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CRISPRs details
NC_011729_35
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_011729_35                                                                                                                 
top
Strain :
Cyanothece sp. PCC 7424
RefSeq :
NC_011729 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011729_35
DR consensus (36 bp) :
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
Number of repetitions :
21
Begin Position :
4019765
End Position :
4021254
4019765
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GTGGCGGGGGCCCAGGATAACGTTCCCCCCTTATA
4019835
4019836
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
TTGCTGCAATCCCAAAGGAAAACCAAAGGGGGTTTTCCT
4019910
4019911
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
CAAAATTTTGGGCGAAACCTTGGACGCTTTTAATTG
4019982
4019983
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
AATCTTGACCAAGAGAGCGGAAAGCCCAATTCCAAACC
4020056
4020057
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GAGGCTGCCGATCCGGTTTTGCAATAAACTGAGTTCGC
4020130
4020131
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GTGATTCCCAAGGCTGTCCAGATCCCTGGACCTA
4020200
4020201
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
AAAAACATCTCCGTCTTTAAATACGGATGTTTTTT
4020271
4020272
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
TCCCCTCCTAAGTGGGATAAAATTAAGCATGAAGCATGGTC
4020348
4020349
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
CCCCTCTTTGATTCTGCAATGCAGAGAGGATAACGTTCAA
4020424
4020425
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GAGGAAGGCCCCACCCATCAAAATTAATCATCTACGC
4020497
4020498
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
TACTTAATGCACCTATTGAATCTAGCTGTTCAGCAA
4020569
4020570
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
CTGAAGCGTACAAGAAAGTTTTGCCTTTCAATTC
4020639
4020640
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
CCCGGATCGGGAGTTTGTAGCTCTCCGATAAACCAA
4020711
4020712
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
TGGGCTAAGATTTTAGACCGCAGACGGTCAAAAAA
4020782
4020783
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GCTTGTTCAACGTTTTCTTGCGCCCCTTTTAGGG
4020852
4020853
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
ATAACGTCAGCCTCTTGAGCGCCATTTCGCAAA
4020921
4020922
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
AAACCCTGCACATATCAGCCAGCACGTCAGACCCCGGTGTC
4020998
4020999
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
CTTATCTCTATGGCTATTGCTATCAATTCTTCGTAGA
4021071
4021072
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
TCCTTTTGGGAGAAACTTTGAGTAATCCACATGCAATA
4021145
4021146
CCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATTGTTGGAAAC
GAAATTTAATTGTCTTTTGAGGAGACTTACTTTGGTT
4021218
4021219
TCCTACCTATTGGGTTGAATAGGAATAACTGAAAAA
4021254
Left flanking sequence : Till position 4019765 (length
bp)
CAATGCTTTACTTGTTTTTGGGAGATAATGTATAATTATTTTGGGGTTGCGTGGATTTGTCCTCTGAAAC
CTTTACCCGGTCTGGGCTGCCAGACGAACT
Right flanking sequence : From position 4021254 (length
bp)
CCTAGAAAAATTGCGATCGCGCGTGACTCATCCCTCTACTTATGAAATTCAATAAAAGTAGGGGGTATTG
AGTGTATGACTAAAACTGATTTATTGTAAG
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp