Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_011837_2                                                                                                                 top


Strain : Clostridium kluyveri NBRC 12016 RefSeq :NC_011837 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011837_2
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACNumber of repetitions :12
Begin Position : 2298663 End Position : 2299412

2298663TTTTTTTGTCAAATCTTGTTAAGGTTCAACAAGCAGTAAAGATAAATCTTTAAGGATTAAAAATGG 2298728
2298729ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCAACCACCTTCTTAACCTTATAAAATTGTGTTC 2298791
2298792ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTATACTGCCTGAAAAGCCAAATATCCATAAGCATT 2298857
2298858ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGATTCAACAATTACCAATATTTTTACCTAAAGTTTTTAATCTT 2298922
2298923ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTTTTAGTAAGAGGACTTAACCATTTTGGCAGCTCT 2298988
2298989ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACACACTATATTTTTGAATATCACCTTGTAGTATTTTAG 2299055
2299056ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTGTATCCCCATCAATTCCTCTATTCTTTATAGAT 2299120
2299121ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCAGCAAAGATTATGGAATTATAAGGAGGAAATTTAA 2299186
2299187ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACTTTCCTATATTAATCAACATTTTATTTTCTCATGTT 2299252
2299253ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCTTGTGGTATTAAAACAATCCTGTCTGGTACTCC 2299316
2299317ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAACCTAGGATATGCATTTTTATTCTTTTTAATAATTCTT 2299382
2299383ATTTAAATACAATCCTTGTTAAGGTTCAAC2299412
Left flanking sequence : Till position 2298663 (length bp)
GTTCCCATGCTATTTCACAAAAAAGTTCTGGAAAAAGCAGTTCTACTATTTCTACTTCAAAGGTTTCCAA
TATTGTCTTCCATGCTGTATCAAAATCATA
Right flanking sequence : From position 2299412 (length bp)
CAATGTAAATTAGCCATTCTTTATTTTTATTATAACCCTAAATACATTGGCAATAAAGAGTTTGTTCGAA
ATTTTTCCAACCGTTTTTTATTTTTCAAAA
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp