTTTCGCTACGTCTTTCAGCGTCTCAAA 1657662
1657663GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGATCACAGTAATGCGTTATATAAAAAGGCAGAATTCA 1657723
1657724GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTGATCAATTACTAAATTCTGTAATTGTGCCTCTA 1657784
1657785GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACGTAGAAAGTCATAACCCAAAACTTCATTTTTTTGTT 1657844
1657845GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACACAGGCTGTACCAAGCTGTTAGCGATGTAGTTAAT 1657903
1657904GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGCTCCCATTAAAATCACGACCACTCCAAATATCA 1657962
1657963GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAGTTATAATCTATCTCCGGAACATTAAAATATTTTA 1658022
1658023GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATAGTTGGTGGGACGGAATGGAGAAACAGCTAAAA 1658081
1658082GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTATAAAAAAGCATTTGCACAGTCTTGGAAACCACTATTT 1658144
1658145GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACATGCTCGCCCACCAGCACACCGGACAGATCGACATA 1658204
1658205GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTGAAGGAACCTTGTAGAGCGGTATGCTTTGCTTCTTCTC 1658270
1658271GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAACTGGAGCAACGTATTGTTGAATATAGCCCCTATGA 1658331
1658332GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACAATGAGATATTCACTGAGGTCATGGAGCGTGAAA 1658389
1658390GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTTTCCTTATTTTTTAACGAGGGAAATGGTCAGGCTAAAA 1658452
1658453GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACTACGGTAAACTGGGGAGTTAACTCAGCATCCA 1658508
1658509GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTACCTTTCGCATACTTCCTCGCCCTCCTTGAGATATTTTCT 1658570
1658571GTTTTAGTTTCTTGTCGTTATTAC1658594
Left flanking sequence : Till position 1650669 (length bp)
ACCACACAAGGGACACGTTATAACCCTACATAAGCGATAACATTTGGGACGTAAAATTTTGCTTCAAAAT
TAATATATGTGTCATGATATTTTACATGGA
Right flanking sequence : From position 1658594 (length bp)
TGATCCTTGCCTCCATCAATTTTACATTCTTATTTCCTGGTTTATAAATATTTTCTCTCCTTCATTGTCA
ATTTTGTGCCCTTAGGTACGGAAGGGAGTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp