CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_009634_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_009634_3                                                                                                                 
top
Strain :
Methanococcus vannielii SB
RefSeq :
NC_009634 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_009634_3
DR consensus (37 bp) :
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
Number of repetitions :
101
Begin Position :
262748
End Position :
270115
262748
GAGTTTATGTCTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCATTAAGGAAGTTGCACAGGCTGTCGACTCAATAG
262820
262821
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCAATGAAGCAAGTACTAATGAGTCGTATTATACAA
262893
262894
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTATCTAATATCCTATTATGTAATGGCTCGCACTCGT
262967
262968
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CAGAATCGTAAGTACCTAAATTTATAGTTCCATCA
263039
263040
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TGTTACGCCGTTTGCGGTTCCAAAATCAGATATTT
263111
263112
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTCTATAGGTGTTCGTTGAAAGTTCCGTAATGTCTG
263184
263185
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TGTCTTTTTTTCCTTGTTTCAACTGAAAGAGATAC
263256
263257
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACAATTCAGAGAACTGGTGCTTCGGGTAAGATACC
263329
263330
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTGGCCAGGCTTATGCTATGCATATGGAGAATATCCGAAT
263406
263407
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCCGACGATACCGGAAAAATCCAATGTATCGGCTT
263478
263479
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTGGAAAACACCTACTGTTAATCCTGCAAGTATGAAT
263552
263553
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTCATTGTCAACTACTTCTGCGATTCCCAAATCAG
263624
263625
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTATTCTACCCCAACTATTACTATAACTAGCAGAG
263697
263698
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACGTGATGTAGTACGTGTCTGCTGCAGCGATGAATAA
263772
263773
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTGTTGATGCAATTCCTGCCATTGACGTTCCGT
263842
263843
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTGCTCCAAGCATGATTACTGCTACTGCGATGATTGG
263916
263917
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GTTTCTATGTGTTGGGTTGTGCCATTGTTGTAATG
263988
263989
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ACCGATAATGTTTTGTACTCCTTCAACATTTTCTCTATA
264064
264065
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCCAGAATTGATAAACGGTATACATTAAAAACCATTA
264138
264139
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCAATTCTTTGTCAAGATGAAATTAAAAGATTATTATAC
264214
264215
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TATAGTTCTATTTTTAACACACTTTAAAAAGTGTGA
264287
264288
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTGGAACCGGATTTTATAAATTATATGATATTA
264357
264358
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGTTTCATCCATCTCTTTTTGGTATATTTTCATAATTAT
264433
264434
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GTTCGATATGAGGGGAACCAATCTCAAGTGTGGGATGT
264508
264509
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCTTAAAAGATAAAGGATATGATAAAAGGGATGATA
264581
264582
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AATCAGTAAATCAGTATCGAATATTAAGGGTTTTG
264653
264654
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTGTAGTTGCTATACTATCCCTCTGTTTTATTTC
264725
264726
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCTGTCAATGTTTCTACTTCCGCTTTAAAATCAATA
264798
264799
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CATAAATTAATTTCTTCATTGGTTAGAATGCCCTCGT
264872
264873
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CAGTGAAAATCCATATGAATTGGCACAGTACTTCAT
264945
264946
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACTCCTTCAACATTCTCTCGATATAAGTCATCTTT
265018
265019
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GATACAGTCTTCACACATTGCACCACTTTCAAGTGTTGT
265094
265095
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ACCACTCCAAAAAAGATAATGATTATTTGATAATTAT
265168
265169
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AAATATCACATAGGAATAATTTTACCTCCGTAGCGAT
265242
265243
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGACGAAAGATCAGTTATTCAACTGATTTTCCACGCAG
265317
265318
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCTTCATGTTTTTCCATTTCTTTTATTGTGAAGT
265388
265389
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TGAATCAACGTATCCTGTATCAATTTTGAGTTTAA
265460
265461
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGTTAATTGCTGTAATTTAAACGAGTTTTTCCTTGT
265533
265534
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AAGAATAATGCAATGGCAAACATCACAGATGAGAAAT
265607
265608
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATCGAATAGTAGTTTTTTTCCGAAGTACTCACTTGG
265680
265681
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGTTCAAAAAGCAATGGCAAGAAAGAATTACAAAGCGT
265755
265756
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCAGACAAACTATGCCTTAACTGTCTTTTTCAGACAT
265829
265830
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTGAACTTCTAGTTCTTGAAAATCTACATATTCGGA
265902
265903
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTATCGGTTCAAAGTGTAACTGTTGAAGCAGGATA
265974
265975
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATGCCCCTTCAGTAATCTCGAATGCAAATCTTTCGACAC
266050
266051
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATTTGGCCGTACTCAGTATATATAATATCTGAGTCGT
266124
266125
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTATTTATGCAAAATAAAGATAAAAAGTTTAAAGCCAT
266199
266200
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTTCATGTTGATCCCTCAATTAAAGTTTTCTTTAT
266272
266273
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTTAAAAGATAAAGGATATGATAAAAGGGACTACA
266344
266345
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACTATTTAGTATCCCTTAAAAAACTAGTATCATATGACT
266421
266422
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AAATATTACAGAAGCTCAGCACATAGAATCCATAT
266493
266494
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACCAAGATATTATTTGCACAGTAGGTAACCGGAAAA
266567
266568
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCTATATCTTTTGCTAAAATATTAATTTGATATGCTC
266641
266642
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AACAAACCTAGAGGGTGCAGACCTTAGGGGGGCTGACT
266716
266717
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TATTTTACAATTTATAATATGTGAATATTACTATA
266788
266789
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTTTCACAATTTAGCAATATTTATTAAAGTTTTCTT
266862
266863
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGAAGAGGAGCTAGAGATGGTGACTCAACCGTTATTCT
266937
266938
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTACTTATTATTGATTGAAAGGGGGCGATAATGAC
267010
267011
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCTATTTTAATTGTAGTTAAAAAATCAATTAAAAT
267082
267083
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGATGTGGAAATGGTAGAAATTATTGAAGAAGAAGC
267155
267156
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCAACTCGGCTGTTGCTTACTATGGGAAAAAAGTTA
267228
267229
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ACGATAACGAGACTGTTGAAGTAGACCCAACTCTTG
267301
267302
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTTTGTTCGATTGTTACAGGTCCATAGTTTTTTTTA
267374
267375
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AATTATTCACACGACATAATAGACCAATAATTTGT
267446
267447
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTCAGATTTTTCAAATTTTTTCGAGGTATGGTATTATA
267521
267522
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AATCGATTATTCAGAACTAATACGTTCTCTATATA
267593
267594
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCGTTGTTTGTGAGTTCTTGCATAATATAACACCTT
267666
267667
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTTGAATATGGTAAAAACATGTCTTAATTATGATGATA
267742
267743
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AAGATCACCGGGTCGGGACCCAGATTTATCTTAA
267813
267814
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATTTAACAAAAATAGTGAGAACATGAACGATATTGA
267886
267887
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TGATTCTAATTCACCATTATGTAAGCTACCGGATTC
267959
267960
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TCCAATTCCTGAAGGTCATGATCTGGATCAGGACTTGA
268034
268035
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TAGATCACTATGCTGGAAAAAAAGCAACTGAAATAAT
268108
268109
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTGAAAAAATACTTACTGAATTGTCGATTAATGGTGAAAT
268185
268186
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ACTGTAAGGAATTCTGATAAATTTATTCATTCCAGCA
268259
268260
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATCACTAATCTCGTCGACAACCACACATTTTAAGTT
268332
268333
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATTGACTCTTTTAATTTGATTTCAGGTGCTAAGTCAATACG
268410
268411
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTCTATTATTGTTTTTTCGTCGTTAGGATTTCGTCT
268483
268484
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CCAAAATGTTTTTTTACGATATCTCTAATTGA
268552
268553
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CGCTTTTAATTTATATGGTGAAAACAATTTTAAATT
268625
268626
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATTATTTTATAATAATATATTATCTATTATACTA
268696
268697
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AAAAACAATTCGATAAAATACATTATGAAATAATAAG
268770
268771
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACTAAAAGATAAAGGATATGATAAAAGGGATTACA
268843
268844
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATCACTTTTTTATTATTTCTATTTTCGATAGAATATT
268917
268918
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TACTACAAAGGATAGAAGACTATTATATAATTGAA
268989
268990
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGTGAGAATACATAAAAACAATCAAAAAGAAGGGA
269061
269062
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTCATTGTCAACTACTTCTGCGATTCCCAAATCAG
269133
269134
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTATTCTACCCCAACTATTACTATAACTAGCAGAG
269206
269207
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
AGTGAGAATACATAAAAACAATCAAAAAGAAGGGA
269278
269279
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTGTTGATGCAATTCCTGCCATTGACGTTCCGT
269348
269349
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CTGCTCCAAGCATGATTACTGCTACTGCGATGATTGG
269422
269423
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GTTGTATGTGATGCCTTCCCCTCCCGACTGAACGT
269494
269495
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
CGATATATAATATTATATTATAATATCGGGTCAAAA
269567
269568
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TATCCTGTCTTTGTATTTCATTTGTTGAATTAATAC
269640
269641
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
TTTCAATTTTTGCATTTTCTTCAAGATAGTTAATG
269712
269713
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ATTACTTACTATATATAGTTATCTACACTAAGTA
269783
269784
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GGCCGAAAAATTTAACTTTTAATAACTGCATATCT
269855
269856
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GAAACGATTGGAGTTAATATGTAAGATTTTGAGTAT
269928
269929
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
ACAGGTAATCAAAAGTAATTTGGGGGCAACTGCGTTATAC
270005
270006
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
GACTATTTTTTTATAAAAGCATAACTATATATATGA
270078
270079
GTTTCAATGCTTGTTCTAATGCATTATGCTCTTTTAC
270115
Left flanking sequence : Till position 262748 (length
bp)
CTCTGTCCCAAATCGGTTCTTGAAGGATATTCCTTGTCTGAGGGCGAATCTTATCAATCTCTTTCACCAT
TTTTCTATTATACAGTACTTATCGGCTTAC
Right flanking sequence : From position 270115 (length
bp)
AGATGATGTAAAATTCAAAGCATAATTTGCAATGTAACTTATTAAATTCCCACGTATAAATATGTTTCGA
ACCATTTTATCAACAAAAATTATTGATAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp