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CRISPRs details
NC_007413_18
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_007413_18                                                                                                                 
top
Strain :
Anabaena variabilis ATCC 29413
RefSeq :
NC_007413 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007413_18
DR consensus (37 bp) :
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
Number of repetitions :
29
Begin Position :
5227213
End Position :
5229282
5227213
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TCTCTGCGGCAAACAGTGCCTATGCTGCGGGCGGG
5227284
5227285
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TATATATTTCTCTATCGCAGACAATCTTCTGTTAATGC
5227359
5227360
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
ATTCCTATCGTGATTGAACTGACTATCAACGTGAGGACTG
5227436
5227437
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CCTAACTTACAACGCCCCACTAATTCACAATATTTG
5227509
5227510
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GATAGAGATGATTGGTCGAGGGGAAATATCTCTGGCCAA
5227585
5227586
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CACTTTAGACGAAACTAAAATATATAGCGATTGTACAAGTCAAG
5227666
5227667
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CTAAAACAGTTCCCTCAAGAGTGTTCCCAATCAAT
5227738
5227739
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TTAATTTTGATGTTCCTTGGACGTGGTTTTAATTCGG
5227812
5227813
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CTTGCATTTTGATAAAAAAGATAAGTAGAGTAA
5227882
5227883
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
AGGAACAATTGTTCCTTAAGCCTATGCCCTCAGTT
5227954
5227955
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GGCAGATAGTGGATGGGGCGGTAGATGTTCGGCAA
5228026
5228027
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TACTCGCGATCGCTGCATCCTCAACGCCCAAAA
5228096
5228097
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GTGGCTGGGACTAGAAGGGCTAGCCGAATCACTGG
5228168
5228169
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TGGCAATACACGGGAGTAGATGATACTTCTGAGGA
5228240
5228241
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
ATCCAGTAGCAGTTCGCCCTCATCATTCCAGTAAG
5228312
5228313
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CGGCGGCGCTGCGGCTGGTGGCGTACTCACAGAT
5228383
5228384
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
CTTGCCATTTTGACCTTCCATATTGAACACCCCAAT
5228456
5228457
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
ACCTCAGTTGCTCTGTTCTTGATTCCGCACAG
5228525
5228526
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
ATTTTAAAATCGGTGCAACCGGAGTTCGGCTCAA
5228596
5228597
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GAGAGGCAGATCACCTTGTTCTATTAAGTGAGCG
5228667
5228668
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
AAAAGATGTCGATCAAATGAAGCGGATAAATAGCCACA
5228742
5228743
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
TAAGAAGGAGAGGTGATGTTAATTCACTTAGTGGAAC
5228816
5228817
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
AAAGACTTTTTAGCCGAGACGCAGGCAGGAAGAAG
5228888
5228889
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
AGCTTCAACGGCGGCGGGACTAGCTACATTCCC
5228958
5228959
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
AAAAGAAATTTAGCGACTTCTGCATTCTGTTCG
5229028
5229029
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GCGTAAACTCTTCCGCCCTTAAATTGCGAGAAAAG
5229100
5229101
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAG
GGAAGCGTCGCTAAAACTCAAGCTATTTTAGAAA
5229171
5229172
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GTGCTAGCCCTCTAATCTCTGGTATCCATCGCCCCAG
5229245
5229246
GTTTCTATTAACACAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
5229282
Left flanking sequence : Till position 5227213 (length
bp)
CTCACTCTTGACAACTCAGCTTCCGAAAAGCTACCTTAATCTGAGATTGACGAAACAGAACCTTGAAAAC
CAAATACAGCAAGCTTTTCAGACCTGGACA
Right flanking sequence : From position 5229282 (length
bp)
CTAATAAAATTGTTTTTTCTAGCAAGTCGCCTGAGGTTTATATTATAGGGTTTTTTAGTCTGCTGAAGTA
AAAATCTCTGCGTACCTCTGCGCTTTACTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp