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NC_009012_2
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NC_009012_2                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium thermocellum ATCC 27405
RefSeq :
NC_009012 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009012_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
97
Begin Position :
1712609
End Position :
1719089
1712609
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTACATTGAAACTGGCAATGCTACAGAAGCAGCA
1712672
1712673
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTATCTTTGTCAAACAGCAACCACATGAAAGCGTCGGCAA
1712742
1712743
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATCTACTATAAGTCAGTATGAAACATGCAAAAGAGAAC
1712811
1712812
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GGCGGTGTTGGTGCACATACAAAACTTCCAAGCACA
1712877
1712878
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CACCTCATATGTTCAGGCATACATTTGTTTATATGGCA
1712945
1712946
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTTCTTAGCCTGCCACTGCTCCCATCTGAAACCTT
1713011
1713012
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAAAAATATCTTCGGTAATTGCATCCGTTTTAATTTC
1713078
1713079
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTTTAAAAAACCCATATTATATCCTCCTTTAGTTTTC
1713146
1713147
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACTTTGCTTAAGTTTTTCATAATTATCAGATTTATC
1713213
1713214
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGTAACCGAGAATGTCCCTCCAATGTTCTAACTTT
1713279
1713280
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTGATTGCAGACCCTGTTATTATTCAAGCCGCTGAAA
1713346
1713347
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGCCGGATTTAGTGAGGCTTTTGGTGAGTCTAATGTC
1713414
1713415
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATAAACCTCAGACATATGTCACAGCAAAAGGCGTTTCCT
1713483
1713484
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCCCAAAAGGTAGCTGTAGCTGTTGCTGGCGCAATT
1713549
1713550
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTTCCCCAGGTGACTAATTTCAGGAACTTTTGTTAATG
1713618
1713619
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTTGATAAAATAAACAATTTTTCTGTTGTAGATA
1713683
1713684
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGATGTGACTGTTGTGGTTCTCTACTGCTGCGCCTT
1713749
1713750
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTCAAGTCTCTTTTTTTTGGTGTTGTGCTTGCGAGC
1713816
1713817
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTCTATGGTCGGAGTGACTGGATTTGAACCAGCGACCTC
1713885
1713886
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGGCGAAATAGGTTATAGAAAAATAAGTAATATAAC
1713952
1713953
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AACAGGAGCAGGAAGACAATGAAGCCATGCGCCAGGGC
1714020
1714021
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCATATCACCAAGTAAATTTGTTTCAACTCCGGCACC
1714087
1714088
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AGAGAAGGGTTTGTAGAAGACGACTTTTTTACTGTCA
1714154
1714155
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGACGCTGACTTTGCCGAGTGTGAAGAATGGCTGA
1714220
1714221
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTCACGGGAAAGGTTCTTGCTGTAATATTCGGCCATA
1714288
1714289
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AGGAACAGGACTTCATACAACGTCACCGTTGAAGTG
1714354
1714355
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAAGCCATCGGGCATGACGAACCATTATCGCATAAAC
1714421
1714422
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATCTCCAATCCACCTCCGGTATGCGGCTGCGTCTGC
1714487
1714488
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAAAGCTCTGGTCGGTAAATGTGCGGATTGGTCGCTCTGC
1714557
1714558
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AACTCACCTTCTCCCCATTTACCGGACAAACTAACCG
1714624
1714625
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GGTCTAGCTGTGTACCAGAAATACTGGCACAGCTTTTC
1714692
1714693
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GGACTGGCTGCAACCTTGAACATAAACTTGAGTATG
1714758
1714759
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GAGAGGCCTTTTGGCCGGAGGAAGTTGTGGAGGTG
1714823
1714824
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCGCCATATCTACCACATAACCAGCGGTTGTTGCCAAT
1714891
1714892
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATAGCATTTCTTGAAAAAAACCGTAAAGAGTGGGGAT
1714958
1714959
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTTTTTTGCAATTCCTTGTAACCCTGCTTTGCTACTCA
1715027
1715028
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACCTTTATTAGTCGATACAACACTTAAAGTCTATGACAA
1715097
1715098
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CATACAGCGATGGTAGAAAGGTGAATATTGCTTCCT
1715163
1715164
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTGCCGCACTGCCCAAAACCAGCCCAATTTTTGAACCCA
1715232
1715233
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTCGACGTAGAAAATGCAATATCTATCGGGGAATGGTACTT
1715303
1715304
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGAACATTTTATGCTCGTAGGGTACATCTTCGCAGA
1715370
1715371
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CACGGCAGCACAACCAGCCGCACGTCTGCTTTGGCTT
1715437
1715438
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGTTTCCCACATCTGATTGAGTTGTTTGTTGATA
1715502
1715503
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGCAATGATTTCGAATTCTTTGTAACATTGACTTTGG
1715569
1715570
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AACCATAAAAAAGTAAACTGAACCATAAATGATACA
1715635
1715636
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGCCCCATTCTTTTCTTCGCTCTCCTTCGCCCATTAG
1715702
1715703
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ACTTTTTGTCTTCACCTACCATGTCCATATTCGTCATAA
1715771
1715772
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CTTTTATAAATTGAAAAGGAGGATAAGTATGTCAAACA
1715839
1715840
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACCATCTGAGGGCTATTTTGAAAGGTTCGTCAGTG
1715905
1715906
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCGGTATGCACAAAGAAGTACATACCGCAATATCTCTC
1715973
1715974
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCTGCCATTTTGACAATGGTGTTCTGCTGATCTGC
1716038
1716039
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCTCGCTCGAATAAAATTGGTACATCATATTTTTC
1716103
1716104
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATAAAAAATTTAGCATACTTTATATTGACCTTGAAGCG
1716172
1716173
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAGACATGGATTATGTGAACGTTGTGGCAGACCGGGAAAG
1716242
1716243
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GACTAAGTCCTGCATCAGATGGCAATGTCGGTTCAG
1716308
1716309
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAGAAAACTGACAATGCAGAAGCACAAAGAGAAAAG
1716374
1716375
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTCACCTCCTTTTTTCATGAACTTTGGTCCTCCAAG
1716440
1716441
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATCATATATGATTCATGCAATGGATGTCAATATGGATG
1716508
1716509
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GGTTTATAGGCTTTTAGTTCTCCGCTGTGTATCGCTC
1716575
1716576
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCGGCTTCACCTATCATCGCGAGAGTCGGAGCGTCTAC
1716643
1716644
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCTGAAAATCTTCATTCAATGCGGCTATGCCACTGC
1716709
1716710
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATAAATTTTCCTTTTCCATTTATTTACCTCCTTTT
1716775
1716776
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCAAGCATTTCTTTCGGTAATGGTTCGCCGAAATCAATC
1716844
1716845
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATTTTCCTCCTTTATATGTATAAAAGACCTTTATAA
1716910
1716911
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCCATATATACACCCCCTACAGGTAGCTTGGGGCAAACTC
1716980
1716981
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATCTAAACGAAGAACAATTGCAAAAGCTAAATGACT
1717046
1717047
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CATTGAAACCGAATGGGTTGAAGAAGGCGGTTTCTTTAGA
1717116
1717117
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACTATCTGTAAAATACTTGTAGCCTTGTCTTTTAATT
1717184
1717185
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CCAATCCATTCTTTCCGCATCTTGTACTGCTGATACC
1717251
1717252
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTGTATAAAGTGAGGTAAATAGTAAATATATATGC
1717317
1717318
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAATCAAAGAATCGGCAAAAGGAAAGACATACGAAATTG
1717386
1717387
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGCCTGCAATGTTCTCGATGGCATTGTCGAAGATGAG
1717453
1717454
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCCTCCCCTTGCCATGTTATGGTTTCGCCCACTCTTT
1717520
1717521
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCACCGTTAGGAAAGTTGATAGTGAACACGCTGTTA
1717586
1717587
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACAATATACACAAGCAGAATTCTTACAAATAATAA
1717652
1717653
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CAAAAAGGAGGAGTAGTTCGTTTTGAGGAAATAGACGC
1717720
1717721
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AGTGTTCTATATGTATTTGCTTTTCCTAAGCTTTTTG
1717787
1717788
GTTTTTATCGTACCTATGAGAAATTGAAAC
TTTGTATAAAGTGAGGTAAATAGTAAATATATATGC
1717853
1717854
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGCTTTTTGCTACTTTGATTTACGCCATTTATTATTCAAT
1717923
1717924
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGAACTGCACCTATCCGCCAGTTTCCAGTCATACTGGAT
1717992
1717993
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGATTTTTAATGTATTGTAATATTTCCATTTCCTTTTT
1718060
1718061
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TGATTTTTAATGTATTGTAATATTTCCATTTCCTTTTT
1718128
1718129
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GAGCCGGACGTGTGAAAAACTATATCCCGGAAGATC
1718194
1718195
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TAATTAATTAGCTTAAATAAGCTATAATTAATATTGA
1718261
1718262
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AAATAAAATTGTAAGAATGAGTTAAGGGGTTCAAAA
1718327
1718328
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TTTCCAGGCTCAAAAATAAACCTAATCATTGTTAAAACC
1718396
1718397
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACGGACTTGCAACCGTCTATAACTTGTTGTTATAG
1718462
1718463
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
AATCAATTTTGCTTTTAAATAGAGTTTAATGTATAC
1718528
1718529
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCATGTTTTAAACTGTCAAGTATTTTTACTTTACAGA
1718595
1718596
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
CGGTGGATTAAATGAGCTTTATAATCTGCTGGATAA
1718661
1718662
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
ATCAAACCCTGATAAATAGACGGCTAGATGCCATTT
1718727
1718728
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TACTTGAGTCTGTCCTTGAAGGCATGGCTGAATACT
1718793
1718794
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TATAGCAAAGGACAACGAAGTAAAAGAAAACTGGAA
1718859
1718860
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
TCAAAAAACACTGCGTAACTCATTATGCATAACTCC
1718925
1718926
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GCATCTGTCAATTTATCACGGATTGCAGTATCGATTT
1718992
1718993
GTTTTTATCGTACCTATGAGGAATTGAAAC
GTGAATTCCGATGCTGTTTCCCTTTCGGGTAAGTTTT
1719059
1719060
GTTTTTATCGTGCCTATGAGGAATTAAAAC
1719089
Left flanking sequence : Till position 1712609 (length
bp)
CTGATTTATAGGTCTCTTGAGAGAGTTTTTTTGTTCTGATTGTTGATTTTTGTTTTATATAGAGTTAAAA
TATAAAGCAGAAGTTTAGCGAGTTCTATGG
Right flanking sequence : From position 1719089 (length
bp)
ACAATAGATACCGTCCCCGTGCTAATTTCATCATAGTTTTGTTGTGCCTATAATATAAATTGAAATTAAT
GCAAATATTGACATATCCTATAACTATTTA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp