Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_007644_3                                                                                                                 top


Strain : Moorella thermoacetica ATCC 39073 RefSeq :NC_007644 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_007644_3
DR consensus (29 bp) : GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACNumber of repetitions :47
Begin Position : 1772658 End Position : 1775677

1772658GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGATCACTCTGCCAGGTGGCCGTGGATAGTTTTGATCAACTGCC 1772723
1772724GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGTAGTTGGACTTTTATGCGCAGCAAGGCCCCCGGTA 1772789
1772790GTTCAAATTCCTCTATGGTCAATGGTCACCCAGTTTTTGCCGATGAGGACCTGGGATTGCTTCAG 1772854
1772855GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAAATGGCCGTAAAACTGAAAGAGGCGGGATTAAAA 1772918
1772919GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTAATATTCCAGTGCTTTTTAACCTATTATATCTAA 1772983
1772984GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGTGCAGTTACCCAAATACCGCATTACGGTGAGCCAG 1773048
1773049GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAGTTTAATTCCTCTACAGGGAAGGTTACTGTTATGA 1773113
1773114GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCACCCAGGGAACGTGATGCCTGGGTGGCTCAATGTA 1773179
1773180GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTACCCCGGTGGCGTATGGAGCGGCTTGGGACG 1773243
1773244GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACTCAACGGGTTTGAAAAGTACCTCTACATGAGCG 1773307
1773308GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGAGATTTGCCGGCAGAAATATTTTATTCCCTGCCCGAA 1773374
1773375GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGAAGACGCCTGCCGCCTGGACCACCTGGACGAAAAG 1773440
1773441GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAGTTTAATTCCTCTACAGGGAAGGTTACTGTTATGA 1773505
1773506GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCACCCAGGGAACGTGATGCCTGGGTGGCTCAATGTA 1773571
1773572GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTACCCCGGTGGCGTATGGAGCGGCTTGGGACG 1773635
1773636GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACTCAACGGGTTTGAAAAGTACCTCTACATGAGCG 1773699
1773700GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGAGATTTGCCGGCAGAAATATTTTATTCCCTGCCCGAA 1773766
1773767GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGAAGACGCCTGCCGCCTGGACCACCTGGACGAAAAG 1773832
1773833GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAATAAAGACCTTCTCCGAATTCAAGCGATCTGGTAG 1773897
1773898GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTGGGAATGTTGAGAGAAGAGCTCCGAGAGCTTG 1773962
1773963GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTTTATGAATTTCGGCTCTCCGCCTACGCCCCGTAA 1774027
1774028GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGGTTGTCGCCCCGACTGGAAACCTCGGTGAGTAA 1774091
1774092GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCTTCATATTGCCTTCAGGGTCATCAGTAAAAGGA 1774155
1774156GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCCTGTCACGGAAGAAACCACCTGGCTCCGAGCCGGA 1774221
1774222GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTAAAATGCTTGATGCGGATTTAATTGATGTTTATA 1774285
1774286GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCAAAAAGAAAACCGGCTTATTTGTCGCCGGTTTCTT 1774351
1774352GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTCTTCGTAAATCGACTTCTTTTGCTTGATATGCCGCA 1774417
1774418GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGCCGTACTCTTCTTCACCATGCCAGACGATCCATT 1774482
1774483GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTTCGGCCCACGGCACGGAAACTTATGCTTATAAACC 1774548
1774549GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCGGAAGGGGACAAACACTTTGTGCCCCTTAACA 1774611
1774612GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGGCACACTCGCGGCACTCATTCCGCGTTATCGGG 1774675
1774676GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGCTTCGACGGTTTACGGGGCTATTCCGTCATCGCTA 1774740
1774741GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTGCTACGTCCAGCTTCAATATCCGCTATAAAAGAA 1774804
1774805GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTGAACACGGTCGATGCAATCCATCCATTGAAAAGCT 1774870
1774871GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAAACAGGATCGGCCAGCAGCCGTTCTTCCTGGGGAT 1774935
1774936GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCGGAGCAGGCTAACGGACCGGTAAAGACGACCC 1774998
1774999GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTCTTTTGCCCCATTTACAAATACAGCAATCTCCGA 1775063
1775064GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCTGCCGTGGGGATGGTCAGGGTTTCGGGAGAGCGGG 1775128
1775129GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCGCTACTGGCGTAGAGAATTGACTTCAGGCGGTCGA 1775193
1775194GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACCCTGATACCACCGCGGCCAATGACCTTCGGGTAAGTA 1775259
1775260GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGTCGCCATTGCCTGCGGGGCTGTTGATAAGCTTAAA 1775325
1775326GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACTTCGACGGGCAGAAAACTCAAGGGCGCAAGGGCAAA 1775390
1775391GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGGTGCTAGACCCGCAGGAGGGGACGGTGGAGTTT 1775454
1775455GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACACGTAGAGCATAACGTCGAGACTTTGAAAATCTCCC 1775519
1775520GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACGGCTGGCCGAAAAGGAAGGAATAATTGTAGATTAT 1775583
1775584GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCACAATCTGCTGTTGATTATAGTACTACTTTTACCGCAG 1775648
1775649GTTCAAATTCCTCTATGGTCGATGGTCAC1775677
Left flanking sequence : Till position 1772658 (length bp)
TATACGTCGCACCATTTCTTGCTGAAAAACTTGCAACCGGGTACCCAGCCCGATTACTACTCCACCTTTG
ACGTTATCACCAGATTTTTATCTCCACCCT
Right flanking sequence : From position 1775677 (length bp)
CGCAGATGAAAGGCTTGTCCCGACAGGGATTTTAGCAATTTTTTAAAAGCCCCTGCGTCAAACCGCCAGT
TTGCACTTACACTACAGGAAATTATCTGTA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp