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CRISPRs details
NC_009089_9
Flanking alignement tool
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NC_009089_9                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium difficile 630
RefSeq :
NC_009089 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009089_9
DR consensus (29 bp) :
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
Number of repetitions :
16
Begin Position :
1935482
End Position :
1936495
1935482
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CTAGAATTAGAACTCATTATTAAAACCATTCTTGCAAG
1935548
1935549
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAATCTGACACATACAAAGTTGAACCTAGTGGTACGG
1935614
1935615
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAAGCGTTCTTAAATCGTTACTTAACTCTTGCAAAT
1935680
1935681
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGGTATATCATACTCGTGCATTGCCTGCTCCACATT
1935745
1935746
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
ATACAACCATATATTTACCAATTATGTACTTATGAAG
1935811
1935812
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTTTTTAACTTTTCAGTTCTCACAGGCGTTTCATCT
1935876
1935877
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCATATTCCAAGCGTTTTGCTTACACTTAATAGAA
1935941
1935942
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
AAAATTAAATTTCATGCTCTTAGACATACATATGCAAC
1936008
1936009
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TAGATTGCTTTCAAATTACCTCTTGTATAGCGTCTT
1936073
1936074
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTGCTCCGCTATGCCTTGCGCTCTCTAATATCGCTTA
1936139
1936140
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TGAACTTTAATCGGTTTTATACAACAATATAACGC
1936203
1936204
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCACACATGAGCAATATCGAAACAGGCAAATCTACAG
1936269
1936270
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TTCGTAAAATAACAATTATCTGGAATATGAGAAGTT
1936334
1936335
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
CACTCTTAAGTTGTGACCTATCTGATATATGATTAAA
1936400
1936401
GTTTTATATTAACTATGTGGTATGTAAAT
TCAATATCTATATTAAGTTTATTTTTAAAAACATCTT
1936466
1936467
GTTTTATATTAACTACGTGGTATGTAAAT
1936495
Left flanking sequence : Till position 1935482 (length
bp)
GGTGTGTGATAAATGTTATCAATTGCACTACTCATGGTTCACTGCAAATTTGAGAGAGTTGTATGTGTGT
AAGTACTGAAAATACTTAGTTTATTTTGGG
Right flanking sequence : From position 1936495 (length
bp)
TTGCAACAAGTATAGGTAAAATACCCCAATAATTTATACAGCATTTTATCCTTTAAAATATAATTATTTT
TTAGCATTTGTAGTAAATAATTACCAGATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp