CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_010278_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_010278_1                                                                                                                 
top
Strain :
Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03
RefSeq :
NC_010278 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010278_1
DR consensus (28 bp) :
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
Number of repetitions :
35
Begin Position :
236954
End Position :
239025
236954
ATTTGTGGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCAGTCAGTCATCAGCTTGGACTTTTACTAGA
237013
237014
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTTTCCCCCACCAACCGAGTGTTTTCAACATT
237073
237074
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GCTTGAGATTTCATTTTCTCCTTTTTCTCAAA
237133
237134
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATTGTCAGAAAGAGGACTTTTTTCCATTTAAA
237193
237194
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GGTATCAATAGAGTATTGAATCTTGTTCGGGC
237253
237254
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATGAGGTAATAAATGGAAAACGACTACATAGC
237313
237314
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ACGATAATGAAATCAGGCAAACATAAAAAAAT
237373
237374
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CTAACTGTTTTAGATTTTTGATTTCATTGATA
237433
237434
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TCAAGGTTTCCGGTTCCGTTATTCGAATGGAA
237493
237494
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AAGATAATCTTTTAAGATCATGTGCTTCAAAC
237553
237554
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CCCGGACAGCTTGGAATTTTTCAATATCGCAA
237613
237614
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ACTAATTTCGGCATTTGACCAAGCCACGCATA
237673
237674
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATATTGCGATTGTCGGTGTATCTGAAGCCTAT
237733
237734
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GTATCTCATAAGCGGCAGAATATTCCTGATAA
237793
237794
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CAGAATTTGCAGCGTATCCGAAGGACTACAAA
237853
237854
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATGATAAACTGATCACTTTATTTGCTTCTCAAG
237914
237915
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TTTCTAATTGTAGTATTCCTTCCGGTGGTTCAG
237975
237976
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TGATATTAATTTCTTCTATTTTTTGTTTATCT
238035
238036
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ACTGGCGACCATCTCTAAATCACGTTGTGCAA
238095
238096
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ATTAGAGTTGGCGATATTGTGATACGCAATAA
238155
238156
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AGTTCGCCCCCTGATCCTGTTCCTTTTCCAAAG
238216
238217
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CCCTGTAATGTACTGCCTTTATTGTATTTTGC
238276
238277
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AATAACATTCAACGGGCTTTAGTTTTACCACA
238336
238337
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GATTGCCATTGCAACACGGGCAATTTGGCATA
238396
238397
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GTTATAGTTAAGTCGTCATCTCGTCCTTAACT
238456
238457
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
ACGAAGTTTTTAACCATTTGCTTTTTTTAACT
238516
238517
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAGG
AATTGCAACAATTTATTTTATGAGAATGTATA
238576
238577
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GAAATCGGGGAAATTTTAAAACGTATTTTAGA
238636
238637
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
CAGTTTAAGAAATTTGCTCATGTGCTTATCAA
238696
238697
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
GTTTCAAACGTCACCCCTTTACAACACCAGGT
238756
238757
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TCGCCATAACACCTCCATGCGTGATTTTGCTTT
238817
238818
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
TAAATGAAAATATCTGTAAAATGGCAATGAAA
238877
238878
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AAATACAAAAAATGGGAGCATTGGCAAAATTA
238937
238938
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
AAAAATTAGGCAAGTAGCTACCGCCTCCCTAC
238997
238998
TTTCTAAGCTGCCTATACGGCAGTGAAG
239025
Left flanking sequence : Till position 236954 (length
bp)
TCGCCCGCTTAGAATGTAAAATCGTCTTTAAATCCGAAGACGGAATATAAGGTGTTTTTTTCATATTATT
TTCTCCGATGTTATTTATGGAATACAGTTG
Right flanking sequence : From position 239025 (length
bp)
TCGTTATTTTACTTTAGAATGTTAGATATACCAAGTTGTTAAAGAGCTTTTAATCAAAAAATCCCTTTTT
TGAGCGGTTTTTATAACCCTTTGTTTCTAA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp