CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_007759_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_007759_2                                                                                                                 
top
Strain :
Syntrophus aciditrophicus SB
RefSeq :
NC_007759 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007759_2
DR consensus (35 bp) :
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
Number of repetitions :
80
Begin Position :
601771
End Position :
607660
601771
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AAAGCATAGCGTCTGCTCCTTAATACGTTTACATTATAAC
601845
601846
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GCCGCTGCCATTCCTGCAAACATCAAAACCATTGCCA
601917
601918
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTGAACATTAATCCCGCTCCATCTGAATTGTTTTCAAAACA
601993
601994
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TGATACACACCTCTGCAATTATCACACGTGAAATAATTG
602067
602068
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTGAGCAAAGCCTTACATTCTGTCCGGGTAATACGG
602138
602139
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ACAGTTACGATCAACGGTATTCCAACAGCAATCAAAACAG
602213
602214
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGTAAATCCTGATTCCCGCTATCTCCCTCACACCCATCTT
602288
602289
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATACCGCTACAATGGTCGCATGTAAAGTAACCGTTATCG
602362
602363
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GGTAAATCTCCACTCATAAAATTGGAGGAACTTCTATTG
602436
602437
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTTAATACATCCATTTTAACCTCCTAATCGCTGTTATTT
602510
602511
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GCCTTTATGGTTTGTTATTTGGTTGCCTTGGTTGCCTT
602583
602584
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTTGCATTGCATCCACCATACGCCCCATTGCTTGCAAC
602656
602657
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TGTGAACTGTGCCAGACTGAAACAAAATTCGATACTTGC
602730
602731
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TGCCTTTGCAGGCGCTACATCTACAGGGTTAACCATTGC
602804
602805
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAGCAAATTGGCGTTGTGATATTGAATTTTCATGTAACCAT
602880
602881
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCCTCTGCCGTGTTGACAATATAAATCCGGTCATCAAAAT
602955
602956
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TATGGCTTGTAATTTTGGAAATGGTCGTTGATGAGTTGGAA
603031
603032
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GACCAATCGACAATAGGCTTTTCGATCCAGGGAGCGATGA
603106
603107
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATCATACACGTCCTCACAATATGTGTATATCCTCTCTTT
603180
603181
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AAGACTCAAGATCAAAAATATATCCTCTGCTCCTTGGT
603253
603254
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CATATTTCCTCCTATCGATACCGATCCGTTACATCCTC
603326
603327
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTTTCTTGTATCCATTTATTCGGCCCATCTTCTTTATCTT
603401
603402
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCCACATTCCAGTTCAAAAATCACTTCCCCATCCCATCGAC
603477
603478
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GAATCGGTATAGTCTCATGTGCCATAGCTCTATACCT
603549
603550
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCGAGATAGGATATTCAGGAACTCGGAATGATTGCCC
603622
603623
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCGAGATAGGATATTCAGGAACTCGGAATGATTGCCC
603695
603696
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCAGGGATAACCCTTAGAATCCTCCTTTCTTTAGTGAAA
603769
603770
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GAACGCATACGAAACACGAACTGGCTGGCAGGCTGATCAA
603844
603845
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTCAATACCGAGTTCGTTCAATACCCGCACGGAGTTCATCA
603920
603921
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TATCTATCTGCTTTTCAAATATTCTTTCCCAATTCGTT
603993
603994
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CCTGCATTGACTCGTTTCAATAGGCCGAGGCTCTTGTCCT
604068
604069
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTTTTCTCCTTTTCTTCTTTTTCTTTTTCGTCTATTTCC
604142
604143
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATGATAACCGTGAATAGCATTATCATTATCGTCATTATC
604216
604217
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATGATAACCGTGAATAGCATTATCATTATCGTCATTATC
604290
604291
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TAAAGATGAAATCATGGAATACATCGGCGGAGTTTCGG
604363
604364
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CATCAGCCATAAGGTTGATATCATCCTGAGTACACTCC
604436
604437
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAATTTTGATAAATCCATTCTATTAAATTCTTTTCGT
604508
604509
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GGAGGGGCGACCGGCGAATTGTACCGGGAAGACAGCA
604580
604581
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TACATTTTAGCACGTTAAAAATGTCGTGGTAAAAAAAA
604653
604654
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTAACACCCCGGCCTCAATATGTTTTGTAAATGTGCTTTT
604728
604729
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCCCCGAAGCCGGAAATTAATTTCATTTTCTTTACAACATT
604804
604805
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCGTAATGCCTATTCCCAACGGCCTCCAAAGGTGC
604874
604875
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TAAAACTTCCCGACTTCAATGTTCATCATTCCCCCTC
604946
604947
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GTGCTGTCCGACGCGCAGATCGTAGTCATATACCCA
605017
605018
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AGCATTAAAGTTTTCCCCGAACCAGTGGCAGAAACCGCCAC
605093
605094
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GGTAATTCCCGGCAATAATATTCATTGCCCTGAGCGCAT
605167
605168
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTTGCGGCTCTTTCGTTCTCCTGTTTCTTTTCACCT
605238
605239
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AATACCTGGGTATCGCCTTTATCGAAACGCTTCAGTATT
605312
605313
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATGCGCTCCTGATTGCGTTCAATTTGTTCAAGGCGTTCGT
605387
605388
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AGGGGCAATTCTGGGGATGCACTTTCGAGGTTGCCCA
605459
605460
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTAATGTCTGCGCATTCAACATGCAAGTTTGGGAACCATC
605534
605535
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CTGGTTTGCAAGGGCTTTGTAGTTTTTCATGATCGCCTCC
605609
605610
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAAAAACAGCAACCGTGCTTTTCCTTTTGCTTCTCATAG
605683
605684
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CCACAAAATCGTGTTCATCAACATGATCCTTGTGATTT
605756
605757
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GCCGCATCGCTCACAGCGATATCCGGCTTCTTTCAATGC
605830
605831
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCATAGGTTGTACTGATAGGTTTGTTCAGTGCTTGCATTGC
605906
605907
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GATTGATCCCATTTGACCGTTTTCGGTATTGTGATAACCA
605981
605982
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TTTCTTCCCTCCCCCTGCTTTTGCGGGTGACTGCGTTTT
606055
606056
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ATGCCAGTGTATCAGCATCCAAAGTATCCCTCACCCTGACC
606131
606132
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CCACGCCCATGATTTTTATCATGTTTTTTGCGTCTCTGA
606205
606206
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCTTAAGGATCGTGTTATAGTAATCAGCCGGGTTGTCGTG
606280
606281
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AATGGATTCCCAGAGAAAAAGCGAAATCTTTCCTCGG
606352
606353
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GTCTCAACATGGCGTTAAACTCTGACGTTAGCATGGTTA
606426
606427
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCAGTCATTCTCTAATCTATCGTTTTCTTCCCTTAATCG
606501
606502
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCAGTCATTCTCTAATCTATCGTTTTCTTCCCTTAATCG
606576
606577
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCAGTCATTCTCTAATCTATCGTTTTCTTCCCTTAATCG
606651
606652
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAGCTTGTTCGGCTGCTTGTTCGGACAAGTATTTCTTTTTC
606727
606728
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GCTCTTTCCCGTGCGTATTGGTTGTGTCTGCGTCCTTTG
606801
606802
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GCGTGATCGTGACTTCTCCTTTGGATAGCTTGGTAAGCAA
606876
606877
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
AACTCAGAGATAACTTCATTGATTGCTTCATTATTCGTAATC
606953
606954
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ACGCGGCATGTGAACATTAAGGGGCAGTTCCAGGGTCATCT
607029
607030
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GAACCCATTAATAAGTTTAAAAAGCTGCCTTGCCCTCTCT
607104
607105
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CGCAGAGAGGCTGTTAATTTAAAAAGGCTGTTGATAATT
607178
607179
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TCAGTAATCCGGGGCTGGGGAATGTGACTTGCCTCCGCCC
607253
607254
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
GGTTTCATCCTGTCCTCCGTTATCGGTATTGATCGGTTACGT
607330
607331
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
ACTAAATTCCGTCCACGTGTAAGCAGATTTTTAGGAATA
607404
607405
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAACGTATCCGCTGTGCTCATTCATCCAGGCGATGACT
607477
607478
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
CAACGTATCCGCTGTGCTCATTCATCCAGGCGATGACT
607550
607551
GACAGAATTGACCTGATTTACGAAGGGATTGCGAC
TATATAGAGCTCACCATCGAGCTCGATATCTCGTAGGCCC
607625
607626
GACGGAATTGGCCTGATTTACAAAATTAACGTGGA
607660
Left flanking sequence : Till position 601771 (length
bp)
TCTGCAGTATGGAGAAATCGATGTTTTTTGGGTTTGTGGATACAGGTTCGCGATTATGGTACCTGGAATC
CTTGTATTTTCTCCAAAATCGAAGGCCGCG
Right flanking sequence : From position 607660 (length
bp)
ATTCCGGCGGCAACGTTGCCGATTTTGTTTCCCTCGGATTGCCATGGGATAATGCCTTTAAATTCGAAAA
TGGAGGCGACTTCCCATGGTGGTTTACGTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp