CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009633_9
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009633_9                                                                                                                 
top
Strain :
Alkaliphilus metalliredigens QYMF
RefSeq :
NC_009633 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009633_9
DR consensus (30 bp) :
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
Number of repetitions :
62
Begin Position :
2274931
End Position :
2278995
2274931
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GGTGTTACTGGACATAATAAATATTGCACCAGACTG
2274996
2274997
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AATAATTGTGATGTGACTTAAATTATCCTTTGCTG
2275061
2275062
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTTGGAGTAATTTGCAATCTGCTATATAATCCCTCC
2275127
2275128
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTGCATTGGCAAGCAATTCTAAAGCTTCGGTATTATC
2275194
2275195
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTTTAAAACCATTAGAAAAGTCTTGTGGTGATGCAGT
2275261
2275262
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TATTTTGCATACATTGCTATAACCCTCAAATCATCTT
2275328
2275329
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GTGTTAGAACATTGTAGTAAAAACAGTATCGCCAAC
2275394
2275395
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAAGTATTCCGCTATACTGGTTTTGTTCTTCTCAAAA
2275461
2275462
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGATTTAACAGTGTTGATACTAACATCATATTTTACA
2275528
2275529
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATGACTAGGAAAGTAATCACTACGATTGGCATTATT
2275594
2275595
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATGATTAATAGGTCCATCTTCATTTTTATAAAACA
2275659
2275660
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGAGAATATAAGATAGACTTATTCAACGCATTAGATT
2275726
2275727
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CCATTTAGTGGGAATAATATGTTGGGCGGTGAAGAA
2275792
2275793
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AATTGCCCTTGCAAGTCAAAGGTGGAATTTTTTCCC
2275858
2275859
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TGAGGACAGGTGCATTGAAATTCAAAGGGTTAATGG
2275924
2275925
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CAGCAACCACCAATTCAAATCTATATTCAAATAGT
2275989
2275990
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CGCTTTAAGCAACTAACTAAGGATGTAGAACAAAAT
2276055
2276056
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATAGATAGTGAATTGCAAACTATTGAATTGATATTTA
2276122
2276123
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGATATGCCTGTCATTTCAGATAGTTTGGTCATACT
2276188
2276189
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAAGCTAAAGGATCACGTTCATATATATCTTGAGA
2276253
2276254
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CGAAATAGGCAGAATGATGGAAATGTTGTTAGAT
2276317
2276318
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATTACTAGCAAAGTAAATAAGACTAAATTACCTAC
2276382
2276383
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTGGAAGGACTTGGTTCATAATGATAATGGCATTTA
2276448
2276449
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TCTAATGCATTATGCAAACCCTGAATCCAACCAAA
2276513
2276514
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TCCTAAGCATGGTCGAAAATTATCCCGTACTTGTACT
2276580
2276581
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTTAATACTCATGTAATTTACGTTACTTTAGATAA
2276645
2276646
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GTTTGAGGATCTTGCCAGTTTGTTTTTGCCATTTAAA
2276712
2276713
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAACAATAAGGAGTGGTTTAAATTATATTATTATT
2276777
2276778
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAAGAAAACCACGGAGTTAGGTAGGACTCCGTTTGC
2276843
2276844
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTCTAATAAAAAACTGGATCATGAGATCGTGAAGATC
2276910
2276911
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAGGTTGCGAAACTAATTGCAGCTTACTTGAAATTAG
2276977
2276978
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGGTCAAAGGGGCACTAGGGCAAATGTAGATCAAGG
2277043
2277044
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGGGTATGCCTAAAAAGGGCTATATGCGCGAGTCAGT
2277110
2277111
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GGATTTGAGGATGAAGAGTTTGCACTGGGAGACACCA
2277177
2277178
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ACTATACCCGATTCCCAGTGCCAGTGTTGAAGCAAAG
2277244
2277245
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GAGGGAAGAGACTACCACTATCCACCGTAAAAGCAA
2277310
2277311
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATTAGAGTGTCCTTAGACAATGCAATCATCCGAGA
2277375
2277376
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CAACATCTCCTGCTCCATTCCTGATGATCTCAAGG
2277440
2277441
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GTTGACATAACAAAGGATAGTATGCCGTTTACACCTC
2277507
2277508
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CCGCTAAAGGTACCTGTGCCAAATGGGATGTTCCCAA
2277574
2277575
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTGAAACGAAAGGCTACGAATACCCTTACAGAACC
2277639
2277640
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGCAAAT
ATCGCACACCTTGTTTTTAACTACTTTCAATCCAC
2277704
2277705
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AACTATAATACAGGTCGCATTACTTTTAAATCACTAA
2277771
2277772
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TGGCTTTAGTGGTGGGTGCGATTGCAGGGGTTATAGC
2277838
2277839
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATGTGGGAAGGAACACGCACTAAAGCGCAATATGAA
2277904
2277905
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AGTAGTCCTTAGCTTTATGATAGAGATATTTAATT
2277969
2277970
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTTGTTACGCCCCTTTGGTACTTGTTGTTATTTAA
2278034
2278035
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATCAAACTGTAACGTGGCTTAAAAGCATGGGAACAAA
2278101
2278102
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
ATCCTCCTGGGCTTTGCCACTATTTAACACAGCATTC
2278168
2278169
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TAATTAACCCTCCTTCGTATAATATTTGAAATGCGC
2278234
2278235
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTCCTTATAGGTTCCTTTAAAACATACCAAGCATGG
2278300
2278301
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTGTTTGAGGAATCCAATTCAATCCATCATCTGTGC
2278366
2278367
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GAACCAGAGCCACAAATTATATTAGGTACTGTAAAAGG
2278434
2278435
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
GTAGAATTAGGCGGTAAAATGAGAAACATCAGATACA
2278501
2278502
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TGCGTTAAGTTAAGTGAAACAATGCAAAGAAACCTTG
2278568
2278569
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
CCAGCAGGCAAATCAGAATAAGCCTGACTTATTTCT
2278634
2278635
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TTATCAAGGACCTCTTGTTTGATTTCTACATATCCCC
2278701
2278702
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
AAAATAAATGAAGAGCTGCCTTACGGGGTTTGTAAAT
2278768
2278769
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TGAGCAGGCAATAATCGTGTTATCTCAAAACACTTA
2278834
2278835
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAT
TAAATTTATGCAGACATGGAATGCTGTGGCCGGAT
2278899
2278900
CCTTTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAG
TACAAAGATAGAGACAATCAACTCATGTGTCATAAC
2278965
2278966
CCATTAATTGAACTAGAGTAGAATGTAAAG
2278995
Left flanking sequence : Till position 2274931 (length
bp)
GAAGAATTCATTTTTAGAAATACTTAATTTTTTGTAAAAGCTGTGGTTAGACAGGATATTAGCCAATAAG
CCAGTTGTTTGAACGCTTTTAAGTGAACGC
Right flanking sequence : From position 2278995 (length
bp)
TTGTATATTCGGGCCTTTTTATAATTCCCCTTAGCCGGTATATAATGAACATAAAACTTGAGGTGACGTT
TCATTAACAATAGGATTTAAATAAAATGCA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp