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CRISPRs details
NC_010723_4
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_010723_4                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium botulinum E3 str. Alaska E43
RefSeq :
NC_010723 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010723_4
DR consensus (30 bp) :
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
Number of repetitions :
12
Begin Position :
1753789
End Position :
1754545
1753789
GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT
GTGGCAACTCTTCCTCAATATTTGTTTTTGCTTCGA
1753854
1753855
GATTAACATTAACATGATATGTATTTAAAT
TGTTGATTGATTTAGCGGACGAGTTGGGGGACGATA
1753920
1753921
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
GCAGCGTGTGCTGGAATACTTAATGTAGCTGGAACAG
1753987
1753988
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
TATAGAAGCTTTTAAAAATTCTACTAGTAAAGCTGT
1754053
1754054
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
GAAGGTTTTAAATTATTTTCAAGTGCTTTACGATT
1754118
1754119
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
TCAAACACTTGGAGTTTTTACAGATACTATAATAAT
1754184
1754185
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
TAAAGTTACTTCTTGTAAATTTAAGCAACATAAATAC
1754251
1754252
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
ACAAGTCTATAAAGTAATAATTCTTTTGGTTTTCCT
1754317
1754318
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
TCATATTGATTAATTCATTCCTGCTATACCCTGTTT
1754383
1754384
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
TCTATAAAAGTTTCAAATTTAGACTCTATACCTCT
1754448
1754449
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
ATCCTAAGTATAGTAGTATAGTCCCCTCTCTAAACAG
1754515
1754516
GATTAACATTAACATGGGATGTATTTAAAT
1754545
Left flanking sequence : Till position 1753789 (length
bp)
GTTATCAATATTATAAAATCACTTGGTAAAATAGTAATAATATGTTACTATTACTGTATTAGAGCGATTT
TATTATTTTAAGAATGGCTTATTTTCAATG
Right flanking sequence : From position 1754545 (length
bp)
CCATAATATACTGGTGTTGTTATGAAGAATAAGCCTAACCTAAATTTTAGATTGGGCTAAATATTACTAA
ATAGAATAAAACATTAATTAAAAATATTTT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp