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CRISPRs details
NC_008593_2
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_008593_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium novyi NT
RefSeq :
NC_008593 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_008593_2
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
1853852
End Position :
1855193
1853852
TCTTGAATACATCTAATGTTAATGTTCAAC
CAAATTTGAAAAAACTTGAAACTTTTTTAAATATAT
1853917
1853918
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TCTCACTCTCAAGCAAATAAATTATTTAATTATGC
1853982
1853983
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CAATTATGTCCACACTCAATATTATAAAGTCGATT
1854047
1854048
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AATATTAAAGAAATTTAAAAAGAAGAAACATTTATG
1854113
1854114
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAAGATTGTCGAAAAACTAAAAGCGAACACTTGTAAA
1854180
1854181
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AATTGGTGTTGAGCACCAATCTTTAGTTGTTATAGA
1854246
1854247
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ATTGCCTCAATTACTTCGGGGGTTGCTAAATAAGTA
1854312
1854313
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
CTGTGTCAATTCTAAAATCTGATTTATCCATTCTT
1854377
1854378
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
ACAAACTAGACAATATAAACAAGAAATTTCAAGTA
1854442
1854443
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TATTGGTGGGATAGTGAAGATGCATGTATTAGTGC
1854507
1854508
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AATTCAAAATATTAGACCTGTAAATTTCTTTTCC
1854571
1854572
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TGTAACAAAATTATATTTTTTTCTTCCTGGGAGTTA
1854637
1854638
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AATGGCTACTAATAAAAAATTTAACTTTACAATCGA
1854703
1854704
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TAATTTTACGATTGATGATGATAAGAGGTCTATAAT
1854769
1854770
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTCTATTTTTTCTTTTACCTCGTTAGGTGTTTCGTC
1854835
1854836
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAGATAAAACCGCAAGTAGGTGATTATGTAATAT
1854899
1854900
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
TTTCCAATGTTAAAGAGGAAGGAGGACAGAAGATGGG
1854966
1854967
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GAAGTCCAGTAGACAAATGGGGGTGTACTGTGTGACGT
1855034
1855035
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
AAATATGTTCCAATCGAAATTGGAACAGATGAAGT
1855099
1855100
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
GGAAATTAAGTAACGAAGAAAGTGTCCAAATAGC
1855163
1855164
ATTTAAATACATCTCATGTTAATGTTCAAC
1855193
Left flanking sequence : Till position 1853852 (length
bp)
TTTTTATATAGTATTACCACTAAACTGTGAAAATCCAGTTTTGCTTTTTTGTCTATTTATGAACAATATC
TAATCTTATAAAGAAACCTTATTTAATAAA
Right flanking sequence : From position 1855193 (length
bp)
TACAGTAAAATAGCCATTCCTTATTTTCATTATACCCTTGGAAGTATTGAAAATAAAGACTTTCGTTAAT
TTTTTCCCAACCGATTTTGATTATTTAATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp