Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation


Other Tools


GPMS Links





NC_011837_5                                                                                                                 top


Strain : Clostridium kluyveri NBRC 12016 RefSeq :NC_011837 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_011837_5
DR consensus (30 bp) : ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACNumber of repetitions :25
Begin Position : 2766591 End Position : 2768194

2766591TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAACATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT 2766647
2766648ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA 2766713
2766714ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACGTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT 2766779
2766780ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA 2766845
2766846ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT 2766912
2766913ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG 2766978
2766979ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC 2767043
2767044ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT 2767109
2767110ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACCTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC 2767175
2767176ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT 2767241
2767242ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA 2767307
2767308ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAACTTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG 2767374
2767375ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC 2767439
2767440ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT 2767505
2767506ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC 2767569
2767570ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA 2767636
2767637ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT 2767700
2767701ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG 2767767
2767768ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG 2767834
2767835ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG 2767901
2767902ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC 2767967
2767968ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACCTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC 2768033
2768034ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACGTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA 2768099
2768100ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAACTAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA 2768164
2768165ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC2768194
Left flanking sequence : Till position 2766591 (length bp)
ATACTATGCGAAGATATATTAAATTATGTTTTAAACCTTAACCATTAAAATTGATTGTAATATTAGCTTT
AAAACTCTCGAACATATAATATTCTGCTCA
Right flanking sequence : From position 2768194 (length bp)
TAACGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTTATTATATCCTTTAAACCACCATAGATAAAGCCTTTTATTAAA
ATCTTTCCAACCATTTTTGATTTTTTGAAT

Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp