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CRISPRs details
NC_012588_1
Flanking alignement tool
Page manual
  
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NC_012588_1                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.14.25
RefSeq :
NC_012588 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_012588_1
DR consensus (25 bp) :
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
Number of repetitions :
40
Begin Position :
827533
End Position :
830035
827533
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTTACTTTTTCATGGCACATTCTTGACGCTTGACCGAAC
827596
827597
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTTTCGCTAAAGTGAGTAAATCTAGGTAATGCTTCGA
827659
827660
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GTAATTTTACTAACTCGTTACAAGCTTACAATCTATATCTG
827725
827726
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTTTTAATATTTTTCTAATTTCATCACTGATTTC
827785
827786
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTTTCGTCTGCACCCATTTTTTTGCTTAACTCTTCTAGCAT
827851
827852
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAAAAGTCCACGCTATAATCCCATGAATGTTCGAT
827911
827912
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATCCGTATATAGTAAATAATGCCACCTAAATCTATTTT
827974
827975
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTGTCTAAGCTAAAAGCTAAGCAAAAAGCTTATATACT
828037
828038
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AATAATTTCTTTGCTTTTTCTTCCTCTTGTTGTAATAATT
828102
828103
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATAACAACTTCGCCTCCCCGTCGTCCTTAACGAACTTCA
828166
828167
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTGTATAATAGAAACTTGCCTTCCTAAATCTCAGTTT
828229
828230
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AACACTATTCTCTTCCTTACCTCTTTTACGTCCTC
828289
828290
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAGTTAGCCGAGGTAGTGATTAGCCATGGATAGATT
828350
828351
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATTTAAATTTCCAGTACCATAAGCAACTGCTTGTCTATT
828414
828415
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAGTATTTATAGCTTCTTTTATCGTAAAAACACCTTTC
828477
828478
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GTATAGAACAACCACTGCCTAGCACTGTTTGGGTGTCCAT
828542
828543
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTAAAATTAGATGATTTGTTAGGCATGTTTGGCTATCCT
828606
828607
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CCAATAAACCCCTACTGCTTACGTGGCTTAATACGTTAT
828670
828671
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTATATCAATAATGATGGTCTTATCACTGCTGTTCTTCTTCC
828737
828738
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACGAGTTTGTAGAGTTCAAACGTCTGGTTGAGTATGTT
828800
828801
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GATTTATCAAAAAGCGGAATAACGAAGACGCCAAATTC
828863
828864
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTCAAAGCTCTAAGCAGGGAGTTAGCCAACGCCTTGTT
828926
828927
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTATTATATATAACAATACTATATCCTGCGTCCTTTAGT
828991
828992
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TATTCTAATAATGGAAAGCTACTATGATTTTGTGCAT
829053
829054
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TAATTATCAATAATCCATTGAGTTATTGCATAATATCCTT
829118
829119
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ATATCTTGACTCATATTTACACCCGAAAAAATCAAT
829179
829180
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTGATATCTAGGGCGGGCGTTAAATTCGTAGAGGCGG
829241
829242
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
ACGTGTTATATCTATATCTGTCTTCAGCATGTAACGATTT
829306
829307
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTTCGCTTCAGAAAAGTCACTTTAGATCACTTTATATA
829369
829370
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CGTAATCGTTCCAACGGGCAATAATTCTATATATCGT
829431
829432
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GAGACTTCTACATCTTGTCCGCTCATCTGTGTTCTTTT
829494
829495
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AAATTATATGGCCTGAAGTGGGTGTTAAGTACGACAAT
829557
829558
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GAGGTTGGACGGCTAACGAATATCCCGCATTAGGCGGAT
829621
829622
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TTCAAACTCCGGGTCTGTCTCTTCGTAATTAATTTTCTTT
829686
829687
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
TCTAATTTGAATGTTATAACCCTGTTCATAAGTATT
829747
829748
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
GAACTATTGCACCTTTATAAGTATCCTCTTCTTCAGTTTTCTTA
829816
829817
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AATACATTAGCTATACTTGGATATCCAAGATTTATACCT
829880
829881
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
CTTTTGCGTAATAAATTTATACGTCCAATCGGGCATTCTT
829945
829946
GATTAATCCTAAAAGGAATTGAAAG
AACATGCTCAAAGCAAGTGATGGGATGATTACTAACCTAC
830010
830011
GATCAATCCCAAAACGAATTGAAAG
830035
Left flanking sequence : Till position 827533 (length
bp)
AATTACAACTAGAATCGGTCACATGAGGAGTAAAGGATAATAATGAAGATTTATAAGCAAGAAAGGAGTA
AAGTAAGATAAGAAGTATAAAAACACAACA
Right flanking sequence : From position 830035 (length
bp)
TAATAAACGATTGTTTGACGACATTATTTACAGGGAGTGTTCTCGTGCAGTCATCTTATTCGAGAACATA
TAGTAAAATTATATCAGATTTTGTCTAATA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp