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CRISPRs details
NC_010730_1
Flanking alignement tool
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NC_010730_1                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1
RefSeq :
NC_010730 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010730_1
DR consensus (29 bp) :
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
26281
End Position :
27614
26281
TTAAATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA
26345
26346
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA
26410
26411
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
AGAATTAAGACTTGGTCTGATGAGAATTTCTATGAA
26475
26476
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TGATATTGATAAATTTGTATCTAATCTTAAGCAAGA
26540
26541
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC
26605
26606
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TAAAATTGAATATGAAAATTAAAAATTGCATAAAAA
26670
26671
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
GGTTCCTGTTAAATTCTTTATATAAAAGATTTTAGC
26735
26736
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TTGGAGTAGTTCTTGTCGTTATAATCTTTTTACAGAGA
26802
26803
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
CCCAAAGAGCACAAAAAGTTTTTGCAGTTTTTGCAG
26867
26868
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TCGGCTATGATTTCTAAAGCAGAGACTAAAAGAGCAA
26933
26934
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TTGTTGGAACTGCACCAGTTCATACTACTATTCCTAC
26999
27000
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TGACCCGACTAAAGTCCAAGCATCGGATATAATCGG
27064
27065
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TTATGGCTTTTTATGATTGTTTTATGATTGCATTA
27128
27129
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
ATATAAAATTTATAATGTAAAAAATTGAATAAGAAAA
27194
27195
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TTGCTTTCAAAAGATAAAAGAGATTTTGTAGATTTA
27259
27260
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG
27324
27325
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG
27389
27390
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
CTAATAATAGACTAACAGTTGCTAATGCTTATGATG
27454
27455
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
AATAAAATTTATATGGTAAAATAATTTAAAATAAAA
27519
27520
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
TTAATTTTTTATGGTTTTTATTATGATTACATTTTTA
27585
27586
CTTTATAACCCACACGGTTCAGATGTAAC
27614
Left flanking sequence : Till position 26281 (length
bp)
CAGATGGAACGCAAAACGTGAGAAGTGAAACGATACACGTGAAACAATATTTAAATTACTTTAGATCTAA
CGTCTCACATCTCACCTCTCACGTCTCACT
Right flanking sequence : From position 27614 (length
bp)
CCGTTAAATCTTAACTCAACAATCATATCGCGAAAACCTTATTCAATTGCCAATGTGTAAAACATTATAC
CAAATTTTTAAGAAATCGGCAAGTTGAAGT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp