Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_010321_4                                                                                                                 top


Strain : Thermoanaerobacter pseudethanolicus ATCC 33223 RefSeq :NC_010321 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_010321_4
DR consensus (30 bp) : GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACNumber of repetitions :48
Begin Position : 131313 End Position : 134493

131313GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGCCATCACCTATCATACTATCTCCATCCACTCTTA 131378
131379GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCATCTCAGACCGTGCAGAAAGCAACTTGTCTAATTG 131445
131446GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAACTATGACATATAAAATTTAATGTGCCTTGTGGAG 131511
131512GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCAGTACCGTAGCTTCCTACAAATATGATGCCTACTC 131578
131579GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTCCCTCTATATATTCAACAGGTTCAGGATATTTACG 131646
131647GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGAAAGTAAATTAGGAGAAAGATTTCGTGCAAGAAG 131713
131714GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGTGTTCCCAAAAAAGTGGACATGGTTCTTGTTCTTC 131780
131781GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATTATTTGCTCAATAGCCGAGCAGAGAACGGATTTGCCT 131849
131850GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTCCTCTCGGACCGCCCCATCCATTACAGCAGCCG 131915
131916GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCATGCTCTCTCTGTAGTTGTGCGGCTGTTCCCGGTGGG 131983
131984GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCTACCAATGCATGGACGATATGCAGGACACCTGG 132048
132049GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCGAACCCATACTGCAAAGCCTCTTCTGCTGTCATC 132114
132115GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATGCTTCCATCTTTTTTCGCCTCCTCAGTATCTTTCC 132181
132182GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACACAATAAGGCGATCCCGGCGCTGATTGATTTAAACGG 132248
132249GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGTTAATACGGCCGGCATGTTTGTCTTGCGAAGCACG 132314
132315GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCTCGGACGATGCTAAAGCAACTCTTTCACCTTGCAG 132381
132382GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAGAAAAGTGTATCATTGTGTATCATGTTTCTTGAGTTTG 132451
132452GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCACATTTCAGCAATTCTCGATACTATTGCATCGCCTG 132518
132519GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGAAGAAGAGGAATAGAGAGGGTTTACTCCCTCTCTTC 132585
132586GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTGTCCGAGGGACTTGGTCTAAACGTGGACAGCGA 132652
132653GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGATCTTTTTGAGGACAATTACCTTTCCGTCTATAT 132718
132719GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTGTGTATTACATTGCCTTGTTTATCAAGTGGTTGTATA 132786
132787GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTACGTGCGCAAAGATGGCAGCATCTTCCGAGGCAGAG 132854
132855GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTATTTCCTCCTCCTTAATTTTTTTATTTTCCC 132919
132920GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTCTATTGCCCACTCCGAAAGCATTGCTTTTCCCG 132986
132987GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTATCGGACTTTGTGATATAATATAAGTATGATATG 133054
133055GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTCCAACCATCCGTTGTGTAACGGATTGGATAACCTTC 133121
133122GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATCCTTTGAGGAAAGTTGTTGAGCTATTGACTTATAG 133188
133189GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTATAGCTGCTCTTGTTTTAAACGTTCTTCCTAACAGT 133255
133256GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCCCCATTTAATGTAGTATCCGTTTTTGTAAATCTTC 133321
133322GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGAAATTTCTCATCTTCTCTGGAACATCCAAAGCTGCG 133389
133390GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAGGCAAATACAGGATTGCTTATGGAAAGATTGAGCAG 133457
133458GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAGAAAGAGCAGAGGGCTAATGCCCTCTCTCTAAAAAAG 133526
133527GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTTTTAAGATTTTCTGTTTTATCTTTTATCTTGTCTA 133593
133594GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACGCCGCTAATTTGTGCTCTTCAGCTTTGAGCTCATTAAG 133661
133662GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTAAAGTCGCGATACTATAGCCTCTGCTGTTTCAACGT 133728
133729GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAAAGCCTCTAATGCACCTTTGAATCCCTTCATTTTG 133794
133795GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCTGTGATACTGTTGCCGCTTACTGCGGTTATGGTCA 133860
133861GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGTATATAAAGAAGGTTTTGGAAGTTTCTAATTTAGG 133927
133928GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACTTGGTTGTGATAATTCAGCTAACTTCTTTTTTGCTG 133993
133994GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCAGCCTGTGAAGCTCTGATATAAATTTGTCTTGT 134059
134060GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTAAAACTACCCGATATGCTAAAATGCGGTAATG 134125
134126GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACAGCTTTGTTGAAAATTCTTGTACCAATGCTGGAAG 134190
134191GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCGCAAGATGTGGAAGATTTAGAGGATATCGAAGGAACA 134258
134259GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCAGAGCCAGGGAAATTGGATGTAGGCAGGATGCCTGC 134325
134326GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACCACTTACGCGCATGCGGTAGCTCCTGATCATGTTCCG 134392
134393GTTTTTAGCCTACCTATAAGGAATTGAAACATATCTTTTCAGCTTCAGCAACAGGATCGAAAGCATAAGG 134462
134463GTTTTTAGCCTCCTTTTTTAAAATTTGAAC134492
Left flanking sequence : Till position 131313 (length bp)
AAAGGACATTTTCATCCTCTGCTGGTGCCGCATTTGCGGCATGGGAGTCTATAAGGAATTGAAACAGGTC
AAACCTGGGGCAAAGACTTACGACGGGAAA
Right flanking sequence : From position 134493 (length bp)
ATAGCGACTGTAAAATTGAAGAGCTGGTGCAACAACCATAAGGGGTTATTCTATCCTGCGTGCTTCCCGT
AAAGGGAGCAACAATCTGTGGTGCACCTGG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp