CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009613_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009613_3                                                                                                                 
top
Strain :
Flavobacterium psychrophilum JIP02/86
RefSeq :
NC_009613 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009613_3
DR consensus (46 bp) :
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
1325548
End Position :
1327108
1325548
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GCTAAATATTTCTTTTATTTTATTTTGCTT
1325623
1325624
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TATTGAACAGCAATTTTCATCAGATGATGA
1325699
1325700
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TACGGCATTCAAACCCCCCATCTATTACT
1325774
1325775
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAGACTTATTTAAGTCTAAAGAAGTGCCT
1325850
1325851
GTTGGTAATTATAAGCTGAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAATGCGTGCGCTGTATGTATTTCGTTTT
1325925
1325926
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AATGTGTCTATTGTGAATACATTACCTACT
1326001
1326002
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACGGAATAAACGGAAACGAGCAACTTATTA
1326077
1326078
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTACAGTTGCTTTAAATAAAAAGTAAAA
1326152
1326153
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AAAACAATCATCTATGTTGCTAAATCTTTT
1326228
1326229
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GAACACATAACAGGACACAAGGCATTGGCT
1326304
1326305
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ACTTTGATATACGACATCTCGCTTACTGGA
1326380
1326381
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAAGTTTTCCTACTTAACCATTTTTTAAAA
1326456
1326457
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATAGTACTTTGATTTCACGTGCGAAAACG
1326531
1326532
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGTGGCAATGTGTATTCAAACACGGATATA
1326607
1326608
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
GGAGCTGGTTCGGGTACAATTACATTAAAT
1326683
1326684
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
ATTCTCTTTCAGTTTTTCGATATTGTTTTT
1326759
1326760
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CTGTCGTACGCTCTAGTATTAGATATATCT
1326835
1326836
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
TAATATTTAGCATAAATTTATAATCGTCCT
1326911
1326912
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
AGTGCTACCTTCGATAATTAGCGCATTAAT
1326987
1326988
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATACAATTTTGAAAGCAATTCACAAC
CACAAATGGGGAATTTGACGAAAACAAAA
1327062
1327063
GTTGGTAATTATAAGCTAAAATAACCCGTTGGGTGTAATTAAATTA
1327108
Left flanking sequence : Till position 1325548 (length
bp)
ATATTAGACCTACCAGAATATCAACACACAAACAGAACTGTTTTTTAATTTCAAAATAAGCATATAACCA
CCAACATATCAAACGATTAACTCGCGGTAT
Right flanking sequence : From position 1327108 (length
bp)
TTTGATGACACTATCCCGCAAAGTGTGTAAGTTAAAAAGTTAGGCTTGGATTTTATAATCTGAGCCTTTT
GTCAAATATAAGATTAAATTGATTTAAAAC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp