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CRISPRs details
NC_010321_2
Flanking alignement tool
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NC_010321_2                                                                                                                 
top
Strain :
Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223
RefSeq :
NC_010321 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010321_2
DR consensus (30 bp) :
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
Number of repetitions :
49
Begin Position :
121655
End Position :
124892
121655
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGCTGAAAGACATTTTAAAGTAGCAGGGCAAGGTACAG
121722
121723
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTCTATCTTGGCCGACAGGTCTATCCCGATGTAACG
121789
121790
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAAAAGCGACATGACAATTACTTGCATGAATGGCAA
121856
121857
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCAACATTGGCAAATGAGCTCAAGACGAAATTTAAT
121922
121923
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GGCCGTACCTCGGTCCAGGCGATCCGAGGTTGAGG
121987
121988
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTATAATCTACAGATAAAACATAAGTTGTGCCTG
122053
122054
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCATTTCCCCACCTTCGCGGTAAAGCTCCACGAACG
122120
122121
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCAAGAGCGAAGGCAGCGCCAAATGCGCCGGCATTA
122186
122187
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGAGACCCAGAGCGGCAAGTTTGACATGATCAAGAA
122252
122253
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGCCGAATTCAGCTGGAAGCATGGGGAGTGGAAGGAG
122319
122320
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATACTATCACGGCATAAGGCACAAAAGATTGTTTATAT
122387
122388
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAGTATAATCAAAGCGGATGTGCTGACCCAACAGTTT
122454
122455
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACGTATAGCTTCAAACTGGCCGTAATTATAGGCAAA
122520
122521
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTTCGACGATATACAGAAACCCACAACAATCCAGAG
122588
122589
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATTTATTGACATGCGGCATATTCGGATTTGGATGGC
122654
122655
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTTGCTGGTGCTCCAGAATGGTGCGTCCGGTTCTTTG
122721
122722
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGACAATAAAATCGCTTTTTCTGTTCAATATCCTATG
122789
122790
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGCAAAATTTCAGAAAATTTCAGGAAAGGAGGTATGCG
122857
122858
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGGGATGGTCGGATAAAAAAATTGCTGAACAATTAGG
122924
122925
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGATACTTTTTAACTTCTTTATATATTTAATAAAAA
122990
122991
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACCGATTCTTGTTCCTGCTGATTGTAGCAACATCAAC
123057
123058
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAACCCGTAGACCGTCATACCGTGAAATCCTCACCGG
123124
123125
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GCCTTTTTGTCTAACACTTGGAATGCTATTAGCACG
123190
123191
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACACAACTGAGGTGACTGTAAGCCGATGGAAGCAAAG
123257
123258
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GTTTAGGCACATCGTTTTCGCAGTTGCCGTTGCTAAG
123324
123325
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGAGATTAAGGATTATCTTGTTGCTGACTGGGAGTTA
123391
123392
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACTCTTGATACTTGATTGCTTCTCTTTCTGCATTCCAA
123459
123460
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGCACTCTTCCACCCCGCCGTTGACTAGTACGTTAA
123526
123527
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAATGATTGATTCTTCTCTGCCGTCTTTATAAAGCACAGG
123596
123597
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AACAACATATTATCAAAATTATGAAATTTCACAAACG
123663
123664
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ACAAGCTCGCCTATCTTTCCACCAGCTGACTGCAT
123728
123729
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AATCCTGGCCCCGGGCAAAGACCACTTCTTCATGCTCC
123796
123797
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGTAAACGAGGGAAAGGATGAAAAAAAAATGATAAA
123862
123863
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TGATATTTAAGCGCGCGATGTGGAGGGGTCTCGTGG
123928
123929
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CGTGCCTGCAGACTGCAATGCCTACGACGTCATGGA
123994
123995
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTACTAAAGATTGAGGAGGTATAAACATGGAAGAG
124060
124061
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGCCTGTTGCTTATAATTAAGGTAACAGCAGGTTAG
124127
124128
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGCTGTTCCTGCAAGGATGCGATGGTTGCAGTTTTTT
124194
124195
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCACCTTTTTTACCTCAATTAGTTCTATAGTATTAAAG
124262
124263
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AAACTAGTGATGGATATGTTGATTGGCTAAGTATTGA
124329
124330
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TTGCTTTAGCAAGATTGTTATTTTTTAACATATTAC
124395
124396
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
GAAAAGCAGTTGGAGGAGGCAAAAGAACATGAAAAG
124461
124462
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CAGTATTGAAACATTAAAAAATAATGCAGAGCTGAAG
124528
124529
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
CCTGTAGCACCTTTGTAGTTATCTAAAACCTCAATGG
124595
124596
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAATATCCTGAAACAAAGAAAAAACGCTGAATCTCAG
124662
124663
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
TAGAGCCTTTTAATATTGCAAAGGAAAAGGTGCTTTCG
124730
124731
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
ATCGCTTAAATTGTTCTTCTGTTAATTCATTCTCTG
124796
124797
GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAAC
AGTATTAAAAATTAAGGAGGTTTAAAAAATGGAAAA
124862
124863
GTTTTTAGCCTACCTATCCTGAAAATAGTG
124892
Left flanking sequence : Till position 121655 (length
bp)
TGATTTTATTGGACAATATGGTATAATAAAGTCAAGATACTTGACAGAAATTAAAAAATTGTAAGGTGTA
TAATGTGCTATTTATGCATGTTAGAATGAG
Right flanking sequence : From position 124892 (length
bp)
TCTCTCAAAAAGGCAACAAAAAACTAAACCCATACCGATGTAAAAATATGGGATAAATAAATGGTTAATA
AAGTTAAATTAAAAGTTAAGACACTGCAGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp