Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_010478_1                                                                                                                 top


Strain : Synechococcus sp. PCC 7002 RefSeq :NC_010478 (plasmid pAQ4 )
CRISPR id : NC_010478_1
DR consensus (37 bp) : GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGNumber of repetitions :41
Begin Position : 12085 End Position : 15035

12085GTTTCAGTCCCGTAGTTGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCGCCACTGAAGCAAACGTGAGCAACGCGGAAGCCAA 12157
12158GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCAGCCCACCCAAGATATCCCCGTCCGTGGGTCTT 12228
12229GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCTGCCACAAAAATCAAAGCCCCCATTTTTTCTT 12299
12300GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCGGCGAGGTCACCAAGGTCGGCTCCTGCCGCCGTGATTGAA 12378
12379GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGGCGGGAACAACTTTGATGCGATCCGAAGTACCAATT 12451
12452GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTTTGCCTTTTTGTTAATCTCCGCCATCATTGCAGC 12523
12524GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTTTTTTATTCATAGTCCTAATAGAAAAGGCGATGCCCT 12598
12599GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCGCCATGGGCCAAATTAGAGCGCCAAGGGGAGAAA 12671
12672GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCGTTTCGATTAATTTCAGAGGGTGCAATTTGAGTG 12744
12745GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGAACGACAAGGCTTACAAGGGGGTAATTCGTGATTT 12816
12817GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTAGGCAGGGGAGTGAAATGGTTTCATGTTGGGCTCAT 12890
12891GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCAGTAAGATGAAGGAGGTGGTGCATATCACTTGC 12961
12962GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCTAGATTTGCTTATAGAGTTGACTGTTATCGGGACTT 13035
13036GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGATGATGGCGTTGCCAGCGTTCTCGGATTGGAGAATTTAAC 13112
13113GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCCTGAGAAGTTTGGCTGTTTTGCTGACTGCGATCTG 13186
13187GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCATCGAGGCAGTAGAGCAAATCGCAGGCCACCTCATA 13260
13261GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCATTGGGGTCTGCATTGGGGCCATCGCTATCGTCCT 13334
13335GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTGGGACGCTCCGTAAGGTTTGGAGAATAGGGTCTAGT 13408
13409GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCACTTCGTCGCTGATTGTCCACCGACTTGCGAGGGCTGCG 13485
13486TTTCAGTCCCGTAAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGATGCCCTTCTCTCATCGATGTTTGATTAAATCATCT 13558
13559GTTTCAGTCCCGTAATCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGAAGCATTTTCCCTGGTCGCCGCTGGTAGCTTGTGGCA 13632
13633GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGGCGTAACTGTCCTAATTGTTTCTCAAGGCTTAA 13702
13703GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTGGTCTCCGTCTCGCAAACGTAGTCGCCGCTAAT 13773
13774GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCCTAGCTTTCGCCAACTGCTGCGGCAAATCTTC 13844
13845GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCAGTGCGATTCAGCGGTGGGATAAAGAAAAATTG 13915
13916GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCGATTCGCAAGTTTCATCATCAATCCCCGTGAT 13986
13987GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCGGAACGTCGCGCCGAAACCATCGCCAGGACGG 14056
14057GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTGATTATGTTCAAGAAATCACAACGCAAAAGAAAAA 14129
14130GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCAAGCGAGATACCCACCAGAAAGCCTTTGACCT 14200
14201GGTTTCAGTCCCGAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGGCGGCGGCTGATGTCGCCAATGCGGTTATCGATGGCCA 14275
14276GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCCCAAGGGGGACAGGGCGGTGATCCTCGATGTTGCGT 14350
14351GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGACTCGTCTATATATACAGAGATTACTACAGAGAT 14421
14422GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCGGGAAAGTAGCCTGTTTTGTGGAGAATTGCAGGC 14493
14494GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCCTTCCAAGTCGCAAGCCAAACTTGCTTATCCTT 14565
14566GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCACGCAGCACAATGATGTGACCACTACGGGTGAATT 14638
14639GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGGATTGGTTTGGTCGGTCATGGTCTGCCTTGATGGCG 14711
14712GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTCAATCGTAGCGATTCAGGCCCAGGCGGTAGCAA 14782
14783GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGTTCTGTTCCGCCTCAATCGCTGCAAGGGCATCCTG 14854
14855GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCAACGCGATCTATCACGGTTGCTTCGATAAAAA 14925
14926GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAGCCTCTTTGAGACGAAAAACAGCGCCAACGCCTGGGT 14998
14999GTTTCAGTCCCGTAGTCGGGATTTAGTGGTTGGAAAG15035
Left flanking sequence : Till position 12085 (length bp)
CGAATACTCTCAAAATGAGAGTATTTAATAACAACTTCCAGGGCTGTTGTCCAGGTTAATAAAGTGGTAA
CTATCGCCATACATTGCCACGTGGACAAAT
Right flanking sequence : From position 15035 (length bp)
GCCCGCGATCCAGAAACCTGACGATACCTAGCTTTGCGAAGCTTATTTGGCAGATGTATCCCCATGAATC
TGATTTTACCAACGATCGCCACGCAAGTTG

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp