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CRISPRs details
NC_007503_3
Flanking alignement tool
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NC_007503_3                                                                                                                 
top
Strain :
Carboxydothermus hydrogenoformans Z-2901
RefSeq :
NC_007503 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007503_3
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
Number of repetitions :
59
Begin Position :
1926257
End Position :
1930135
1926257
GTTTCAATCCCAAATTGGTTCCATTAAAAC
AGGAGGATGATAATCATGTTATTAAGCGAATTGCTT
1926322
1926323
GTTTCAATCCCAAATTGGTTCGATTAAAAC
CTGAAGCAATCCAGAAGTTGGCGGAGGACTTTGAAA
1926388
1926389
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTGGTTTTCCCATACTGGTCGGTCATGTCAGTTTGAG
1926455
1926456
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CAAAATCACCTCCGGACCGCAAAGCAAGGTCGGTGAA
1926522
1926523
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GTAAGAGTCTATTTAGAGCAGGAAAATGGGTATTTAG
1926589
1926590
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GGAATTTAGGTATATCGCTTATTATATTTCTTTCTT
1926655
1926656
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
ATTGAAGGACTGGTTTTCTTCATTAAATTTAGAAGA
1926721
1926722
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GCATTTGCCAATAAATCAGTAAAGTTAACACCTTG
1926786
1926787
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CATATGGACTGCTTAAACAAGACTATCAGCATGCAA
1926852
1926853
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GTGGTAGCTGTCGCCATAGTCCGCGTTTTTCCTGGC
1926918
1926919
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTTTTGAACTGACCAGCAGGAGAGTGGATTATTCAAG
1926985
1926986
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AATTGATTAAACAACACGATTTATTGCCAGTTAAAT
1927051
1927052
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CAAAATCTGCGTTTCAGGGCTGGAAATAATTTTCAG
1927117
1927118
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AAAGTCGGTGGACCACGGCCGTATAAACGTGGGAGG
1927183
1927184
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
ATTCCACCCGGAGGTGCTGAGAGTTGATATTCTTGA
1927249
1927250
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AGAGCTGGCGAAAACAAGACCGAATTGATTGGCAGAA
1927316
1927317
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CCTACCGTATTTATCTCGTTCTTGGACGTCTTTCTG
1927382
1927383
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CATGCCGGCAGGATACAGCTCCCGATGCCGGGTGTG
1927448
1927449
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AAAGTTGGGTATGTATTGGACGGTATTCGGCCGTA
1927513
1927514
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
ATAAAGACTTTCACAAACCGACAAGGTGAAATTATAGT
1927581
1927582
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTCGCCAGCGGCTTTCTTGGTTTTCTTTTCTTTTACCTC
1927650
1927651
GTTTCAATTCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CTGATATGTTTAAGCAGTTTTTAGGGAAGGTTTGGC
1927716
1927717
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CAGAATATAGTAAATGAATTAGAAGCTAATAAGCAA
1927782
1927783
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTCTACATTATAACCATAATCCTCAAATAATTTTT
1927847
1927848
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CAGGTTGTGGTCTAAATCCATGTCTGCGACTATAT
1927912
1927913
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
ATGGGAGTTTGAGGTAAGCAGGCAGGCGGTAAGGAT
1927978
1927979
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTAGGTGGCTTTAATCCTTCGGCCTGCCATAGTTT
1928043
1928044
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CCAAGTACAATCAGCGGCTTTTTGAACACCTCGCCTTT
1928111
1928112
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TACGGTAGACTGTAAAGTTTCCAATTGAAATATCATT
1928178
1928179
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TCTGGTGATGATATGATTTGTCTTTTTGTTACTGA
1928243
1928244
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CTTAATGCTAACTGCACCTTGTTAACCCCCTTTTAG
1928309
1928310
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
CTCGCCCCAATCGTGCAAGGTCAATTGGTAAACGTTC
1928376
1928377
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTTTGTGGAAATGTTGCAAACAGTGAAGGGTGTCAA
1928442
1928443
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TCCAATCGTAATCTTTCATATATTCACTTCTTGGAGT
1928509
1928510
GTTTCAATCCCAAAATGGTTCGATTAAAAC
CCAGTTTAGCATAATATTATTATCTTCTACTGTTCCGC
1928577
1928578
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AAGAAGAAGCCAGGGAGTACTGGGCAAAGTTTATGC
1928643
1928644
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TTCTTTCTGGTGCTGGGTATCTCATTGCACTTTTGG
1928709
1928710
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AGTAAAATAGCTATTTGTACATACAATAGCCCCATTG
1928776
1928777
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TACATGTTTGCTTCTTCATCTTCGACCATCTTAATG
1928842
1928843
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GAATCATTCAAAAGTAAACAACTTGCAGAAATTGCTT
1928909
1928910
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GGTTTATGTAAGTATTAATAATTTGCTGGTAACGTA
1928975
1928976
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TGCCATTTTTTATAAAGAATTTTATTCATCTCTTTT
1929041
1929042
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AGGCAGGTAATGGGTAATGCAGCTTGAGGAAAAAGTAT
1929109
1929110
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
TGAGAAAATTTCTTACGATGAAATAGCAAGAAATA
1929174
1929175
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
GAAAACCGCATGACGCAAAAAGAACTGGCCATGCGTCT
1929242
1929243
GTTTCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACACTTTTGAGATTACTACTTCTGTATATTGGAA
1929307
1929308
AATGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACTTGGCTTGAATAGCGTTACTAAAACAGTTTTCA
1929373
1929374
GGCGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGGGTTCAAGGGAAGTATTAAGCCATTTGAAAAT
1929439
1929440
AAGGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACTTAGATGAAAAAAACAAGTAGTGAAAAGTGAGT
1929505
1929506
GAAGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACCATACTGGCCGAATTGTAGAGGTAATTAAAAA
1929570
1929571
AATGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGGGTTCAAGGGAAGTATTAAGCCATTTGAAAAT
1929636
1929637
AAGGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACACCTCACAAAAACCATCCGGTTTGTTTACTTCCGA
1929704
1929705
AGCGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGATAATCGGGTTAAACAAGCTGTCTATAATTCT
1929770
1929771
CTGGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACTTAACGGGACTAACAAATACACGGGGACAGCTTA
1929837
1929838
CATGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGTTGTGTATTCTGTCGCTCCTACACCAATTCTTA
1929904
1929905
CTTGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGTATATGTCCATCGTGATTTGAACGCTTGAATG
1929970
1929971
ACCGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACGTGCCAGCAGCGCCAGCATCACCAGTGGCCACA
1930036
1930037
TCAGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
AACTGGGACTGCTTTTTTATGTATTGCGTGAGAACGCAG
1930105
1930106
ATTGCAATCCCAGAATGGTTCGATTAAAAC
1930135
Left flanking sequence : Till position 1926257 (length
bp)
TTTGCAAATTACAGCCTACTTCTATGCTATTTTATTTTGAAATATTGGTGCCCAAATAATTTGCAAGTTC
ACACGTATTAAAAAAGCTGTAGGGCCATAC
Right flanking sequence : From position 1930135 (length
bp)
AACCCATAATTAATTATAAAAGAAAAAGATTTTTAAAGAAAGAAGAAGTTTACATTTTTCAATGTTAATA
TTGGTGCATAGTGGTAAATTTCCACTAAAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp