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CRISPRs details
NC_009089_8
Flanking alignement tool
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NC_009089_8                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 630
RefSeq :
NC_009089 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009089_8
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
Number of repetitions :
9
Begin Position :
1756278
End Position :
1756833
1756278
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
TATCTATTATTGGTATATTAAATGATTCTAATAATTC
1756343
1756344
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
ATGTTCACATTGACAGCTCAAGATAAACATGGAATT
1756408
1756409
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
TTAAATCGTTTGATTGGAAGTATAAATTATAATGACC
1756474
1756475
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
GCTGAAAGTTTAAAAGTTTTAACTATAAATTCAGTTG
1756540
1756541
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
TCTTTTTCTAATGCTTTTTTTACATATGGAGCTAAC
1756605
1756606
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
CCATCAGCCTTATCCTGTGCAAATAATAGTGCCAAG
1756670
1756671
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
AGGAGATAACTTCTATTAAAGATAACTTTGATGTGGT
1756736
1756737
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
CTCAAAGTTGGACTAGCTTCATCTTTTAATTTTACAAGT
1756804
1756805
GTTTTATATTAACTATATGGAATGTAAAT
1756833
Left flanking sequence : Till position 1756278 (length
bp)
AGTGTATGATAAGCGTTATCAATTGCACTATTGCTCGTTCACTGCAAATTTAAGAGAGTTGTATACGTGT
AAGTATTGAAAATACTAAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1756833 (length
bp)
TTTTATAATTTTTTTTAAGGTGTTATTTTATGATTATATAGTTATATTAGCATACAAAAATATAATAAAA
TTACACTATATTATAAAAGTCAAAAGGTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp