Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_007929_1                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus salivarius subsp. salivarius RefSeq :NC_007929 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_007929_1
DR consensus (36 bp) : GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCNumber of repetitions :29
Begin Position : 120840 End Position : 122773

120840GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTATTTGTGGAGGTTATGATATTTGGATCAT 120905
120906GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTATCTATCGTATTTATCCGCCTTAGGTTTA 120971
120972GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCTGCGATACTGTATATACCTTGAGCAACTT 121037
121038GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGAAAGCCAAATGAATAGTGGTTGGAATAA 121103
121104GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTCTGATAGCCAGAGAAATGAATATTGTAAA 121169
121170GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACGTTTGACTAACGTAAGCAAAGTTAAAGC 121235
121236GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGTAATGAATAGTTAAGTATAAGCGTTTAT 121301
121302GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAAGCCCGTTAATAGTGGTGATACACAGCA 121367
121368GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTATCTCTATGAAGAAATTCAAGCTATTTA 121433
121434GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTGGGTCAATTAACTACAATGTTATGACTAA 121499
121500GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTCACAAAAAGCTATCAAAGAGACTACTGA 121565
121566GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAACCGCTAATGTTAGATATGACGAAAGAT 121631
121632GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTTAAAGCAGTTGGCAAGGTTGGAGATGCAA 121697
121698GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCGAAGTTTTACATTATGAAGCCCAAGCAAGG 121763
121764GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGCGTATGTTGACGCTTATGATGGTTGGTT 121829
121830GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAAATTATATTATAAGGAGTGCGGTTTTGT 121895
121896GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAGGCGGTGAGATTAGTTGCAATGGCTAAA 121961
121962GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACGGTATTAGTGGATCTAGTTCCGCTGGTA 122027
122028GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAAGGGCTTGAGAAACAAGTTTGGTCAGAT 122093
122094GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCACAGCAATTTATAAGTTATCTCGCGATTGG 122159
122160GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCAATTCACACCGCAGTTCAATCAGCTTACG 122225
122226GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTGCTTTACCTTTTAATGTGTCTTTAAGCGA 122291
122292GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAGAAATCACATACAAGCTGCTATATGTTGG 122357
122358GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCTAACGTTGTAGCGTTTCTATACCGGCCAGA 122423
122424GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCCAGATTCCATAATCTTTATCTACGTTCTCT 122489
122490GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGACCAAATTGATATTTTAACACGCTACCACCATC 122555
122556GTTTCAGAAGTATGTTAAATCAATAAGGTTAAGAATGGTTCTGAGCCTAGTTAGAATGACATAGGT 122621
122622GTTTCAGAAGAATATTAAATTAATTAGATTAATATCTTGACTTTGTCTCCACAGTTATATATTCTAATTTCAGAATATATTAATTGACTGTTTTAGAGTGGTTAGTTTAGGTATTA 122737
122738GTTTCAGAAGAATGTTAAATTAATAGGGTCGAGGCC122773
Left flanking sequence : Till position 120840 (length bp)
ATTGGTCAGAGATTCTTTGAAAACTGTGATAATTACTATATTGATGAGGATTATATTGATTGGTACTAAC
GAATAGTTAAATTTTGATTATAAAGTAACG
Right flanking sequence : From position 122773 (length bp)
TAAAATACAAAATATTTCATAATATTTATAAATCTATCAGAAATTTTCTGGTAGATTTTTTTAGTGTAAA
AATTTTTGAGTTTAAGATATATTATGGTTG
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp