CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_007907_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_007907_6                                                                                                                 
top
Strain :
Desulfitobacterium hafniense Y51
RefSeq :
NC_007907 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_007907_6
DR consensus (30 bp) :
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
Number of repetitions :
46
Begin Position :
3179147
End Position :
3182163
3179147
GTTACAATTCCTTATAGGTAAGCTAAGAAC
ACTAAAATTTGAATTAGAAAAAACAATTCAAATTCTGGA
3179215
3179216
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
AAGTTGCCGATGCCATGAAAGAATTTAATATCCGCAT
3179282
3179283
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GGTTACACTAGTTACGCTTGGAGTGCCGGGCACAAAGA
3179350
3179351
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CATCTTCATTCATCTGAAGGTCGTTTTTGGCCATTCCC
3179418
3179419
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TTCCGAACACATTGAGACGAACCGCGCTGGGTCTTGA
3179485
3179486
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TCGGCTAATCTGGCGTTTATGGACGCGATTTTCCG
3179550
3179551
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
AATGTTCTGACTTGTAAGGTAGGGCCCAAAAGCTC
3179615
3179616
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GTAGGGATGGTTGGCGATAAGTTGTCAATCGTGGACAT
3179683
3179684
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CGCAGCAACAACAAGACCGCATCCACCCCACTCAAAAGC
3179752
3179753
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CACGCCGTTCTTGTCGCAGAGTCCCGTAAATTGCAT
3179818
3179819
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GGGATGAGTCGCGACTTTACAAACTGGTTTAAGTAC
3179884
3179885
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CAAGTGCGGGTGATAAATGCGATCACCTTGGCAGAG
3179950
3179951
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GATGATCAGGAAGCCGGCGTTATCGAGTATCGAAACA
3180017
3180018
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GTATAGAGACTTTCCAGCCCCATTGACCTCTGCGG
3180082
3180083
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TATGACGCTGGACGAGATTAAGCAAGCTTGGAAAATGAG
3180151
3180152
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GGTACCAGAACCAATGCACCACCGTGAGGGCGCGATCAC
3180220
3180221
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TGTATACTTTGCCCTATTCAAAACATGCCGAAAGAT
3180286
3180287
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
AACCCATGAAAGAAGGGGCAGAATTAAAATCTCCT
3180351
3180352
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GCGATAGCTACCGATACCGGCAGCAGTACAACGAATA
3180418
3180419
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GTTGGGAGGGAAGAAGGCATGAGTGCAAAGTTTGA
3180483
3180484
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CTTACCCCTTTGGCATCCACTTCACCGTTGGAGAATT
3180550
3180551
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GTTGCCCGGAATCTGCAGACCATCATAAAGCTGGG
3180615
3180616
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CTACACGAACTGAAAGTACACGGTCTACCTTCACAG
3180681
3180682
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TATGTCGATTAGCTGACTTGTGTAGATCCCCTCTTTG
3180748
3180749
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CATGGCGCTCCCTAAATCCAAATACCGGTACTGCT
3180813
3180814
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GGTCTCCTGAGCGATATAATCCGTCATATCCCGGG
3180878
3180879
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TGATAGAGTTGTGGATTTTCAACCCGGGGATGGGT
3180943
3180944
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CACCATCCACGGCGATCTCCGGAATGGGAACTGCAG
3181009
3181010
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
AGGCATCAGCGCAACTTCATCAAACAGAATCCCGGC
3181075
3181076
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CAATGCGCTTTTTAGCGCAGGAATACTATGATAACGG
3181142
3181143
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TCAAATCTGCGCTACAAGTCTCACACGGATCCCCG
3181207
3181208
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CAAGCCAACCCTCCTTAAGCCGGGGGCAGAGAAGCT
3181273
3181274
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
AATACTGGACTACATCGGCAGACTGGATCGGACAGA
3181339
3181340
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GGCCAAGAGTGGAAAGAGCTGCAGCATAAAACTTACT
3181406
3181407
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TAGATTGACTGGAGGGAAAGAGAATGAGCCGTGAGAT
3181473
3181474
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GTGGCAAAAGCTGAGAGCAGACGTATTGGATGAGTA
3181539
3181540
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CGGTTCATGGCGGCTCGCGCGCCGCTTTCGGTTTTA
3181605
3181606
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CGATTCAACCTCCCGAAAATTAGTAAGGCAACAAT
3181670
3181671
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GAGGAATTGGTGACTGTTTATCCCTCGGAGGATCAG
3181736
3181737
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TTATAATCAGGTTCACCATACCCCAGCTCTTCAAAC
3181802
3181803
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TTTTTCATTTATTATATTTTACTAGTTAACTAGTTA
3181868
3181869
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
CTTACACAAATATCCTCACTTTCTCCAGATTAGCTTA
3181935
3181936
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TTGGTTCATGATAAATTATACATTTTTTGTTTTCAT
3182001
3182002
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
TAAGACTTCTTTTCTTGTTTTAAGATTGTTCACAT
3182066
3182067
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
GAAGAAAATCATAGAGTAACTGAAACCGGAGAATTAC
3182133
3182134
GTTTCAATTCCTTATAGGTAAGCTAACAAC
3182163
Left flanking sequence : Till position 3179147 (length
bp)
CTTATTACTTAAGTTGTTTTAATTCTATACTAAGCTAAGAAAGTTTTCTATTTTAAATTGTCTTTAGCAG
CACTCAATAAATTTGTGACCTTCAACCTCA
Right flanking sequence : From position 3182163 (length
bp)
CCATTTTACCCGCATTAAATCAGCATCTTCGGCAAGCACCCGAATTTATCCAAACTGATCTTTGCTCCTC
AATCCGCTTACTTGGCCCTATTCTTTGTCG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp