Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_009654_4                                                                                                                 top


Strain : Marinomonas sp. MWYL1 RefSeq :NC_009654 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009654_4
DR consensus (29 bp) : CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCNumber of repetitions :109
Begin Position : 3991376 End Position : 3997996

3991376GGTTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTAGAGTCTACGGCCAACGGTGCAGGCGGGAT 3991436
3991437CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCGCCTCAGTCACTAAGTGATTGGGGCGTTTT 3991497
3991498CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAGACGCGCCACACGACCAAGAGAAGTACAGCA 3991558
3991559CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACCCACGTCACCGCGGCTTTCCAGCGCTGTTT 3991619
3991620CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGGAAAGGTAAGACACCTTCTTGAACAAAGCG 3991680
3991681CGGTTTATCCCCGTATGCTCGGGGAACGCCTGGTAAAACTGTTTCAGTAACTCAAAGTTGG 3991741
3991742CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGAGCGGTAAAGTGCAAAAGTTGCTCTTTACCG 3991802
3991803CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTATGCACTCAAGCCCTGCTATTTCGTCTGGC 3991863
3991864CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCCACTCGTTATGGTTGGCTCCATGCTGTCGCC 3991924
3991925CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCCGCCATACTATCCCGCCCTCTATCGTTCAAC 3991985
3991986CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATTCCCATACTATCCCCCTATTGACCGCCATA 3992046
3992047CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATAAGTCGACTAAGCCTGAAGCGGGTATTTTG 3992107
3992108CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCGATTTTGTCATTAAAGTCGGCATGGGCAAA 3992168
3992169CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACCGAAACGAACATGACGATAAACACCATCAT 3992229
3992230CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTGTAACTGATTGGGTACGTCTAAAAGCTGC 3992290
3992291CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTAAAAGAATATTTTTTTTGGGGCTTTCTATCG 3992351
3992352CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGGTGCGACGGCATTAATGAACGCAACTTGAC 3992412
3992413CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCGAAGACAAAGCCAGCATTGCATTTAAAAAC 3992473
3992474CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCCATCTAATAAGATCATTGTTGGCACCCTTC 3992534
3992535CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGAAAAGAGCTGATTTGGCAAATCTATAAATT 3992595
3992596CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCGTTGGCGATGGCTCGGATTTCGAGGCGCGT 3992656
3992657CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCTAGCTGTTAGCGGCACTATCTGTTTTTCTCG 3992717
3992718CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCCATGACTGAGCATTTAAACAAGCATCCAAAA 3992778
3992779CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGATGAAAACAGCGCAGCACGGAAGCTATAAGG 3992839
3992840CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCCAGCGATAAGTACAACCGCGTAACCGTTAC 3992900
3992901CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATAAGTCGACTAAGCCTGAAGCGGGTATTTTG 3992961
3992962CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCGATTTTGTCATTAAAGTCGGCATGGGCAAA 3993022
3993023CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACCGAAACGAACATGACGATAAACACCATCAT 3993083
3993084CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTGTAACTGATTGGGTACGTCTAAAAGCTGC 3993144
3993145CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTAAAAGAATATTTTTTTTGGGGCTTTCTATCG 3993205
3993206CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACCAGCTCGCCCCCTACCGAGGAGCCTCCAAG 3993266
3993267CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTACCGCCAAGCCCCGCGATACACTCGGCAG 3993327
3993328CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCAAATGGTACGTACACAATGGACAGAAAAGAT 3993388
3993389CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGCCAGGACGAAAAACAGTTACCAAAGGAGCG 3993449
3993450CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCTAGTATGATTCCGCGTGTTCTACTGCTAGGC 3993510
3993511CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTATTGAAATCTATAAAACTTCAGCATCTAA 3993571
3993572CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACACTTACCAATATGCCGAGATGCGGAACACC 3993632
3993633CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACATTATTGGCGCGTTAACGCTTCGTTTTGAT 3993693
3993694CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGGCACCCCCTGAACATGCCAAAGAAAGCCGC 3993754
3993755CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCATGTTGCCAAAGGAAAGGCGAAAGCGCGCC 3993815
3993816CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTTTTACATATTCGCTAGTTGGGTTGTTATCG 3993876
3993877CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGAGTGTTTGGCATGCTTGCTTTGGGTATTTG 3993937
3993938AGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAGTCGAGGGAGCGTTCGGGTTTGGAGAGTCTG 3993998
3993999CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCGCGTGGAGTAGGGCGACCAAAATCATAGAA 3994059
3994060CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGAAATCATGTTTTAAAAGCACGATTGAATCCC 3994120
3994121CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCAGGGCGACGAGCACGATTTGTGGAAGTCGAG 3994182
3994183CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCTCCCCCAAAGACGGTTAATTTTGATAATCG 3994243
3994244CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCCAAGCCTGCACCATCTTGGTTCTGAGATCGT 3994304
3994305CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATATGACTTTTTAGAGCCTCGCATTCGCGGGG 3994365
3994366CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCCAGCTATGTGTTAAATGAGCTAATGCGGCGG 3994427
3994428CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATTATTTTTGTAGCCTATATCCTCATTGAATC 3994488
3994489CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCAGTCAGCAAATCGATAGCAACCAGCATACC 3994549
3994550CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGATCATGGCGCCTATCTGAATGGATTGGTGC 3994610
3994611CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGATGAATCGTGCGCCCTCTTCCAAGGAAAGC 3994671
3994672CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTTAAGTCTGAGCGGGTTTGCTCTATTAGTCGC 3994733
3994734CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGCTAGAGCATGCAAATTGAATGGTGTGCTGAT 3994794
3994795CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCAATGTGGCAGACGTATGACCATCACGACTAT 3994855
3994856CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAATGATTTCCCTGTAGGCTTTCCGTCCTGATT 3994916
3994917CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGCGAAATAGACGAACGCCAACTAGAAACCGT 3994977
3994978CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCTCGTAAGTTGGGCATTATTAGTGAAGTGGAG 3995038
3995039CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGCCTCGTTGTTTTCTTCTTGGCTCTCTTGCC 3995099
3995100CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCACCAAAAAGTACCGTTCATTTTTTCCGCCAA 3995160
3995161CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCCTATGGATTTCTTGTGCTAACTCCTGAACAG 3995221
3995222CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTCAGGTAGGTTCTTCTCAATCTTCGACATG 3995282
3995283CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGGTTGCGTCTCCCGTTGCTGATCGGGTGATA 3995343
3995344CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGTAATCGTCTTGCTTTGGCTTGTTGCTAGGA 3995404
3995405CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGCAGACGAGTGGCAAAACTCTATGTCTGCCA 3995465
3995466CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTATTTGATGCTGTCCCCTATGAGGGCGATACG 3995526
3995527CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTTGGCCGCGTCCTGAAGCAGACCGCTACAAC 3995587
3995588CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCACCACGAATTAGGAAGATATATAAAGGGCTG 3995648
3995649CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAATACACATCCCAGATCACATTATTCACGATG 3995709
3995710CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAGTATGAACAAGCGACGCACAAAGCTCTTGCG 3995770
3995771CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAATTTTGACGAACAAGCTCAGGATCAGGCCCA 3995831
3995832CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCAATTCAGAGTAAAAGTTTTTTACCCTAAAA 3995892
3995893CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATCCGCATCAGCATGGCCGAAGGTCAAACCGT 3995953
3995954CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTACGTGATGACGCAGACATTGCCATTTTCACG 3996014
3996015CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCTCAGCTTGCAGCCGTACGCCGCCGTCTTTAA 3996075
3996076CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGACGGCAGAACAGCCAAGATCTAGCCGATGG 3996136
3996137CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGACGAATAACTGCCGTTTTAGCCTCCCCTGTT 3996197
3996198CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGAAAATAGACAACACCGAACAATATCGGCGAT 3996258
3996259CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGGAATCTTTTTATAAACCGTTATTCTAATAT 3996319
3996320CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTCGCCGCGCCATCCATTAGGAATCGTTTTAA 3996380
3996381CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCGAACGGCGGCCACTCTCGATCAATCCTAGC 3996441
3996442CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTCAGTACCAATATCAGGTCCAAGTCCTAACA 3996502
3996503CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATACCAACCACCTGATTCATCAATGAAATCGA 3996563
3996564CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGAAAAATGAGTGAAGTAATCTGGAAACAAGAA 3996624
3996625CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGTTCTTTCATTTTGTTGGTACTGGCCACACA 3996685
3996686CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTCTGAAACGAAGTGAGCACAATTGTAATTTTC 3996746
3996747CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATTATCTGGCTATTAAAACCAAAAACGAAGAG 3996807
3996808CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTGAGACGAGTCAAGTACGGTAGGTGAACCCG 3996868
3996869CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTACGGTATGGTGGTAAACCCTTAGTACCTCTA 3996929
3996930CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCAATACGCGGGTTAGGTAGTGACGAATAACAG 3996990
3996991CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGGCACAAAAACAAGTGGCCGAACGCGAAAAT 3997051
3997052CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGGGGTATTTCGGTTCGGCGTTTGATGTCCGT 3997112
3997113CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGCGTTAGCGGTTGAATATCTAATGTCCCGCC 3997173
3997174CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTCTTTTCAACGTGGACATTCTGCGTTTAACC 3997234
3997235CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTATGAAATGCGAGAGTGTTTCTAACTTCAGCT 3997295
3997296CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTGCAACTAATTCTTGGCTCACGTAACACCTCA 3997356
3997357CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTGCCGTATATGAGCTCAACGCAATCGGTACG 3997417
3997418CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGTTAGGTGGCACAAAGCATTTTTGCTCTTTCG 3997478
3997479CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACTTATAGTATTCAGCATCACCATTATTAATT 3997539
3997540CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCACACGATCTGCAATCTGCTTAGCCTGTTCTAA 3997600
3997601CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTATTAGCAAGTGACAACCCCAGCGCATTAAA 3997661
3997662CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCTTTTAAACTCGAATTCACGACTTTGCTGTTTT 3997722
3997723CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCCGAACCTCGGTCGGTCATCGCTGCTTTTTTTG 3997783
3997784CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCAATCACAGGAGCGAATTAAGTCATTTCAAGCG 3997844
3997845CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCGGCCACATTGATCCAGATCGATACGGTGAACTG 3997906
3997907CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGCATTTTCTATAGTGTTGTCTTTAAATGTTGTTG 3997967
3997968CGGTTTATCCCCGTGTGCTCGGGGAACGC3997996
Left flanking sequence : Till position 3991376 (length bp)
CTCATCAAAGCATCAGCCTCAGCCATCTAATGACATAAACCTAAGCCGCCTGTTCGGCGGTGAACGCTTC
TCGTATGTCTGCCCAGTCAGTGGCGGAGCC
Right flanking sequence : From position 3997996 (length bp)
TCTAAATGTATACTATTGTTCTATAAAGAGAAATAATCTCTTAAAATTTCTACCAACTTTTTAAAGAGCG
ATATTTCTGTATTTATTCGTTATCCGGCGT
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp