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CRISPRs details
NC_010803_3
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_010803_3                                                                                                                 
top
Strain :
Chlorobium limicola DSM 245
RefSeq :
NC_010803 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_010803_3
DR consensus (35 bp) :
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
Number of repetitions :
27
Begin Position :
1009935
End Position :
1011874
1009935
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTGCAGGTCTTCCGCCTGCGAGCTGAATCATGTCC
1010004
1010005
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
GTTCTTCTTCGATGCGCTGGCGTTCTGCCTCTTCA
1010074
1010075
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TCATATTGCACTTTCGGCATTGCCATCCTCCACTTT
1010145
1010146
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
AACATCCCTATTGTTTTATCGTACAACTCGTCACTT
1010216
1010217
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TCGGAGACATCCTTGTAAGCCTTCACAACATCATTAAAGT
1010291
1010292
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTATCTCGCGCCGGACGATGTTGTCACCGCAGTACAC
1010363
1010364
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TAGCCGTCGCCTGCCACTATGCTTTCCATACAGGCACC
1010436
1010437
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TATTGTGCAACCCAGATTTCGACACGGCGATTTCGCTCC
1010510
1010511
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
AATCTTCAAACTTAATTATTGTTTCTGTTTTATTATATA
1010584
1010585
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
ATGCACGTCTTACTCATACTTCTCCCTCCGTTTTGCTCAATT
1010661
1010662
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
CTTCTTCCCGGTCGCAAGGCGTGAGCACCGCCGTCACC
1010734
1010735
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TAATCACACTTCCTGACCGTAGCAGCCAGCGCCCCGTCTG
1010809
1010810
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTAACTCGATAGCGTATGCAATGGCTACGCAAGGGA
1010880
1010881
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTCCAAATCTCTCATGTTAGCTATGTCCTTATAATCAA
1010953
1010954
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
CTCAACCCCATGTAAAAAAGACATAAGACATCTATTTAAA
1011028
1011029
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
GCCACCACTTCAGCCTTATCAGTAATTCCCGTAAGATAAA
1011103
1011104
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TACAGGTGGTACACGCCGTCTTTGCGGAGCACTCCCCCG
1011177
1011178
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
AACAAATGGAGCTGGGTCGACAACCCGTAGTGCAGC
1011248
1011249
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TAAGCGAATAAACCGCATATAAACCCGCGACCAGCAGG
1011321
1011322
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTTGGTTCCGGTCTGGTGGTAGCCCATGTATTTGATTGC
1011395
1011396
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTGCGTCGAAACCTTGTTTCGAAAGTTTTCTCTGAAA
1011467
1011468
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTGATTTAAGCACGCCGGCGTTCAGCAATTGCCCCCCG
1011540
1011541
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
TTTCCATTTCCGAAAGTATTTCTTCAGCTTTTTCAAGAT
1011614
1011615
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
CTTTTGGCTGTTAATGATGCGGTGGGTCTTGCCACAG
1011686
1011687
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
CCACCTCTCCCTCGATGCTTACTGCATCACGAGGCGAAT
1011760
1011761
CTTTATATCTAATTGCACTCATTGAGGATTGAAAC
AACCGTTTGATGCTGCTGCAATCGTCATGCCATCACGGAGAACA
1011839
1011840
CTTTATATCTAATTGTACTCATTGAGGATATATTT
1011874
Left flanking sequence : Till position 1009935 (length
bp)
GAGTAAAATCAGACCATTGTCCCTTGACATCGCTGATTTTTTATCGAGCTGCGGTTTTCGCGCCTGGAGC
CCTTGCCAGACAAGGGTTTCCAGAGGTACT
Right flanking sequence : From position 1011874 (length
bp)
TAGTTAAGAGTGCTTGGTTCTAAGTTCTGAGTGTTATATCGAAAGACAATTATTCTTTTACTGGCTACTA
ATTCAGCCTATTACACTCATTAAGAATAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp