CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_010729_12
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_010729_12                                                                                                                 
top
Strain :
Porphyromonas gingivalis ATCC 33277
RefSeq :
NC_010729 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010729_12
DR consensus (30 bp) :
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
Number of repetitions :
120
Begin Position :
2181484
End Position :
2189363
2181484
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAACGAAATGAAAAAGACAACAAACAGAAGACCCTC
2181549
2181550
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA
2181615
2181616
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTGCCAGCTGCAGGGGGATGACATAGCCATTGACGA
2181681
2181682
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCCGCGCCGCGAGGTGGAGACCCTGCCGGAGGCGAA
2181747
2181748
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTGAGAAAGAGGGGAGGGAGGAGCGATAGACGAAGT
2181814
2181815
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGAGAATCTATTGAGTAGCGAAGTCGTCACAAAGAT
2181880
2181881
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGCCATAGCTCTTCAATTTCAATTTCTTCTTTTAAT
2181946
2181947
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGAAAATAACAAAAATAGATATATTTATAAAAAAGA
2182012
2182013
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACTCTTATCATCTACTATCTCAAAAGCTCTTTTT
2182076
2182077
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA
2182144
2182145
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG
2182210
2182211
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA
2182278
2182279
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA
2182346
2182347
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG
2182412
2182413
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA
2182480
2182481
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCGCTATAACCCTATGTGATTCAGGAATCGGCTTGCTA
2182548
2182549
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GAAACATTCGAGCCGTATTCAATTACGCCATCAATG
2182614
2182615
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CACCCATTGTGCCGCCGTCCTGACCGAAAACTTCTTTA
2182682
2182683
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTTCTTCATCTCGCGCTTGCTCAAAAGCGCGTTCA
2182748
2182749
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGCATCAAGTCACGAACTTTCTGCGAGATGGAAA
2182812
2182813
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGTCTCGAAAAAATATCGGGACGTTTTTGTTTTCT
2182878
2182879
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTCCTTCACTTTGTCGACAATGTGCACTGTATTTG
2182943
2182944
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGGCGGAGTATCTCTTTGCCACCCAGTCCGCGCGCA
2183009
2183010
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGTAACCGCCTCGGTAGACCGCTCCGCACGGTCGTT
2183075
2183076
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTGCATTCCGGACAGCTTTCGCTTAAAAAGTTAGCGG
2183142
2183143
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAGAACGAACGCCTGCGCGATAAGCACCGCGAGCGTA
2183209
2183210
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTTACCTGCAGACTTGTGCCCACCCACTTGATAGA
2183275
2183276
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGGTCACGGAGCGATACCATGAGTGTTTAGTAGATG
2183341
2183342
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGGAGGAGATCAGCTATGCGGATGATACCACCCGTG
2183407
2183408
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCAGAAAACTCGCGTCCATCTGATAGATGTACACGA
2183473
2183474
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAAACGATCGAGGCGCGGAGACCCTCCTTGCCAGTA
2183539
2183540
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGTTCAGGAAAAAGTAACCGAGCTGAAGACCATGCT
2183606
2183607
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGGTGCTATCGCAGGACTGCAGGACATCCTCAATC
2183671
2183672
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGCCGCTCGACTTGACGCCATGCAAAAACAGATAGA
2183737
2183738
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTGCGAGTTGTGAGAGGCAATAAACTGCTGGGAGC
2183803
2183804
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA
2183868
2183869
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG
2183933
2183934
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GGGAAGCTGCTTTGCTCGCTGAGATAGCAGCACTTCA
2184000
2184001
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTTATTGACGCCACCCCGCCGACGAAAAAAAATCAT
2184066
2184067
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTTCGGTCTTTACGTTTGTCGCCACGGATACATGCT
2184132
2184133
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTGTAAATAAATTACATGGCTATTGAAAAACAAATT
2184199
2184200
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GATTGTACGACTTTGCTATAAAGTCTGAGTTATTAA
2184265
2184266
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TATCAACAATCACCGTCATATGTGTAATATACTTGA
2184331
2184332
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GGGCAGGCGTATTGCCCCACTTCTCCCCGAATGCAT
2184397
2184398
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGAGGAATCATATCAGTGTTTATTTTTTCATCGATT
2184463
2184464
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGGAAGTGGGTAGAAGAAAGCCCCAACGTGTTTAAG
2184529
2184530
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CATGACAAAGAGACGGTTATCGGTAGAGGACAGGCA
2184595
2184596
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGCGTGGAAGGGGCATGTACACTTGTAGTTCGCCC
2184660
2184661
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGACAGGCCCTGCAGCGTGTGAGAGCGGAAATGC
2184724
2184725
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTTTCAATCATGATATTTTATTTTTCCTGCAAACGC
2184791
2184792
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCGCATGTGGGAGCGCGGCGGTCTCTGCTTTACGAA
2184857
2184858
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCAGCGTGATGAGCGCTTGAGGCTCCTCCATCGAGT
2184923
2184924
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAGGATGATTTGGAAAATTTAGTAAGATAGTTGATA
2184989
2184990
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTCTTGGAGAAAGCGAAGACCATGAACCTAAGCGTCG
2185056
2185057
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GGAAATATAGTTATTGTATCTACTAAAAGACATAGT
2185122
2185123
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACCCCATCTTGCAGAGTATATGCGAGCAAAATTT
2185186
2185187
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAGTTAGCACAGTTGCTACTATCGTAGTAGCTGT
2185250
2185251
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGATAAACTTTCTTCTCGAATTAAGAAAATCGAGA
2185315
2185316
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGCGGCCATCGAGGCCACCGCCTCCGTCCTCCGCG
2185381
2185382
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TATGAAAACAGAAAAGAACTTCTCAGCCCTGAGTTTG
2185448
2185449
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CAAACTCAATGATTATCTGTCAAGAAGCAAGAAACGA
2185515
2185516
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGTAAAAATTACCCTAGATGCCGAAACGGACGGCCTT
2185582
2185583
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CAGAATTTGCACGAACAGTATGATGTTCGTGTTCTT
2185648
2185649
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAGCGCGAGACAGGCCGAGCCGGCACAGCTTAGTGC
2185714
2185715
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAAACGGCGATAAAATAGCGTTCGAGATTTTCCGCA
2185780
2185781
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TAGTTGTAGCGATTGTCTCAGTTGCATTACTCCTTAC
2185847
2185848
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAATAACGAGAAAAAGAATGCTTAAATTGTTCTTCGT
2185914
2185915
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGAAGAGGGTAAACTATTTGCTAATCTTGAATGCTT
2185980
2185981
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTCAATATCTTTCATAGCTACTAAAAATTTACGAA
2186046
2186047
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTGCTGTTAATTCTGTCATCTCTTATTTCTTTTA
2186111
2186112
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTATCTGCGTATAGCCCTCGCCGTCCACGCCCTG
2186176
2186177
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGCCCCCTCACCCATCTAACCTCGAGCCGTTGAGCC
2186242
2186243
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GATTACATAATGATAGACGACAGAGATTGTGCAGAA
2186308
2186309
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTACTGATAATTACGCTGCAAGGTCAGACGGTGAT
2186373
2186374
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTGCCAGGGCTTGCTGATGCGCGCGCTCCAGCTGCT
2186439
2186440
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACAGAACCAGCTCCGTCAAATCTCCCGCTTTTTGTC
2186505
2186506
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGCCCCCTCACCCATCTAATCTCGAGCCGCTGAGCC
2186571
2186572
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TATTCATTCGCTCAAGCGAGGGCATCCTGCTGCAGC
2186637
2186638
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCTCGCGGAGGGAGAGGGTGCCGGTATCCTGCCTCC
2186703
2186704
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGAGTCTGTATGTGAAAGTGTAGTTCGAAACATTAT
2186769
2186770
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AGAATACTTTGAAGTTGTATTCAATTACTTTGAA
2186833
2186834
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCGTTGTGACAGAGCTGCGCCGTCGTGGCTATGATG
2186899
2186900
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TGAAAGCCCGAAGATAATCTACACGCAAGATTGTTA
2186965
2186966
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGTCATCAGGTGGATATTCTTACTGCTATCCACGA
2187030
2187031
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCGTCTGCGACGTATCGCAGCTCTGCCAGCTCCGCG
2187096
2187097
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCATCTTCGCAGGAAAGAAGAAGGCTCCGTCCTCGA
2187162
2187163
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AACAGTCAAGGGGGAGCCGACCTCTCCGGCGGATTT
2187228
2187229
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCAGTGCGGCCGACAAGGCTAACCTCGCTCAGCTGA
2187294
2187295
GTTTTAATTTCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATCCATGTTCATGAGGAGAGGATACGAGTTCTATT
2187360
2187361
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTTTTGCTATTGCAGCAAACATATACAATAATAA
2187425
2187426
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ACTTCATGGATTTAGCGAGATACTCATTATAATTAA
2187491
2187492
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA
2187557
2187558
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATCTTCAAAGATAGTTGTTATCAAATATCGCGCTGAA
2187624
2187625
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCTCAAGCGTCCAAGAAAGTTCAAGAAATTGTACTA
2187690
2187691
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TACTATGGTGTCTGCATTTGAGATACGCAAATAGCAA
2187757
2187758
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTCAATATCTTTCATTGCGACGAGAAATTTGCGAA
2187823
2187824
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATCTATGATGATATAGAAGAAGACGACTTGTTGTT
2187889
2187890
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATTAATGATTTTCTGAAATAAAGAAGCAGTTGCATA
2187955
2187956
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTCAATATCTTTCATTGCGACGAGGAACTTGCGAA
2188020
2188021
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCCCGTGGTAACTCATACCACCGACTATTCCACCGT
2188086
2188087
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTTGAGTAATCATCGAATAATTATCGATTAATCATT
2188152
2188153
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTATATGCATCATATTCTTAAAGTATTTTATTTGAA
2188218
2188219
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GACGAATACGGCGTTCATCATCGATAGTCGCGATGC
2188284
2188285
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CGGGCGGCCAACCGGTCACAACAAGAATAGACCGAT
2188350
2188351
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TTCCTTCCAGTCGCAGCTTAAGATACTGCGACTAC
2188415
2188416
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATTTTCATCAGAGCATAAAAAAGGGCAAACTTTTT
2188481
2188482
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GATACGAGCACCAAGGCTGCGATACCGATTGCGTA
2188546
2188547
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CCTCGAGCAGATCTTCCTGCTCTTTGATGAGTGAGG
2188612
2188613
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GCAGGTTGATTATAATGTTGAAGATGCTTTAAGGG
2188677
2188678
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CTCGTATCGACTTTCAAGCAGGCTGGAGTGCAGCCT
2188743
2188744
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATATGAGATCGGAAACAATTATAGTTGCGTCGATAT
2188810
2188811
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
TCACAATAACCGACAAAATGTCTCGCGTAACGTACAA
2188877
2188878
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GTCGCCTGTTTTCTTGAACTCCTCACTGATTCGTA
2188942
2188943
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA
2189007
2189008
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
GATGGTGTCGACATCATACGACAATAGATCGTCGA
2189072
2189073
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AATATTTTTTCAAAAATTGTAAAACTTATTAAGTCA
2189138
2189139
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
AAGTTGCTGATTGTCTTAGAATGAAAGGTTATGCTC
2189204
2189205
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
ATAATATTACATAATGGCACACTGATGGTAAACTT
2189269
2189270
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
CATGATGTACAAATATATCATGATCGTATACTAC
2189333
2189334
GTTTTAATTCCTGTATGGTGCAATTGAAAT
2189363
Left flanking sequence : Till position 2181484 (length
bp)
TGCTGTTTTTAATACTCAAATATACAAAACAACTCCCTATTATACAATGAATTAACAAACAAAATACACA
CCAATCGCCGTGCAAAGGTCTCCATATATC
Right flanking sequence : From position 2189363 (length
bp)
CCGTTACAAATATAGGCTTTTCTGTTTGAATGTGAGGAGTTTACGAGAAGGTGAAACCCAAAATTCAGAC
ATTCATAGTTGTCGATGTCTGATTCTATGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp