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CRISPRs details
NC_009012_1
Flanking alignement tool
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NC_009012_1                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium thermocellum ATCC 27405
RefSeq :
NC_009012 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009012_1
DR consensus (30 bp) :
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
52
Begin Position :
716798
End Position :
720272
716798
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAAAACAAAGGAGAATTGTAAATGGAAGAGTATTTGA
716864
716865
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCGAGATTTTGGAACTTTGTTTCGCCATTCGTGTCT
716930
716931
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCCGCAAAAGAGAGAATCAGAGCTGCCGAACTTTTGG
716997
716998
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGTTTCATGGATTTGATAAGTTCAAGCTCTATCTC
717062
717063
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GATTCAGAATTGAACGAGTACGTCAAAAGCGTTTTA
717128
717129
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAGATGAATCAAATAGTTCTACTGGACTTGGAGATAC
717195
717196
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAATAAATCTAAAGGGTATGCCACGGAAACGTTATA
717261
717262
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCCAGTATGGAATGGCGGTGGAACTGTCCGGCTGGC
717327
717328
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCTCTAACAGTAATTCAATTATTTTTGTATTCATTTG
717394
717395
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGGGCCGCGCCTATTTGCGTGGGAACCCTTATAATGG
717461
717462
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGGTACTGCTGTGGTTATCGACGAGATTCAGACTTG
717527
717528
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACGGAAGAGAAAAAACAGCAGATAATACAAAGCGTA
717593
717594
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCATTTTTTTCACGACTATACAATATACCATTTGAAT
717660
717661
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGGCTGAAAGGTTATAGGTTGAAAGGAAAAGTCCC
717725
717726
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTCGCCTTTTGGCGGTTCGACTTTTGCCGCTTTCA
717791
717792
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GAATTGCCATTAAGTCTTTGGTTTCTTGTCTTGTCATG
717859
717860
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACAGCCTCCTTCATGCTTTCTCCTTTGTCAGCTAACTC
717928
717929
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGGCTGGGGTGAGTGGGTTGAAGTAACTGAAGGTG
717994
717995
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTATTTTTAGTACATCATTATTTGTGATTATTCTA
718059
718060
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTGCCCTCTCCTTTCTTTTCTTTTGTTTGTTTTAGCG
718127
718128
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTACCTGTTGAGCTTCTGCCACTTGTTCTAATGTA
718193
718194
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTTCAGCCTCCTTTCTAAGCAATGTAATAATAAAA
718260
718261
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTCATAATCTTTAGGGGTTCTTTTCTTCATATTGTCA
718328
718329
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CAACACTCCTTTATTATTATTATTTTTCCTGCCTTTGC
718396
718397
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAGGCCAGCTCGAAAAAGCCGGCGCTAACACCGAAG
718462
718463
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATGTGCCTCCGCCACGTCTTGTTATAATTGCTTCTCC
718529
718530
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CATTGTTGCCTAGTTGTTTTTTTGGTTTTACTTCTC
718595
718596
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTGCCGGCGGCAAGTCTGAAGCGCCAAGAATTGACCG
718663
718664
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGACTGTTCGACGTAGACGTCGACAGGAGGAAAGA
718729
718730
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCTCAATTTCATTGTATCACCGGAGCAGTGGAGCGT
718795
718796
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CAGAAAACTTGTGAACTACCGCCACTTATAGAAGTG
718861
718862
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTTCTGCAACTTATGTAAACATGTAGTCGAAATCA
718928
718929
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTATCATGTAAACGGTAATGCATCCCATACACGCT
718994
718995
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCTCAATTTCATTGTATCACCGGAGCAGTGGAGCGT
719060
719061
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCCCATTCAAGAATATTCACTGCTATTCACCTTCTT
719126
719127
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATAATTCACATAATGCAAATGTTGCACAACTTGTAT
719192
719193
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGATAAGCTAAATGTCAACGCTGAGATGATGGTAA
719258
719259
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATCCCGCCCATTCGGCTGCCAAATCAATTCCGCCTA
719325
719326
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATTGTGCCAAGTGTCAATACTTTTGGTACAATATTT
719392
719393
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CAAATAGGTCTGTATACATTCTATTTTGATACAAGT
719458
719459
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTGGCGACAGAACGGCGGGAATAGCAGTGTTGCA
719524
719525
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATGTAACCAGCCCATGTCATTTCTGCCTTTTGCTCCA
719591
719592
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGAGGATAAAATACAGCAGTACCTTGAACTAGATGAG
719658
719659
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATAAAACTATTTATTTTTTGTTCACAATTGTGTACAA
719725
719726
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAAAATGGCGAGCAGGCAGGGGGTTAGGACCCACCC
719791
719792
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAT
CGATTTTGCAGACAGTCAAGAAGATGCAGAACGTAAAC
719859
719860
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAT
AGCAAATATTTGATTCAAAAATAGAGCTAGTAAAGAAT
719927
719928
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAT
TTTTTCAAACTTGCAGGGCTAGGCAGGAATCGAACCTGC
719996
719997
GTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGACAAATTGATGCACGTTTGTATCGTACCTATGAGGAATTGAAACTCCCAAGTATCTGTATCTAACTGATATCCTGCAGGACCT
720111
720112
GTGTGTATCGTACCTATGAAGAATTAGAAT
TAAGTATCATCTATATAATCAAATCTATTATAACCA
720177
720178
GTTTTTATCCTAGATGTAACAAAATGAGAC
TTAATAACTATGATGCCTTTAGCAATTTCACTTCT
720242
720243
GTTTCTGTTGCACTTGTGATGAATTGAAAT
720272
Left flanking sequence : Till position 716798 (length
bp)
AGGATTATGAATAGTTTGAGTGATTTTTTTTATTTTTGTTATTGATTTTTATTTTATATGTTATTAAAAT
AAAAAGTAGGAATTATGCAGGTTCTATGGG
Right flanking sequence : From position 720272 (length
bp)
AGGCAGTAAATCTAATTTTATTAATATACAATAATTGCCTTTCTTGTACCTACAATAAAATAGGACAAAG
TTTTGCCTTTTGTCTTCATATACTTTATAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp