Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_009616_3                                                                                                                 top


Strain : Thermosipho melanesiensis BI429 RefSeq :NC_009616 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009616_3
DR consensus (30 bp) : ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACNumber of repetitions :52
Begin Position : 754563 End Position : 758169

754563TTTTCCATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTAACATTGCAATATTGCGACGATACTGGATATGAAATGTA 754632
754633ATTTCCATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACATCTCATATCCAAGCATATGGTTCAAGACAAGGCCTCA 754700
754701ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACACGCAATCGTGGATCAACTTGAAAAAGCCAAATATTAC 754768
754769ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAAACAATAAACGTTGCCAACAAAACGTGGCAAAAAGTTA 754838
754839ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTCAATTATTTTTGATGAAGAATGGCCTGCGGGTATTTTTA 754908
754909ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTGCCGCCACGGTGGCTGAGGCAACAGTGGCTGCCAAA 754976
754977ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAACGAATTGTTGGGGTTCCTGGTTTTGTAAGATAAATAA 755045
755046ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAAATATGTATTTGGAATATTTATGATAGGGTGCAGGACAG 755116
755117ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGTAGTCCCCCCCTCTGAGGGAGAAATCATTTTCGTCG 755183
755184ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACATTAATAAATTGGATGAGGAAGACCTAATCAAACTTGTAC 755253
755254ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTATACTTACCGCTAAACGCAGATTTAGATCAAATAAAAG 755322
755323ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTCTTAGTTTTGAAGATTTTGAAGGGAGTAAAGTTTA 755389
755390ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTGGTGAATATGTAAATATATATTTCAGGAAGATTGATAG 755459
755460ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAAAATGTATTTTAAATTTTTATAAATTTTATCCATCACAGAATTCAA 755536
755537ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAAAAGTATTATGGAATAGGACTTTATGAAGATTTAAT 755603
755604ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGACGAATTTTGGACTAATGGCTGGGATGCTGAAAAAACTGC 755674
755675ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACCTATTTGAACGCATTGTCAAGAGAGTACATCAACTAAAATCT 755746
755747ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTTTTTAGCGCGCTTGGTGTATAACTTACCAATGTCGC 755814
755815ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACACAAAAAATTATCAGGTATGATTCAGGCAACCAAAAACAAA 755885
755886ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAAAGTCCTCTTCTTTTTTTACTTAACAATGGAATCGTTTC 755955
755956ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAAAACAATTACCAATTGAAATATGGAACGATGATGAAACAAAC 756028
756029ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAACGAATTGTTGGGGTTCCTGGTTTTGTAAGATAAATAA 756097
756098ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAGGATCATGTAGAAGAATTAAAACGTAGCATCGAAGAGGTTG 756169
756170ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGGTATTTTTGAGGTTCAAGAGTATCGTTTGAGCGACAATTTAA 756242
756243ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTCAAGTGCAAAGACTGGGTGATTGTATTGAAATTTCTT 756311
756312ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAACATTTTAGGCGCATTTGTTTCTAAGTATTTTAGAGG 756380
756381ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTAAAAACCCCTAACATTGGCAATTTATCAGGTAATGGTGTAACTA 756456
756457ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTATATATTTTATAATTGTGTGGGTTCTGGATATGGACAAATAC 756529
756530ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAAAGCATGGAGGTTGAAACAAAAATTTTTGGCGGGGGTG 756599
756600ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAGAATTATCAGAAGAAGTAATGGTGGACTTGCATGATATTGA 756672
756673ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACATTGATCCAGAAACTGGCGATAAAATTGGCGAGACGT 756739
756740ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAACCTTGCAAAACGGGAAGGTCAATCTGACCTTCCAAATGG 756810
756811ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTGTATTTCAAGAGGATTGATATAGAATTGTTGAAATCCTT 756880
756881ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACCGATGATAGCGGTCATGGCAGAGCAGTATTGACTT 756945
756946ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAATTAAGAAAATTTGCAGGGTCACTCGGGGTGTGACCCTG 757016
757017ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACATATTAAACTGCTAGTCCTCGCAATAATAGGGGACC 757082
757083ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACCATTAGACACAATTTTGAATGTCGCACTTGAAAAGCTTGCAG 757154
757155ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTGATATTTTTTAGTTTTGAGGATTTTGTTAGAAGTAAAGTTTAT 757228
757229ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTGTTTTATATTGTCAAAAAAGGGGCTATAATCGAACCCCC 757298
757299ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAACCAGGAAGCGGCGGGAAGGTGCCATGGCCTGTCGTGTA 757368
757369ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGGATTATATTGTAGAAAAATTAACAGTTGTTGACTTGTAT 757438
757439ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAGAAATAATTGATTTACATGAGGAGGTGGGGTATTATGTT 757508
757509ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTATTTTTTAATTATGAGGATTTTGTTAGAAGTAAAGTTTA 757578
757579ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGGGGATTTCGGTGACAGTTACGATTTGTTTTATATTGTCA 757648
757649ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACAAACAAAACATGCAAGATATTTGGTATTTACTGAAACACA 757718
757719ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGTATTTTAAATTTTTATAAATTTTATGCTTCGCA 757782
757783ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACCATATAATAGCATTTAGCAATGTATTTTTACGAATACTACAAC 757855
757856ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACGAGTTTTATTCCCCTACCTCAAGCGGTGCTTGGGTAGGGGTAAA 757929
757930ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACCTTATTTAAAACATTAAAAGAAGAAGCACAAGAATCTGAACA 758001
758002ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTATTTTGGTTGATCACAGAAAGCCCTTTGCTGAAATTAT 758071
758072ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAACTTTTTATTGCGGCGACGTGCCCTTTCGAAGCAAGACTA 758139
758140ATTTCTATTCCTCATAGGTAGATTCTAAAC758169
Left flanking sequence : Till position 754563 (length bp)
CTTCTTACTTAAAAAGTCAAGTAATCAAATAAAAACCACCCTTAATTTAAAAGGGTGGTTAGGTAACTCT
TTGAATATATATTTCAATCCCTATTGAAAA
Right flanking sequence : From position 758169 (length bp)
CCGTCACTTTCCCCATAAATATTATAACACCCTATTTTTTACGAATGCATTTCCGGGAAGTTTCTAATTT
GTAAAATTATTTATTCATGAGGCTTCATTC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp