Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_010610_3                                                                                                                 top


Strain : Lactobacillus fermentum IFO 3956 RefSeq :NC_010610 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_010610_3
DR consensus (29 bp) : GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTNumber of repetitions :24
Begin Position : 819535 End Position : 820967

819535GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACAACCAACTGCAAACGGCAACCCAACAGATC 819595
819596GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACAAAGATGAACTTGTGAAAATGTCTTTCTTG 819656
819657GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAAGGAAATACATCCCAAGTTTATCTAACTGG 819717
819718GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCCCGGTGAAAAGCAAGGCGAACGCTTCTTCCTC 819778
819779GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACTGGTGATAACTCTGGTCGCCTGATGGTTTT 819839
819840GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTAGCTAATGATTTCTTTGGTAGCGTCAGCCAGG 819900
819901GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCGGATGTGCATCACGATCATGAAAAACGACCACA 819962
819963GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTAGTAAATGGTATCAGGGGGCCGGCGAGTTACA 820023
820024GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGCTGACAAGGTATTTAAGGACGCCGAGAAAC 820084
820085GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGTCGGTTGTTCTGCTGATTGCGTTGCTGTGG 820145
820146GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTAAGCCGTTTAGCCATTGCAGCGTTGCTCATA 820206
820207GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCAGTGCCCACCCGGTGGACGTTAGCTCTATCC 820267
820268GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACCGGCGGGCGAAGTTGGTCAACCTCGTCATT 820328
820329GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTGGTATCACCTGAATATGGCGCATCCCATCGTT 820389
820390GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTATGATCCAGGCGAGGCGATTGCTAACGGTAAG 820450
820451GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATGTCGACGTTCATACCGAGGCCATTGTCAGTCCAAG 820511
820512GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACATGGCATACGCTTGAAATTGACTACGATAA 820572
820573GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCCATGATATCCATGGTTAGCAGTAGTAATTATGA 820633
820634GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTCTTGCTAGACGCTTTCTTCCACTTTGAAAGGG 820694
820695GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTATATCAACGTTTTAAGTTGGTTAGTGTCCCAA 820755
820756GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTGGAAGAGCTGGACGTTGTCAAATGACGGGAA 820816
820817GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTTAAGTATTCTTAAAGGAGGTCACACATTACTG 820877
820878GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCTACTTATCCATACCAACTTGACTAATTAAATCA 820938
820939GTATTCCCCATGTATGTGGGGGTGATCCT820967
Left flanking sequence : Till position 819535 (length bp)
ATAATGAAGTTCCTTTCAGATTTCACAAAGTCCTATTTAGAATTTACACCAATTATACGGACATAACCCA
GATTCCTGCATTTCGTCGGTAAACTTGAAA
Right flanking sequence : From position 820967 (length bp)
TGGTTATGTCCGTATAATTGGTGTAAATTCTAAATAGGACCTTGTGAAATCTGAAAGGAACTTCATTATG
CCAAAGGTTGAATTAAATTTAGAAGATGAC

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp