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CRISPRs details
NC_007413_19
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_007413_19                                                                                                                 
top
Strain :
Anabaena variabilis ATCC 29413
RefSeq :
NC_007413 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007413_19
DR consensus (37 bp) :
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
34
Begin Position :
5764010
End Position :
5766428
5764010
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATACCTAGATTCCCACCGAATACAATCCAATTG
5764079
5764080
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATTCATTAAGCCTAGACGATCTTGTCTGCACTCGAT
5764153
5764154
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GATGAGCTAATTTCCAATGCCAGTCTTTACGACGGTTGGCGATG
5764234
5764235
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCAATTCTCAAATCAGCCCGCCACAAGCAATTT
5764305
5764306
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GTCAATTGGTTTAAGTTGTAGCACTCCTATCTTAT
5764377
5764378
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCGCAAGAGATGTAACGCCTAAGAGTAAAAAAGA
5764449
5764450
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GTAAAAATCATGATTTTTACTATTGAAAAAATCCTG
5764522
5764523
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAATTTAACTTATTTGATAGTGATATCTATCGGTATATA
5764598
5764599
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAGAAGTTGCAAGTAGAGCTAATTTAGCAATCAC
5764670
5764671
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACTATGTATGGGGGTGAATATTAGTGGCATTTCGTCCACCC
5764748
5764749
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACTATTCTCTGCCGCTAAATCAAAAACAGAGCTA
5764819
5764820
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAACTTACTGGGACAACCGCAGCAACCACCTTAAT
5764891
5764892
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAGTTGGTTCGACTGATAGTTGATTTGAACAAG
5764961
5764962
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCACCTGAGATGACGCAAGCAGCAAAGGCAAGC
5765031
5765032
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAGTTGGTTCCGCCATAAAACTGATTTTTGA
5765100
5765101
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GGGAACGCGCCCTTAAGGTTTATGAAATTGTCTA
5765171
5765172
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAATCGGTCGAGCTAGTAACGCTTCGGCTTGC
5765241
5765242
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGTGGTATCTTTGGCACAATCTTCAGGATTGTCG
5765312
5765313
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGAGTTACCGCCCCTTTAATCGGTAGGGACAGG
5765382
5765383
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GGAATCAGGGAAAGGGTTAGGACCTGCAAGATT
5765452
5765453
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCGAATTAACACTTTATTAACCTTCTCTATTTGT
5765524
5765525
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAATTCCTTAGCTAAATCCAATAAGGCCAAGGAA
5765596
5765597
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TATGGAATCCTGGCAACCTACGGGCTGAGGAAT
5765666
5765667
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGAAGACGGGGAGGAGGAGAAATGCAAGCTAAAACG
5765739
5765740
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTGGATATTTATCCAAATGCCGATCCTCTATCGA
5765810
5765811
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCTGCGCGACATCGCCAAGTATTACAAAATCC
5765880
5765881
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTAGCGATCGCCGCCGCCTTTACCCCTTCTAAAT
5765951
5765952
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CCTATACAGGGTTCACAAACACTATCCAATCTAGGG
5766024
5766025
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAAAAATCCAAAAGGGCATATATCTCTTTGTATCGATTCGAT
5766103
5766104
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAGTAAGCCAATACTGAAGTTTTCGTGTTATATT
5766174
5766175
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAACCCAGAATCGGCTTATCATACACCAGAGATAA
5766246
5766247
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCCTTAATTGACTCTAAAGCACTATATACAATATCAA
5766320
5766321
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GCAACATTCGTTTCTACAATAATATTGGTGTAGC
5766391
5766392
ATTGCAATTAACTAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
5766428
Left flanking sequence : Till position 5764010 (length
bp)
CTACCTCTTGACAAAGCGATCGCTCAACAGCTACCTTAGTCACAAGTTCACGCAACCGCACCTTGAAAAC
CAAATATATCAAGCTTTCCATGCCTGAGCC
Right flanking sequence : From position 5766428 (length
bp)
GTAGGAAAAAATAGATTTGTTGTACTCGCAACATTGAGTTCCAATTAATACAACGCGAATCCTTAGCCCC
TAAAATCGAGAAATATTGCAACTCTTCATC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp