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CRISPRs details
NC_007413_9
Flanking alignement tool
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NC_007413_9                                                                                                                 
top
Strain :
Anabaena variabilis ATCC 29413
RefSeq :
NC_007413 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007413_9
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
Number of repetitions :
43
Begin Position :
2395670
End Position :
2398703
2395670
ATTTTAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ATAATACGGTTAAGAAACAATATTCAGATATATTGG
2395742
2395743
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TTTATGCGGTCTTTGTGCTGTTGGTAATACGTG
2395812
2395813
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CGTTTCCGCCATTGGCTTTTCATACTGGGAAGAA
2395883
2395884
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ATATTTCTAGAAAATCATCAAGCTTTCTCGCCCA
2395954
2395955
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
GATATAGCAGAGAAACATGGATATGCACCAGT
2396023
2396024
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ACGATATAGGGATTTAACCTTGCCTTTAGCATC
2396093
2396094
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TAGGTCAGGATTTGTTAACAAAATATCCGTTTCG
2396164
2396165
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CGGTAATCTTTGCTTTCTGGCGTTCTTTAGGATTCTT
2396238
2396239
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
GGCTTTGGCTATACTTTCAGCCTTCAGATGCTCT
2396309
2396310
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TCGTTATACACGACGGTATTAACGTCGATAATTAC
2396381
2396382
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ATGATTTTCAGTGGCTAGCGATTAACACAATGAA
2396452
2396453
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CAGATTACGGAGAAGTTGGCGGTTCTTGGTCGGA
2396523
2396524
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CACAAAGGGATTAACTTTAGAAACATAGGGTTTG
2396594
2396595
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
GCCAAAGTTACCATGCGTAAGTCGTCCGAGTTA
2396664
2396665
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TCACAAACGACTACTAAATGAAGATGCAAAGCAGG
2396736
2396737
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TTTGTTGAATTAAAAAAGCGTACTCTTTTTGAGAGT
2396809
2396810
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ATTACCCTCCGGCGTAAAATTTAAGCTTCAAAAT
2396880
2396881
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
GGATGAACTTTTTCTCCTGTATTGAGATAGCTTCCCCG
2396955
2396956
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TAGTTCACCGTTACTCTCAGCCCATTTATCATATAT
2397028
2397029
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CCCAGAAGAAGAACTGCCAGACCCATCATAACGTT
2397100
2397101
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TGATGTTTCGTATTTCAACTTACGCAAGAAAGTA
2397171
2397172
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TCGTAGCAGACTTTACATAGCTGCCTTTTGCGT
2397241
2397242
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TAAAGCAGGTACAGTTACAATCCTTTCCTCTTTA
2397312
2397313
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
AAGGGTTAAGGTTATTCCAGGTGGTGCAGAGGGATT
2397385
2397386
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CTCTAATTAAGTTCATTTTTAATTAAAATACTC
2397455
2397456
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TTTGTGTGGGTGTCAGCAATATGTTGATTCTCT
2397525
2397526
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TCTACGTGATCAAATAGCTCAAATTGAAGCTCAGAAA
2397599
2397600
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ACTTGACTGAGATATTGGTTGCTGAGTAATCGGCG
2397671
2397672
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CTCTTTCACGGCTATGCTGCAAGGCACTAGTTTT
2397742
2397743
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ACAATCTGAAGCCAACAAAGACTATCAATCATGT
2397813
2397814
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TGTCTTTGTTGAGGCTTGTTCAGCTATTGAGTA
2397883
2397884
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TAACATAGGTACTATTTATCTACGATGGGAAA
2397952
2397953
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CGTGGAATTTCAGTACAAATCTAAACCCGCGGAC
2398023
2398024
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CCTATCACTAAGCAGGGAAAAACATTTTTCCCCT
2398094
2398095
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CAGTAATGTTATGGAGTCGTCTAAGTCTCCAAGAA
2398166
2398167
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
ATCGGTGGTGGATTGTTTTAGTACCTAGTGTACTC
2398238
2398239
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CACCGCAGCGCCTCCAACTGGGTACTCAACTGATTAC
2398312
2398313
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CAACTTTATATATAGTTTTCACCCCTAATGAT
2398381
2398382
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TTCAGATGAGCTACCAGATGATTGCAAGTCTCGC
2398452
2398453
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
CCAGGATTACCAGCGCGTTTATTTACAGCGTCAG
2398523
2398524
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
AATCACGATAGGAATAACTATTGCCTGTACACTT
2398594
2398595
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
TTTATCTCAAATCTCCTATGAAGTACAGTCTTTAA
2398666
2398667
GTTTCAATCCCTGATAGGGATTTTAGAGGGTTTTAAC
2398703
Left flanking sequence : Till position 2395670 (length
bp)
TAGATATTTTGGGCGATCGCCTTTAGGTATTGCTTTGGCTACCCTGTTGGGTTTTCCGCAAAGTCAGGGT
TGTTGTTGAGAGTACTTACGCAGCAGAATC
Right flanking sequence : From position 2398703 (length
bp)
CGCTTGGCTCTCAAAGCTTTGGTGTATTTGGTTTTCAAGGTTCAGTTGCGTCAACATGGAGCCAAGATAA
CTTTTCAGACATGGGATTGTCAAGAAGCGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp