Institut de Génétique et Microbiologie

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NC_011296_5                                                                                                                 top


Strain : Thermodesulfovibrio yellowstonii DSM 11347 RefSeq :NC_011296 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011296_5
DR consensus (29 bp) : CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACNumber of repetitions :121
Begin Position : 1929305 End Position : 1937222

1929305CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGGATTTAATCTTTTCAAAAATCTGTCTAACCCACTG 1929370
1929371CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAGTGTATCCTCATCTTTTCACAATCTGCCTTTATCA 1929436
1929437CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTCCATCTTCTGTTTGAACCTCTTCCATCTGATAAC 1929501
1929502TTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTAAGAACGGTGCTGACTTCACTTACTTCATCTGTCAC 1929567
1929568CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGAATACAGAGTAATCAATTGCAGATTTCTCCAGA 1929631
1929632CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTCAGATTCATCAAAGAAAATTTTTGGTGTCATTGC 1929696
1929697CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATTGAGAAGAAAAGCAGAAAGAGAATTATTTTTAGA 1929761
1929762CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGGATATTTTTCGCTGGCGTAGGTAATGGCAAGTGCA 1929827
1929828CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAAAAATACTTTTGGAATTAGCAACTAAATATAACT 1929892
1929893CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGAGCGGATATAACTTCATTGAGCTTGCGTGGGGAAG 1929958
1929959CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGCTTCTTGCTTAGCTTTCCTTTCTAATTCTAAATCGT 1930025
1930026CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTATTCTACCCCAAAGATATTCCATTGCGAGGTCTTG 1930090
1930091CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAAATATATTTTATAAGTTTATTCCTACCTCCAGTAAA 1930157
1930158CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTAACCGTGCAATAAACATACTTGTGAACTATACAGT 1930223
1930224CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCATACCTTTCGTGAGGTGGTAGATGCTAAGGATTATTG 1930290
1930291CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTCGCAATCCCTCCTGCTATGGTAGTCCCTCCTCTGA 1930355
1930356CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTTTTAGCTCTTGTTTGCTCTGTTTTCTTGCTAAG 1930420
1930421CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACACAATATAAATAAGGCAGTTTCTCTTCAGGAAAAAA 1930485
1930486CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACACGCATTAATGTTGCTGAACTTGCAAGGGTAATTGGA 1930551
1930552CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTGAGGATGTCCGTTGGCATGACCTGCGGCGAACATT 1930617
1930618CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGGGGATTGTGGATTACAGATATGACAGATTCAATC 1930681
1930682CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGGGACTAAATCCTCTGGCGGGGTTGTTAAGAAAAA 1930746
1930747CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACACAATTAACAAAGAGTACCCCGCCGAACCGAAAACGT 1930812
1930813CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGGAAGAAATAGTAAAGATACTGCAGCATACTCCCGGT 1930879
1930880CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGGTTCTAAAAACAGACAGAAAATTATAGGGCTTATA 1930944
1930945CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTTTATAATTTATCAGAACATTACTGCAGGGTATA 1931009
1931010CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATTGAAGGAGTAATAAAAAGATTCTCTGCATCAGGC 1931074
1931075CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTACATAAGTGAATCAAGGGTAATTATTAAAACTGT 1931140
1931141CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTAGAAAGAAATCAGAAAAAGAAGCTCTATACATACTTT 1931207
1931208CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGATGAAGAAAAAATTAGACATAGGACAGCTTGACCTG 1931273
1931274CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAGGGGAATGTGTTTAAGGGAGCAATTGAAAATACCTGC 1931341
1931342CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCTTGAGGCTGCCTGTCAGAGGCTTGGCTTGTCTATGCAAG 1931410
1931411CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTAATAAATAATGCTAATATTTCATTAAAAGCAAA 1931475
1931476CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGATGTTAAGAGTAAAAACTCCTATAATTAATCCTGC 1931540
1931541CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTCTCTTTGAAGTTCCTATAGAGAGAATTAAATTAA 1931605
1931606CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGCATTATATAGAGAAATTCAGTACCACCGCCTTTGG 1931670
1931671CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGGAGTTGATGGATTTATATAATTATCAGGACTCGA 1931734
1931735CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGCATGTATTTGCAAGAAGTGAACAAGAGCTTGAAC 1931799
1931800CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAATTTGAAGTTGAAATTTCTAATGATGATTTCTTTA 1931865
1931866CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGGCAACCACTGCTGTAAAAGACAAAAAAGTAATCTCTG 1931932
1931933CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTACTGCTTCTATTGTTATGTAAGCAATTTCTCCAAC 1931997
1931998CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGGCAACCACTGCTGTAAAAGACAAAAAAGTAATCTCTG 1932064
1932065CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTACTGCTTCTATTGTTATGTAAGCAATTTCTCCAAC 1932129
1932130CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATACTTGTTTTACAGAACACTAAAAAACACAACCGAA 1932195
1932196CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAACATGTCAGTTTTCTCATTGGCTTGAGTATCTTCTA 1932261
1932262CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGATGTGCTGATGAGCGAGAAAGAGTTTTCAGAGAAGA 1932328
1932329CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAAGCTAAGAAGGTTGAAGAAAAACCTGCTCAGAAGA 1932394
1932395CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGTAAAGTAAACTACGTAACGTAGTTTACTTAAAAC 1932459
1932460CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGTTGTTGCCTTGCCTTCGTGCTTTTCAATTTGCACTT 1932525
1932526CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCAACTGTAACTGTTAAAGATGGTGAAACCACTGCTATTGT 1932594
1932595CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTCTTTTTTAGAATGAATTCTATAATTCATCATTATATT 1932661
1932662CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTAACATCTCCCTTGTCAATCGCAGATACAGGCAA 1932725
1932726CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATGGAAATTTATATGTAATTTTGAAAGTAGTTGCT 1932789
1932790CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCGTTGATTGCATGTTCTTAAGCACTATCTGCATTG 1932853
1932854CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATCTATCCCTTTTTCCGCACAGATGCGGGTTCTTG 1932917
1932918CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATGCCATAAGGGCTGTGGCAATAGTAGATGCACCAAT 1932983
1932984CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTATACTTATTTTTGGGTTCTTGAAAAACAATCAAG 1933048
1933049CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATATTTGCCAGAAAAGTTAAAGCAATACCTTATCTCA 1933114
1933115CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTATTACTCTCAACCCAATCACGAATTTGTTCTGTTGT 1933180
1933181CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGCTTGAAGAACTGAAAGAACCGGAACCATACTGCA 1933245
1933246CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGAACCCGTAATTATTCAAGATGCCGCAATATTCTTT 1933311
1933312CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGCTTGTTGACCATAACAGAAACTTTTTAGCTCCACA 1933377
1933378CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAGGGTGAGGACATTTGTATTATTTGATAGAATAAGT 1933443
1933444CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTTTGCATCTATATATGCTGTTTATATAATTTTTAAA 1933510
1933511CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATTCTCATACTCAAAAAGAAAAGCCCTTTCTGGCTCACCATCT 1933582
1933583CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAATTTTATACTTTGCAAATTCTGTTTTTTATGTTTG 1933647
1933648CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAATTCATGAAAAAATGCCAGAAAGCTAAATCTTTGAT 1933714
1933715CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAGTCCATACTGTGTTGGGCAGTATAAAGAGCTCCG 1933779
1933780CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGCCATTTTTTTGTTTAGATTTCAACTTCAAAGTCTTC 1933845
1933846CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTAATATTGACAAACTTGAAAATGCAAGATGTATGATGC 1933912
1933913CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTATGATGCTGGACCTGATAAAACATTTAGAAAGCA 1933976
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1934042CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAGACCAGATACAAGAGCATTAGGAATAGCATTAAGA 1934107
1934108CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGAAAACCACGTTTTGACAATAGAAGGTCTTACAAAA 1934172
1934173CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAATCATCATAACCTTCTGAAGCACTTCTGGAACTGT 1934238
1934239CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAGTTTCTTAACTTAGTATAAAAATTATCACAAATAAATTC 1934308
1934309CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCCGTTGGTAGTGGAGACAGGCTTTGTTGGAAGTTTGA 1934374
1934375CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATCACATATGCAAAAAGATACGCATTGTCTTTAGCTCT 1934441
1934442CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGATGCAAAAGGATGTTACAGAAAATATGTTAAAAAA 1934506
1934507CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCAACGGGACAGAATGTTACTGTTGATGAAGTTGAGAT 1934572
1934573CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATTTCAAGTTCTAAATCCTTAAAATACCTTGTATCTAT 1934639
1934640CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACACAATAAAAGATCCAAGTTGCTGTTGCGTTAAAACA 1934704
1934705CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATAGTCTTTGCCAAAAAGTGTGGCTTTACCAATAT 1934768
1934769CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGTTATAAAGCATATTGTTATGTCTCTGAACTTCTTT 1934833
1934834CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTCACATATGCAAAAAGATACGCATTGTCTTTAGCTCT 1934899
1934900CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGTGAACTTTGTTAGACAAATCTAACTTAGTGAGTGA 1934965
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1935162CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGTTGCAAGAGCTTTTATCCCAACCAGAGCTAATCT 1935225
1935226CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGAATGCTTGAGATATTTAGTTTATAACCGAACAAGA 1935291
1935292CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGTTGCGTTCAAAATCTCTACTTCTTTCTCTAAGCGT 1935357
1935358CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCCTGAGTTAGTTGAGGCGGGGAGAGGGGTCCTTCCTA 1935423
1935424CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTAAACGAATGGAATGAGACAATGATAAAGCGATAC 1935488
1935489CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTGTGTATGCCAGAAGAAATTGTTTCGGCATTTTCTT 1935553
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1935619CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAATATCAAATTTATTACTCAACCAGCAAGGACAATAATAAC 1935688
1935689CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACACTGTACTGACACAACAGCGGAAATAACAAACTACAA 1935754
1935755CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCTCTTCTATGTTTTTGTCTTTGACATTAACCCCTTC 1935819
1935820CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTGTTTTTTGATAAGTTACTATTTTCGTTGTTAT 1935883
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1935949CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTAACTTTCCCTGAAAGTGCTGACATTTGAACCCATAC 1936014
1936015CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTATACTGCTCTACTGCATCGTAGGCAAGTCTAAATA 1936080
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1936147CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTCCTGCAAAAATCAATCTTCTTAAAATTACTGCTTT 1936211
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1936341CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTCGTCCGCCCACTCGCTTACCGTCTGCTTTGGTCT 1936404
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1936537CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAACTTCAACTGGGCACATATTCCAGATGCAGACTTA 1936601
1936602CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAAATTTCCAAACTGCCAAAAACCTTTATTTTTTCA 1936666
1936667CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAGACAGGCTTTGTTGGAAGTTTGACGGGGAGAGTATT 1936732
1936733CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGACCTTGATAGAAAAATCACTATTACCACAAGACCTC 1936798
1936799CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTTGCTCCCTTTTTCGCACAAATTGGGCAACTGGTAGGTA 1936867
1936868CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACTTGGCACACATATCAGATATTCACCATCTTTGATTGT 1936933
1936934CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACAAGCTGGATGCTTGACTTCACAGTCACTGAACCATC 1936998
1936999CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACCTGGTGGATTATCACGCTTCTGGTTGGCAATTTAGTC 1937064
1937065CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACATGAAATCCTCAGTAGGAACAAAGATGCCCCCACAC 1937129
1937130CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAACGATGCTGGACCTGCAAACATTGTTGAGGCTATTGG 1937193
1937194CTTTATATCCCACATGGTTCAGATGAAAC1937222
Left flanking sequence : Till position 1929305 (length bp)
GGAGGAGATTCTTCGTCTAAATCGCAGTCAAAGAAGTCCCTAACATGTCTCAGATAAGAAATTATAATGA
GTTTACAAATACTGTAAAATTGCTCACCCC
Right flanking sequence : From position 1937222 (length bp)
CCAGCTTGTCAATGAACAATGAATTGCTCCCAAAATTCTTTATATTTCTAAATTTTACAAAAAAATTATC
GCATCTGAGAACCCCCTCAAAAAACAAGTT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp