CRISPR details
Home
About CRISPRs
News
FAQs
Help
Contact Us
Examples
IGM
Navigation
Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison
Other Tools
CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder
GPMS Links
GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service
CRISPRs details
NC_011837_5
Flanking alignement tool
Page manual
  
Home Page
NC_011837_5                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium kluyveri NBRC 12016
RefSeq :
NC_011837 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011837_5
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
Number of repetitions :
25
Begin Position :
2766591
End Position :
2768194
2766591
TATATTTTACAACACTTGTTAAGGTTCAAC
ATAAATTTAAACATTTACCATTAAAAT
2766647
2766648
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TCATATTGAATCATATCATCAGTTTTTTCTATGGCA
2766713
2766714
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
GTATCCAAAGCTTCTGGAGCTGCATCTATTACCATT
2766779
2766780
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TATTAAGAGATGCCTTGAGTTATGGAGCAATCCTAA
2766845
2766846
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTAAGTCAATATAGTTTTGTATTTCAGGTATCAGCTT
2766912
2766913
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTGACCTGTAATTGCAAGTGCAGCAGCCAGCCATTG
2766978
2766979
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CCTGTACAAAATGTGCTTTTGGTTGTAAACCCATC
2767043
2767044
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
ATTTAGGATCAATATTAAATATCTCCTTTCTGGAGT
2767109
2767110
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
CTCGATCTTTTCAATGTCTGTTACTGCTATTTTGTC
2767175
2767176
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TCCTGTGTTCTTCTATTTTACTTTCGTTATAGGCCT
2767241
2767242
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TACTGTATTTCAAATTATCACAGGATATTCTAACAA
2767307
2767308
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGGTTCAAC
TTAGTCATTTCAGTTGGATAGTGTTCAGCATAACTTG
2767374
2767375
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TATAACATTTTTAGTGCTTCATATCTTCTTTCCCC
2767439
2767440
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TATGGAATTTAGCAAAGGCAGAAGAATCAATACTTT
2767505
2767506
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTATGTTTTTTATCTTTGTGTTTAATTCCTCTAC
2767569
2767570
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTGAAGCAAAAGAAAATACTAACACACCAGAAAGTAA
2767636
2767637
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CCTAGTTGGGTTATTAATGCCTCCTTTTTCTTTT
2767700
2767701
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GCTTATAGTCAAGGAAAATCCGTACTTAGAAAAGAGG
2767767
2767768
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CCAGTACCGCCTGTATTAAATGCTATTTTACCTTCTG
2767834
2767835
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GATTTAATCCATTGTTTTAGTGTCAATTCATCTTTAG
2767901
2767902
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
ATTTCCAGAGTGGAAAACAGCAGACATAATTATACC
2767967
2767968
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
CTTCCTCACCTATAATAGTTACTATGGGGTCTATGC
2768033
2768034
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
GTACAAAAACTTCCTTCTCGCAGAGGTCACCCTCTA
2768099
2768100
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
TAAATAGTAAAAATTATAAAAATTGAATACGTTCA
2768164
2768165
ATTTAAATACAATTCTTGTTAAGATTCAAC
2768194
Left flanking sequence : Till position 2766591 (length
bp)
ATACTATGCGAAGATATATTAAATTATGTTTTAAACCTTAACCATTAAAATTGATTGTAATATTAGCTTT
AAAACTCTCGAACATATAATATTCTGCTCA
Right flanking sequence : From position 2768194 (length
bp)
TAACGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTTATTATATCCTTTAAACCACCATAGATAAAGCCTTTTATTAAA
ATCTTTCCAACCATTTTTGATTTTTTGAAT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp