CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009437_7
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009437_7                                                                                                                 
top
Strain :
Caldicellulosiruptor saccharolyticus DSM 8903
RefSeq :
NC_009437 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009437_7
DR consensus (29 bp) :
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
Number of repetitions :
59
Begin Position :
344075
End Position :
347921
344075
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATAGAGGTACCAGGACAAGCTTGGCTCGAAGGAGAAG
344140
344141
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTCGACATCTCAGAAGATTACGGAGCTGGAGAAAATCC
344207
344208
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CACTTTTTATCTTTCTATAATCCGCTTCTTGCATGT
344272
344273
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AGATTTGAGACAGATCCAGGTGAGCAAGCGCAAGTTG
344338
344339
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GAAAGCTTTTGGGCGATGCTTTTATCGAGGTTGTCAA
344404
344405
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ACTGCATCTGTTACCTTGAATTTATTATGCTCTATAAA
344471
344472
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TGTGAAAGCAATTGAGCAGACGTTTGGGGCTGGACAA
344537
344538
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTCCTGAGTACACAACTCCTAAAACCTTAATGGC
344601
344602
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TATGAGTATAGACGCAGTGTAATAAAGTCAAAAATT
344666
344667
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTCGGCAAAAACAGCATTCATGACATCTTATGCAATGA
344733
344734
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTTTGCAAGGGATAGATACGACAGTGCATATTATAAG
344799
344800
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GGATATGGGTGTATTCGATTTTACTTACAAGCTCGG
344864
344865
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AGTAGATAGTCTGTTGTAACAGAAAAGTAATTCGCTA
344930
344931
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TGGGCTGTGGCCCGAATGATACTCAACCCCAACTGTCC
344997
344998
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CTTTCTTTCTCTTTTCTATTTCTTCAAGCTTAGGTCGC
345064
345065
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CTTCGCATTGTGCTTGCTTAACCTCTTCTGGAACA
345128
345129
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GCGCTTAGCCCGGGTAGTGGTAGTTCACCTTTTTCTG
345194
345195
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CTGCCCAAGGGGTGGCGGGCCGGCGGAGTAGATTG
345258
345259
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GTGGTTTAACAATGCTATCAACAACGTGAAGCAGGCC
345324
345325
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TGCAAACTATCTGTTATTGCCATTGCAACAATTTCGA
345390
345391
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CTTTGAAACTTGCCCAGGTAATAATTACCTGCTTTAA
345456
345457
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTGCTGCAAGTCATAATCAGACTCCTTGATGTCGCCCCA
345524
345525
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTAAGCCTTGTTAGCAGTAATTACAACCAAAGCCTC
345589
345590
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AGCTTTGCACAGCTGCACACAAGAGCAATTGAGGT
345653
345654
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GTGATTTGGGATAGTCTTAAAAGTTTAGTAAGAATAT
345719
345720
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTCCACTTTCAGCTAAACCGCTTTTAAGCTGTCCAA
345784
345785
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CATCAATCAGCTGATAATTCAAAGCAAAATTGATGTGA
345851
345852
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTCGCAGTTTTTGAAACGATACATAGCAATAGCTCTA
345917
345918
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTATTACTCACCTTCCTTTATGATTTCAAAATTGCAA
345983
345984
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTTTCATTGCTGGGTCTAATCTCATTCTGATTCTGTTT
346050
346051
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTTATCGGGTAAGAGATAATCTCGTTGGTATATACA
346115
346116
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTACTACGTTCAAAAGGCAGTTTCCTTTAGTATTGT
346181
346182
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TGTGCGAGACAGACTTGAAAGAGAAAAGCCTTTAGAA
346247
346248
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CAAGCTGGCTTGCCAATCTCAAAACCTTTTTCATTGC
346313
346314
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTGTACCCGGTAACTAGTACTCTTCCGTCTTTCTCG
346379
346380
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TCTTTCAGAAGCAAAGAGAACTATTGGAGAAGTTTCA
346445
346446
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CGGTTAGAACCGTCGGGTCCAATCGGACGGTCATTAG
346511
346512
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATACAACTCAAGCAGTTTTTCCTGCCTTTCCCACTCTT
346578
346579
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CCCCAGAGCTTTGATTTTAGTTCCGGGAAAGTTTGA
346643
346644
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GAAGAGGGACAGGCCAGGTTAGCTACAAGCCATACC
346708
346709
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AAATTCATCTATCGTTAAGCCCATCTTCAAACATTG
346773
346774
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTCTGTGTAAAGGATAGTGCCGTTTGCGTCGTAA
346837
346838
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AATCATAGGCTTTGATGAGACTTTTCCAGGAGCTACA
346903
346904
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CCTAAATATTTTCCCTGAGCGGCTATTTGCCATCAGG
346969
346970
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTTCAGGAGGGCGTAGGCCTCTCTGCCCCTGCTGG
347033
347034
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CCGTGAGGTAAGGCAAGAGGTCGTCAAGTTTATAGATA
347100
347101
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTATTTTTCGCAGCTTCCAGAACGGCCTGTGAGGAGA
347166
347167
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TATACATGTCGTACAGTTTTTGTGCGTCCAGCCCGGA
347232
347233
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GACAGTAAAGCTTGCAATTTCGCCACGATTGCAGACAA
347299
347300
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GATGTGGCAGGGAATCTCCTCTACAAGTGATGAGAGCA
347366
347367
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTGGAAGAAATCAACCGGCGGTTGACCTACACCCT
347431
347432
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTGATGTTCCAATTTCATATAATCCTCCGTATCAAGA
347498
347499
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TTGCGACTTTTATTATTCCATGCTCAAAAAGTTTTGA
347564
347565
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
ATTACATTATATCAAAGTGGGAGGGGAAATGCAATGTTA
347632
347633
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
AGAATAACAGCAGGGGAAACAGGAAGTAAAGAGCAA
347697
347698
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
TCTTATTTTCTTTTGTTTGCTTTCCTGCAACAACTC
347762
347763
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
GTATTGCTATCGAAAAAAAAACATATGAAAAATTAA
347827
347828
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
CTTTTCAGTTCAAATAATATCTCGTTCGCAAGGAAA
347892
347893
GTCTTATCTGAACTATGAGGGATGTAAAC
347921
Left flanking sequence : Till position 344075 (length
bp)
CTATCACCCCTTTGCTGCAAATAATATTGATTGCAAAGTAATATGGGATAAGGTATAATTGTAGGTAGTA
ACTGAGTTACAAGGTTTTTTATAAAAGTGG
Right flanking sequence : From position 347921 (length
bp)
TTGCAGCTTCGCTGTTATTGTCAATACCTTTTCCCCACTTTTGATAATATTTTTTCCCCACCTGTTTTCA
AAAAAAATTTAATTATCATTATTTAACTGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp