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CRISPRs details
NC_007413_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_007413_3                                                                                                                 
top
Strain :
Anabaena variabilis ATCC 29413
RefSeq :
NC_007413 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007413_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
37
Begin Position :
1234556
End Position :
1237182
1234556
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGGTTTTTCTCGCGTTATGAATGTTTTTGCTTTT
1234626
1234627
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AACGTTATGCCACTTCAAGGCAATAGCTTCCGAC
1234697
1234698
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTGCGGTCAATTGCCTTTGTGCATCAGTTTGA
1234766
1234767
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTAACATCGCCCTAGCTAAACCAATTAAATTCAA
1234837
1234838
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAAGGTTGAGCTAACTAATAAACCGCCGGAAGAAATAAC
1234913
1234914
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAACTTATTTCTAACTAGTAACTGAAGTTGATAA
1234984
1234985
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAATAATTATTAGTATTATTTCCATTTTCCTCCT
1235055
1235056
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGTACAAGATGCTAATACAATTACTATTCAAAA
1235126
1235127
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAGCGTAAATCCGTTTTTAGCAGGTACATCTGGGGCAACG
1235203
1235204
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGGAACAATTGTTCCTTAAGCCTATGCCATCAG
1235273
1235274
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGAATCCCATCCTCTCCGTTATTCCAGCGATTTTAA
1235346
1235347
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAAACCCTTGCTGTATATGACTTGATCCAGATGATC
1235419
1235420
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAATTAATTTGGAATGTTGAAAGCTTTCATGGCTTA
1235492
1235493
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATGCTTAGTCTTCCGCTACATCACAGAAAGACTA
1235563
1235564
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAGTTTTTTCTAGCTCTTGTTGTAGGAGTTGAATTTG
1235638
1235639
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGACTAGTCCCGGCAAAGTGGCGGAAACAGGAAC
1235709
1235710
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TGCGGCAACAGTACATAATGCTTTTCAACTTTCAAAT
1235783
1235784
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TCTTTGGCTTTTAATTCATCTGGTTCTGGTGTC
1235853
1235854
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
GAAGCATCTCACACCAGATGGCAAACTACAGCAAC
1235925
1235926
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ACTAGTACACCCTGGGTGGCTAGAGACACGCTAAGA
1235998
1235999
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AATTATTTTCTTGATTGGCTGCTGTATGGCTTTG
1236069
1236070
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AAGTCGGTAGTGATTTTAAGAAAGTTATCCTCTGCGG
1236143
1236144
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TTAGCTTAAGCCTATCCCTGACTATTCCCAGCACTTTATCAA
1236222
1236223
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCAGATGACCACTCAGACCAAGGACGCGGAGAG
1236293
1236294
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGGAATTGCAAAATCTTCAGGTTCATTAGTGA
1236363
1236364
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CTATATAGTTGTTTTGGATCTAGGTCTAAAAGTA
1236434
1236435
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
TAGAAAAGCTTGGTCAATGTCTCAAGAACTTTGGG
1236506
1236507
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CATTAAAATTCAAAAACTAGGTGCAGACGATCGC
1236577
1236578
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGAAAAAAGATAGAAGCCGATTTGCGGGAAGAC
1236648
1236649
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGCCTACGAGGGTACAGAGTTCGCCCCCATGAAC
1236719
1236720
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCGCTTAATTGTTGCTGTACTAGTGATGCGGCTA
1236791
1236792
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
AGCGCCTCTGAGGTTAGCGCTTCTGAGGTTAG
1236860
1236861
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CATTAAAATTCAAAAACTAGGTGCAGACGATCGC
1236931
1236932
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CAGAAAAAAGATAGAAGCCGATTTGCGGGAAGAC
1237002
1237003
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
CGCCTACGAGGGTACAGAGTTCGCCCCCATGAAC
1237073
1237074
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAC
ATCGCTTAATTGTTGCTGTACTAGTGATGCGGCTA
1237145
1237146
GTTTTAATTAACAAAAATCCCTATCAGGGATTGAAAT
1237182
Left flanking sequence : Till position 1234556 (length
bp)
GCTACTCTTGACAACTCAATGGCTGAAAAGCTACCTTAGGTTCAGATTGACGCAACCGCACCTTGAAAAC
TAAATATAGTAAGCCTTCTAGACCCCGGCT
Right flanking sequence : From position 1237182 (length
bp)
GGCGCAGCTAGGACACTTGATTCTTCCATTGCCTTGTTTTAGTGTTAGTTCGACGAAACCTAACCCCAAC
CCCTTCCCTACAAGGGAAGGGGCTAAAAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp