Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_009828_1                                                                                                                 top


Strain : Thermotoga lettingae TMO RefSeq :NC_009828 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_009828_1
DR consensus (30 bp) : GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACNumber of repetitions :44
Begin Position : 205528 End Position : 208415

205528GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCTTGACTATCTCATCTGCGTTCGGTATACCTGGAGTTA 205595
205596GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTCGCCTTGCATACACTGGGACGGATTGGAAAACTTT 205661
205662GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCAGTTCAGAAGCTTCAAGAGCAATATCAAACTGCTGT 205728
205729GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACAAGATTTGAAAAAGTTGAGGGATGGTATTGTGTTCAT 205795
205796GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGTTTCCGTATTTGTTTGTGTCTGTGTCTGGACTTGTT 205862
205863GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTAGTGGTATCAAAATTTGTTTATATCACCCAGACAG 205928
205929GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGGCGGATAACTCAATAAATTTTGAGGAGGTTTTCATA 205995
205996GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTGTGGTGGTATAGTGTGGTTAGACGGGAAGGTATACA 206062
206063GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCACGCAAGAAGCCTTTGTGTCCTTCGTTGCTGCGAT 206128
206129GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTCATAAGATGTTGGTGTGCTTATCTCATTGAGTATTGT 206196
206197GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCTGATATGAGCATTGCTATTCCCAACACAACCACAA 206262
206263GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACAACTGCAAAATCTGGGAGAATTAAATTGTTTTCTCC 206328
206329GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTGTGCTTCTTAAGAATCTCCCTGGCCTGCTCTGGGG 206395
206396GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTGAAAGAACAAAGAGAATATTTAGCTGAAAAATATCC 206462
206463GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCAGTATAACCAAGTGCTGAATCATACCCACCAGCAT 206528
206529GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACATAATCTGCGAGAACTTCCTAAGCTTTTTCCTAAGTT 206595
206596GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACAGGTTAAGCACAAATTTGGTTCCAAACGAGGTGCAA 206661
206662GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACATTGCCTGCTCAAAGGCTTCGTGCGGGCTCATCTCT 206727
206728GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACAGAAGAAAACCATACGATGACAAAAAGATCGATGCAC 206794
206795GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGATGCTGACAAACATCTATACATAACAGTAGCCGAG 206860
206861GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCGCTTCTTCTTCAAAACATGTCTCAACAATTTGCT 206925
206926GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTAACAATATCATCCGAGCTAAATATTCCGAATACT 206991
206992GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGGCGACTTACTTCGTTCTGCTTGGAGACATTCTCGA 207057
207058GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTCCGTAAGCTGTCGCGAATTCGTTGTAGTATGCTT 207122
207123GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGGGAATCGTAGTGCTTGTGTTGCACCATTATATGTGTG 207190
207191GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCAACTTGATTCAATTGAGATGATCGCGAACACGTCC 207256
207257GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTGTTACATTTGCATATGGTAGTTATTGGGACTTTGGT 207323
207324GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCGCCTGCTGAAGTGTCTCATATTTTTGCTGTAGCTCT 207390
207391GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTGTCGTTGAGGCCTCGAATTTGAACAGAACACCGTT 207456
207457GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTCCACTATATCCTTCAATTCATTCAAATCATCGATG 207523
207524GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACAAGCGTTTGAATTTTTGAATCCAGATCTTGGAGACT 207589
207590GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGGATTTTCGCTATTGGATAGTTTGACTCCAGAACAG 207655
207656GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTGGATATTTGAATGAAGTATCGCTAATATTTGGAA 207721
207722GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTAGACGCGTCCCAAGCAATGGACTTTCTCCAACTTG 207787
207788GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGACTTCGATTGTGAAATTCACACCATTAATGGGTT 207852
207853GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCAAAAGAGGGAAAAACTGGATGGCAGTAATTACAGC 207918
207919GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTCAATCACCAGGCGGAATTAACTTCCGAGGAAGCT 207984
207985GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCCGGCATTGGCCTTTTGGCAAGTGTATACGAAAGGAT 208051
208052GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACCGTTCTACTCAGGCTATCGCGATCTTGCACAATCTT 208117
208118GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACGCCGTTGGAGCAACGATACCGATACTTTGAGCAAGCTCT 208186
208187GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTCAGAAATTTCATCAGCAAGAGCATCAATAGACGTT 208252
208253GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTCGCTTGATATTGCTCTTGATATTGATCTTGTGTTTG 208319
208320GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAACTTCCAAATGCGATCGTGAGTGCTCCAATTGTTGCTG 208385
208386GTTTCCATCCCTCTAAGGTTCGATTGAAAC208415
Left flanking sequence : Till position 205528 (length bp)
AAGCTTTTTTACTAAATGTGTAGAAATAATAAACATCGAAGAGGAATATTCAGGGAAAATGGGGAGTTTC
GATGGGCAAAAATGGTTGAAGTGTGGCTAA
Right flanking sequence : From position 208415 (length bp)
CCATAAGATACTGAACAAATAATAATCCCCAGAAACAGATTTGTCAATAAATATTATACTATATGGCATG
CAAGAATATATAAAGGCGAGCATTAAAAGC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp