Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_011296_3                                                                                                                 top


Strain : Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 RefSeq :NC_011296 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011296_3
DR consensus (30 bp) : GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACNumber of repetitions :32
Begin Position : 1074817 End Position : 1076909

1074817GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTGTTTTGCCAAATTGATATTTCCAACCAGTTCCTCC 1074883
1074884GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTGTATTCAGACAATAATTCTGTTCCTTCAAGCTTT 1074949
1074950GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAATAATCAAAATTATCAAGATTATCAGAGTTGTTATT 1075016
1075017GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGTTTTTTGGTGCATTTTCAAGACTTTTTATTGTTA 1075081
1075082GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGGTAAGTTATGTTCAGCCTTATGACCTTGTTAGAAC 1075147
1075148GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTGTATTCTTCTTTAAAAATCACATAGCCATTTAT 1075212
1075213GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGTATCAGCTGTTGCATCTGCTGTTACAACAAACTGC 1075278
1075279GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGTTTGATACAGCTGCAGGATAGCCATTGACCTCTC 1075343
1075344GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTAAAACTTCTCCATCTCTGGCTACGGTTCTAAGAA 1075409
1075410GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAACTATTTGTGGAGCAAGATATGCAGACAGCACTGCTAC 1075478
1075479GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTCAACTTCAACCCCGTATCTTGGAGTTGTTTCAG 1075543
1075544GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCGCATTTACTTATAACAATTATCATTTCATTTCCTT 1075609
1075610GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCATTTAAGCCCCACCAATAAGCATAGAATAAATAAA 1075675
1075676GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAAGCTCTCAGAGATAACATATGATGCAGTCGTCGG 1075740
1075741GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCGAGGCTCAAACAGGTGGAATACTTCAAACACAAGGG 1075807
1075808GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACACTGTATTCTGTTTTTGTATCATTGAAGTGTGAAA 1075872
1075873GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACATTTCTCTCTTAAAATACCTTTTAAAAATTTTTTTTG 1075939
1075940GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCTTTACACTCCATTGCAACTTCATAAACCATATTATT 1076006
1076007GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACACATTTTGCCTGAACAGATATGTTTGCTCTAAGATGA 1076073
1076074GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTATCTATACCTTAACTCTCTCATACCTACCCTCTTT 1076139
1076140GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCCATGACGGCTTCAACACATCTTCAATTCTCGTTAAACC 1076208
1076209GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTCAATTTCTAATTTTTTATTGTGTTCCATTTTTCTCC 1076276
1076277GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCTTGAAAAAACTTTTTTAAATCAATAACTTCATTATCCCGC 1076347
1076348GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTATTCTATAACTTTACCACCCTCATCCACACACAC 1076412
1076413GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACACTTTAATACTTCAAATTTCCTTTTACCTTTAGACA 1076478
1076479GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACGTATTATTTGACATACCGCAAGCAAGCAAGAGATAGA 1076545
1076546GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACTTTTATAACGCTCCCACACCATCTCCGCACTCGTC 1076610
1076611GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACAACAAAATCGAACGAGGTTTAACGCTTTCATCAAACTC 1076678
1076679GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCCATACAAACCACCTTGCCCCAAAACATCGCATGG 1076743
1076744GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACCTTTGTCAAGAACAAGCTCTTTCCATACTTTTGCACATT 1076812
1076813GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAACACAACAAACTCATACATTTGAAGTGCTCCCTGAGCCC 1076879
1076880GTTTTGAGCCTACCTATGAGGAATTGAAAC1076909
Left flanking sequence : Till position 1074817 (length bp)
GAAATTATATTGAAAAATTAAAGATTTTTTGTTAAAATTCAAAAAATAACCAATGATCTTTGACAAGCGG
ATCAGATTGATTTTTTCACATTTTAAACGG
Right flanking sequence : From position 1076909 (length bp)
AGAGAAGTTCATGCCTGAAAATTTTTCACTCCACACCCCATACAAAAAATGTATGATAAAATAATTAATG
AACTTCCTTTCAAATCAGCCGTCTAATATT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp