CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009440_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009440_3                                                                                                                 
top
Strain :
Metallosphaera sedula DSM 5348
RefSeq :
NC_009440 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009440_3
DR consensus (24 bp) :
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
Number of repetitions :
56
Begin Position :
1097313
End Position :
1100875
1097313
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGGCGAAATGCAGAAGATGTAGTAGCAAAGACAGCTGTGA
1097377
1097378
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CAACTCTCATGATTATAATCCCTCCATTTTAAAATGTATT
1097441
1097442
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAGTTTACTTCAGTTAATGAGCAAGTCAGCGCAGTGCTAA
1097505
1097506
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATATTTACGGGTAAGACGGCGTTAACGAAGCGTTAGG
1097568
1097569
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTTTAAACGTTACAACTCTCGTTTCCAAACACCTCGTTTGT
1097634
1097635
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAAACGAGACCTTTGGCTAAATAAACCGCACCATAGATAT
1097698
1097699
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTATGAAATTGTCGCATTCGTATGCAAAATATTTCTGGATCT
1097764
1097765
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACATATCCTTCAATTGTGATCTAGCGTATGCTGGTAGT
1097827
1097828
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTTGGATTTTGATAATTTTCTTTTCTTTGTCATAATAAT
1097891
1097892
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TATAGTTAAGTCATTTTTTCTTCTTGTGGTGGTATTACCTAT
1097957
1097958
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TACCAATTTCTGCTAATAACGTGAACGTACTCTCGCTGAG
1098021
1098022
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAACTTATCCCCTACATGATTGCGAAAAAACAACAAT
1098082
1098083
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGTTTTTAAGGACCTGGAGGCAGTCCGCCATTTACCCCAC
1098146
1098147
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TGAGAACAGCTGTCTTCACTGCTGACCATCGAGCGACCT
1098209
1098210
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTTTCTTTCTCATACATTACTCTTATTAGTTTACTAACAA
1098273
1098274
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTCTTGTTCTTCTCTCTGCTTTACGCCTTCTTGTTCTTCC
1098338
1098339
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTGTACGTGGGTCAATAAATGTCACAATCGCGTACTTCTT
1098403
1098404
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATAATAATCAACGAGGCAAACTCCATGTTCTACAAACCA
1098466
1098467
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTAGGCAAACGATACTGAGACACAGCGGGACTGCAG
1098527
1098528
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGGAAACACTCCGTATCAATCCTTTAGACTGCAACTCCTCA
1098593
1098594
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AACATTAGTGTAAAGCCTGCAGCGTTTGCTGGAAGCACGG
1098657
1098658
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTCGTCCTTAAATTTCAAAACTTCCATGTAGCTCGCCCCCTCT
1098725
1098726
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTTATGTACACACCACCTGAGCTAAGGAGTGTCTTAATCT
1098789
1098790
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AAATGGGACGATGAGGGTGTTCAACAGATACAACACCACAG
1098854
1098855
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATTATATATAATATATGAATAATAGCCCCCGTGCTTCGCGCCTT
1098922
1098923
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCTTTTGCACTATCCATTCCGACCACATCTCTCGGCTTCGATAC
1098990
1098991
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTGACGACGTGCTTACTCTTCTTTCCAGTTCTTGTTACTT
1099054
1099055
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TTATCGATAAAATCGTAAACGATTTGTTGCCTTATTACGTGAA
1099121
1099122
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACACCTCTACTAACTTTACCAAAGCCTATCATAGTCCCAACG
1099187
1099188
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CCTTTATTCTTGCTATTAGATCGAATAAATCGCTCGCG
1099249
1099250
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAGTGGACACTATTGATCACCTCAGGGCTAGATATATGCCT
1099315
1099316
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TCATTGAAATACTCAGCAACTGTATCCCTTAACTCTTCCTTATTA
1099384
1099385
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
AGTATACCTGGGAGTGCTGATGTAGATGCGTCACCGACCACGTT
1099452
1099453
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ACTACGGGTCTCAAGGTAGTCGGTGTTCTTCTAGTAGCTG
1099516
1099517
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
ATCGTACTTTGCGCTGTACCTTATGAACAGTGGAATGTCCC
1099581
1099582
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
GTAAAGGGGTTGTGTTTTACGTTTTGAGTGGTGTTTACGAC
1099646
1099647
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
CTAAACATATATGAGTTCATTTTTTCCGACTTTCCTAGA
1099709
1099710
CTTAATCTCCTATAGAGTTGAAAG
TAAAGTGATAGAATAAAAGCTATTATTCCAACTATTTCT
1099772
1099773
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CCTTGGCAACTCGGACCCCCTCAAGCGTACGGAAGAGATT
1099836
1099837
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AAACTCTCGATCAAGACATTTATTGTCTCTTCATCTATCT
1099900
1099901
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCTAAGGAGGATAAAGAGGAAGATTGGGCATTTTGTTCTGT
1099965
1099966
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TTAGTGTTTACGTATGCTCTTTGTTGAGCTAGTTGTTGAT
1100029
1100030
CTTAATCTCCTATGGAGTTTTCAC
GAGGATGATTATAAGCTCAGGGAGAAGATTGT
1100085
1100086
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
ACGTAACCTGTAGATGTGTAACCAGGCTCAGACGAGAA
1100147
1100148
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GAACATCCGCCTTATCGTTATCTTTCTTCTTGAACAGGAAC
1100212
1100213
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TCAATTTATCATACCTACCTAGTCTTACTAAAGTACAGT
1100275
1100276
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTGGACTACCTGAAGTAATCGAGCTCAGTGGAGGCA
1100336
1100337
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GTTTTCACGTGATACTTTATGATGTCGTTGCATCTATCGA
1100400
1100401
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGACATAAGGCCTTGGCCATGGTCTCAATATCCCATTCTT
1100465
1100466
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
GCACTGACGTTTACTATCTGCAGCCCACTTGGTGACTG
1100527
1100528
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAT
ACACTGCCTTGATGAGCGGGATGCTTCCAATTCTCCCTCT
1100591
1100592
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGGATTCTTCTAAATGCTGTGACAAATGTTAGAATTAGATA
1100656
1100657
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
CAACGAAGAAAGAGTCGAGAAACTAAGCAGAGTCGAGCACT
1100721
1100722
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
TATTCGTCGTACGATTCCACTTCAACAGAGTTCACAATAA
1100785
1100786
CTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
AGTTGCTCTAGCAGGAGAAGATCCTGCTCTTCGATTTTGAAT
1100851
1100852
GTTAATCTCCTATGGAGTTGAAAG
1100875
Left flanking sequence : Till position 1097313 (length
bp)
GATTTCATGACTTGGGATAAAAATTGATGATCGTAAGAAGAGAAAAGTATATAAGTTGGGGAGAAAATGG
TAGATGTGTTGAAGAACACAAAAAGTTTCA
Right flanking sequence : From position 1100875 (length
bp)
ATTACACTAAATACTACGTAATATGAATAGGTACTGTGAGACGAGAGTGGACTTTTACCTTTGCGGACGG
TGTTAAATTTCAGAATCAGTATCCTCTACT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp