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CRISPRs details
NC_011837_6
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_011837_6                                                                                                                 
top
Strain :
Clostridium kluyveri NBRC 12016
RefSeq :
NC_011837 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_011837_6
DR consensus (30 bp) :
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
Number of repetitions :
19
Begin Position :
3510143
End Position :
3511358
3510143
ATTTTAATACAGCCCTTATTAAGGTTCAAC
AGATGTTAAATTCGAATATGAAACTTTTGTAGAAGA
3510208
3510209
ATTTAAATACAAATCTTATTAAGGTTCAAC
GCAAAACTAAGAAGGTACAGTATGGAAAATGAAAT
3510273
3510274
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
TGCTACCAAAGATGAAATATCTAATGCTGGTTATGG
3510339
3510340
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
GGATGTTGACATAAAAAACCTTCAAACTTCTACAGGG
3510406
3510407
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
TGGAGACTTGATGTGTTCAATTCTCATGGAAAGATATA
3510474
3510475
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
TAGACTTATTTATACCTAAAGACATTGCTAAATCAC
3510540
3510541
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
AGAAATTGGCTTAATACTATAGATTATAAAGTATA
3510605
3510606
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
AAGAATACTGATACTTCTGCTAATCAATTTTACATCTA
3510673
3510674
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGGTTCAAC
TAAAAAGCTTTTTTACTTTACCAATAACTTTAGGTA
3510739
3510740
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
ATAGATGATTTTATTAATTCTCAAGGTTTTATTTA
3510804
3510805
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
AATGCAACAACATCTGTAATGGTCTTTCTTTGCCAT
3510870
3510871
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
GGTAATTCAGTTTCTACAACTCCACATTCTTTTATA
3510936
3510937
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
TTAAAGTTAAGCACAAGAGAACTTGCAAAAAAAGC
3511001
3511002
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
GTGCATCAAACTTATTATCAGGTATCCATAGGTCA
3511066
3511067
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
ATGGCTTTCCATGGGACTCCAAACAGTTTTGCTGTT
3511132
3511133
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
AAGCCTACAAGAAAAGAAAGACGATACCCCACAAGA
3511198
3511199
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
TTTGGAAATTATATAATTTAGGGAGGAAATTAAA
3511262
3511263
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
ATGAAAATGCTCATAAGATTAGTTGTACCAACAGTT
3511328
3511329
ATTTAAATACAAATCTTGTTAAGTTTCAAC
3511358
Left flanking sequence : Till position 3510143 (length
bp)
TCGTTAATTTTAATATGGAAGGTTTTTAGGTTAGTAACCATTTTGAGGGTGACTATAGCTTTCTTATATA
TATTGGAATAAAATCAAATATTTGTATAAC
Right flanking sequence : From position 3511358 (length
bp)
TAATGTAAAATAGCCATTTCTTATTTTCATTATATCTCTTTAAGTATTGAAAATAAAGGATTTTATAAAA
ATTTTTCCAGGCAATTTTATTTTCTGTATT
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp