CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_010296_19
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_010296_19                                                                                                                 
top
Strain :
Microcystis aeruginosa NIES-843
RefSeq :
NC_010296 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010296_19
DR consensus (37 bp) :
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
Number of repetitions :
113
Begin Position :
2814769
End Position :
2822884
2814769
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCAGAATTCGACACAATTATTGCTATAAAAAATGATAGC
2814845
2814846
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATGGATTTTACATGGGATGAAGAAAAATCAAAATT
2814917
2814918
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATGAAGGATACCAGATAGAACGTAACGATGGGACG
2814990
2814991
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAATGGCAAGTGGAGAGGGGTGTTTATGATTTAAA
2815062
2815063
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGAGATTGCCTTGATCGGAATGTTACCTCATCAAT
2815135
2815136
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AACTTAATCCTCTAAAAAATCATGAGAGTCATAGA
2815207
2815208
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GGAGAATATCGGTATCTCTGAGGGTGCGTTGCGGGG
2815280
2815281
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTGGTGAATGTGAGACTGCAAGTGGATAGGGAGCC
2815352
2815353
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGCCTTAGCCAACTTCCGTAATTCGTTAATTCCT
2815424
2815425
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCCCAATAGCCTTTCTTGGCTAATTTGAGGGCTT
2815496
2815497
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AGAAATGTGTCGAATTGGGCAGTTTATTGACCTA
2815567
2815568
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACAACAATATCTTCAGAATTAGTCAAAGGATGATCCC
2815641
2815642
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TAATCACTTTTATTGCTGACTTTGCTGTACATCTT
2815713
2815714
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GATGCTTTATAGGGAGGAGAGAAAAATAAAAAAAGA
2815786
2815787
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCCTATGGATGGGCATCGGAGGGTATTAGCTTGGT
2815858
2815859
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCGATTAATCATCCTAAAGATATCGGCAGAACCG
2815929
2815930
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCTACTACTCCATCTACCCAATAAAAAACCCG
2815999
2816000
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGACTAGGAACATCAGCATAAGTTGAAAACAAA
2816070
2816071
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGGCACTTAAGAAAGGAACCCAAGATTTAAGCGT
2816142
2816143
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCAAACACTAGCTTTTACAAAGCAACCAGCTCGT
2816213
2816214
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGCATGGAAAAACTAAGCGAGTTAACATCAGAAT
2816285
2816286
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AACCCTGATTCTAATGCAAGAGAATTGACTTCTA
2816356
2816357
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGGCATTCTCTATCGGCGCGTCTCCGATAGACTC
2816427
2816428
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCAGGATTCGGTCCTGTGTAGTGACATCTATAGTT
2816499
2816500
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAATTTAGTTTTGACTGCAATTAATACTATCTCATC
2816572
2816573
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACCTGAGAAAGCACGCTGGCGGGCGAGGAAATATA
2816644
2816645
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTAAAATTACTAGAAGGGGGCGTGGTATGATTAG
2816715
2816716
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGAAATTTTACTCGAAAAGCGTCGATTACTACCGG
2816787
2816788
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AATGGTTTGCATAATCCTAATTGCTACATCTCCC
2816858
2816859
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GATGCCATTGGTGAGCCGTCTTTATCTGATGATGAAAGG
2816934
2816935
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTATCCCTTAGCGAAAAAAAGCAGATTGCCTCTT
2817006
2817007
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCAAAACAGCCATGGCATACTCGATGATGTCCAGGCT
2817080
2817081
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTTTTTTAGCACCCAATCAAACCAACAACACGCAAAG
2817154
2817155
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTATACTCCCTAAAGCAGCTAAATTGTTTCCCGCCG
2817228
2817229
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTGCTAAGACTAATACTGCATATTATTTTGGAGATG
2817301
2817302
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GGGATTGTTTTCTTTTGGGATCGAGTTCTCGA
2817370
2817371
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGATAAATTGGCATCTCTTTTAAATCTTGCTACT
2817441
2817442
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CATCAGGCGATTTCAAAACTACGCGAATTGGAAG
2817512
2817513
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATCCACTGCCCGACCCTGGGGACAATCCATACTAAG
2817585
2817586
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AATCTTTCGCGAAACAGCATCGCTAACTTAAATGG
2817657
2817658
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACAAGCCTACAAATCGAACACCTACCCCTGCCCC
2817728
2817729
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGCTTGATAGAATCGTGGTACAAAAAAGCAACCA
2817800
2817801
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTTTTAATAATCAGATTAAGCCTAATTTAACCGA
2817872
2817873
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGGATAAGGCTGAGACCCGCATAGCCGATCGC
2817942
2817943
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACGATAATTGCTGAATCCCAATCCTCACGAATTTT
2818014
2818015
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TAAATGTTATTAATTGGGCGTTAGAGAAAGCACAA
2818086
2818087
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGATTTCCCCAAAAATACGATCTTCTTTGTTTAGG
2818158
2818159
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTGATTGGAATTGATACTCAATTTCTCTTTCTC
2818229
2818230
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAATTTTCCCTAAAACAACATCTCGATCATGATTC
2818301
2818302
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GGGCTTAACGCGATCGGGTTCCTAACCGACTTTCA
2818373
2818374
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAGTTGCATTCTGAAAGTCTAAAATCTCATTGCC
2818445
2818446
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAGGAATTTTAACAGGGGGATACATTTGTTACTAG
2818518
2818519
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTGATCAAGATTAATCGACCGGGGAATTAAATTAGC
2818591
2818592
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCAGACTAACTCCGAAGGGAGTCTTGGGGAAAAA
2818662
2818663
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAGTTCCAATGGTACGAAACAGCCTGGGCAGACC
2818733
2818734
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AACGATTTTAAGGATTCCGGGGATGCAGTCTCGCTC
2818806
2818807
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTCTAACTTAAACTCAAGAAAAATCAATAAACA
2818877
2818878
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCCCTCATCTTGAATTGATAGCAGCGACGCATCATT
2818950
2818951
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCCACAACGACGACGACCCCTTAACAGCATAAATC
2819022
2819023
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCGATTACTTCTAAAACTTGAGACGCTCTGCTAGG
2819094
2819095
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AGGCAAGTCTTAGCCAAAGTTCTTAAACTACTATC
2819166
2819167
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCGGAAAATAATCTTGATGTGACTCTTGATGCCC
2819237
2819238
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTTAAAGATTTAATAGGCATTGTTTTTACTCCTAA
2819309
2819310
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCATCGTAAATTCTGACTGCATAGCTATCTAATT
2819380
2819381
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGTAAAAATTATCTACATAAATCATCAAAGTTCCT
2819453
2819454
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCAAAACTACAGCGACCCTACTGGTAACTTCCTGA
2819525
2819526
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGCTGAATGAACTTATATATTGTGATGCCTCTAGA
2819597
2819598
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAATACCTTGAAAGAGCTAGAGTAGTAATCTATA
2819669
2819670
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGTAAGTCACCCCATCATCATTGTTCCCACTACCAG
2819742
2819743
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCCGTGAATATTTATACTTACATTCACAGACTC
2819813
2819814
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTTTTTAGGAATGATGCCTGCCGTGGCAATGTCT
2819884
2819885
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTCTATAGGAGTATCTGGTAAATACCCTACTCCCTG
2819957
2819958
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTCCCTATATCGCTTCTTTGAGCGGGGAGATTTAATT
2820031
2820032
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAATTCAGGCAAAAACTTCGGTTTTTGTTCAA
2820101
2820102
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TAAATATTCTTAGTTTTAATCCTCAGGCAAACCC
2820172
2820173
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AGTTAATAGTGGCTAGAGGAGTAGGATTAAATTGGC
2820245
2820246
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTAAAAGCAGGTAGTTTTAACTACCTGCTTGATT
2820316
2820317
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGTGATCGACCTTTGCCTGCTTGCCAAGCTCTCGATC
2820391
2820392
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTTCTACCCGCAATAATAGCGCTTCGATCTCTTG
2820462
2820463
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTTGCTGTGGACTATAAGGGTCGCAACGCTCGATCC
2820535
2820536
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTGACAGATTACAGTGGGCTGAAACCCACCGG
2820605
2820606
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCATTGGCAGATTTATTCAAATTAGCGATCGCATT
2820677
2820678
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTTAGACATTTTTAGGTCTGTGCCAAGAATGCA
2820749
2820750
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGTTAGTTTCAATTGAAGCATCAAGATAAATATCATC
2820823
2820824
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GTAATATTAAATTATAGAGAAAGACGACCGCAACTAA
2820897
2820898
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTTTTTTAGCGACCCTTCGGCTTTGCTCGGGG
2820968
2820969
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCATCCGTCTATCATTCACCTTTTTATAATACCATGAAAA
2821045
2821046
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATGAGCCCATTAGTTGAGGGATTCACAAAAGTTT
2821116
2821117
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AAAAAAGGAGGACAAGTTGATGGGATTTGTAAAAC
2821188
2821189
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGAATACTTCATCTGACCTCCTGTAGAATCGG
2821257
2821258
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCGCTCTAGCCTCGGAACGATCAGAAATCTACTG
2821329
2821330
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCTTTGGCTTTCTGATGTGTCTCCTCGCGACAAAC
2821402
2821403
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCCATAAGAAGGGATCTCTTAAATATAAAATTATT
2821474
2821475
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
AATTTCTTATTAGAGATTAAGGGGTAATTGCCCTC
2821546
2821547
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCACAAACCTTTTTTACCGGAGTAACTTTTAGATCGA
2821620
2821621
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TCTTTATAAGCATATCTTCTCATTATCTCTCGCCA
2821692
2821693
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTCAAACAAATCGGCTAAATCAAAACTCCAGTTTT
2821764
2821765
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TATTCCAATGCTCCCATTTGGGAGCCTAAAAAGAT
2821836
2821837
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGAAATTCTGCAATTCCATCGGCAATAATTAAA
2821906
2821907
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CGAAATTCTGCAATTCCATCGGCAATAATTAAAAA
2821978
2821979
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACAATCGAAATTAAAACTAATCCGATAGCGATTA
2822049
2822050
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TGGCAAAGGATAGGATAACTCTCTTAAACTCCGC
2822120
2822121
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GCTTCTGGTAGTGGAAATAATGACGACGGTGTGACT
2822193
2822194
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CTATGAAGTATCAGAAGATATTGCACGCAAAACAGTAAG
2822269
2822270
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CAACTCCTGCTCAACCTACTAAAATAGAGAAAATA
2822341
2822342
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATTTGACGGCACATCTTTTGCTGATCAGCTAGAAG
2822413
2822414
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ACTAAGTATTTTGCTGGTAAGCAAATAGATGAATT
2822485
2822486
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
CCTGATAGTGCAGTATCGCACCCCTCGCCTTAATT
2822557
2822558
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
ATAGGCGATACGGGTATTCCATCCGGTTTCACCTGAG
2822631
2822632
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
GAGGTACAGGTTGCGGTTTACTTAAGTCTCTAAC
2822702
2822703
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGGATACTTACGAAGATAAATTACCTTGTTCAGC
2822774
2822775
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTAGGGATTGAAAC
TTGTAATTGAGCTTCGTTGTACAGCCAATTTAATC
2822846
2822847
GTTCCAATTAATCTTAAACCCTATTGGGACTTAGGCA
2822883
Left flanking sequence : Till position 2814769 (length
bp)
TCTTGAAGAACTGGGTCACTTGCTGTATGATTGGTTTATTGCGGGTGCGGCGCATACGAACCTTGAAAAT
CCCATAACGTATAGCTTTTACCACTGGGCG
Right flanking sequence : From position 2822884 (length
bp)
TTTCGGGCAGCAAAAAAGGCTCAAACCATTACGGGACAAAGGGTTAACCTCGATTTATGATTTTCCTTGA
TCTATCTGGGTTTCAGCGATTTTGGGCTTC
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp