Institut de Génétique et Microbiologie

CRISPR details


Home About CRISPRs News FAQs Help Contact Us Examples IGM
Université Paris Sud

Navigation

Home page
CRISPRs database
Browse CRISPRs
BLAST CRISPRs
FlankAlign
CRISPRs utilities
My CRISPRs DB
CRISPRs finder
CRISPRs comparison

Other Tools

CRISPRcompar
CRISPRtionary
CRISPRfinder

GPMS Links

GPMS Team
Tandem Repeats DB
MLVA Web Service


NC_012589_3                                                                                                                 top


Strain : Sulfolobus islandicus L.S.2.15 RefSeq :NC_012589 (chromosome circular)
CRISPR id : NC_012589_3
DR consensus (24 bp) : CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACNumber of repetitions :124
Begin Position : 619171 End Position : 627116

619171AGGGCGTTATTATAGTAGATTAACAAATATGTGAAGACGAAGCAATTGCAAGGGTAATATACACTAA 619237
619238CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGTGAGGAAAAGAACCTTTCAAATCTCCTATCGGTGTA 619300
619301CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCATTACACCAGTATATTCACCATCACTGTCACCTATCG 619363
619364CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGATAATAATCCACTTTCTAATTCTCAACAATTATATTT 619427
619428CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCAGTAAATGAACAAGTTTCAGCGGTCTTGTCTGAATA 619489
619490CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCTTTTTCTTTTTTTGAGAAGCCGTTAAAGAAAGTTAAGCTAA 619557
619558CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAAACTATATCCTATTATAACAAGCAAAAACCTTACCAT 619621
619622CTTTCAATTCTATAGTAGATCAACTACGTGTTCATACATGTTGATGGAATTGCTCCAGTTGCAGA 619686
619687CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCTTGAAGACTTGGCAAAGAAAGGGTTCTTAAGCTT 619746
619747CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGATTCGCTTAACGATTTTATGAACAGAGTATTATGGTG 619810
619811CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGCTGTTTGAGAGAAGAAATAAATAAAAAACGGGTTAGCTT 619874
619875CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACTGCTTTTGCTTTTTCTTGGTGAGAAGTACAGATGCTCATG 619940
619941CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGTGACAACCTTTTAGGTACTACCGTACGCCAGGCTA 620002
620003CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAGGGGGGCAAAAATCAGGATTAGAGTCTTTTTTAGATCA 620067
620068CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGGGCATAAGAAGCTGGACAGGATAATACAGTATACGCAAGTCA 620134
620135CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAGTGTGTTAAAAATCAGCTATCTAAGCGGATATATAAA 620198
620199CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGCTAGCCGGTACATTGAAAGTAGGAATCTCGATTACTTT 620262
620263CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAACGCTATGATCACTAGTGCTATAACTATCCAAACCCATAC 620327
620328CTTTCAATTCTATAGTAGATTAGCTTTGTTAAACCAGTATTTAAACTTTTTCCCTAACTAGCT 620390
620391CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCCAGTATTGCCAAAGGTTTTTGTCGATGCCTATACATATGTAA 620458
620459CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAGGCGTATTAAGCTCTAGCAACCTCTGGAGCTCATCAGT 620523
620524CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCAGCCTTAATGTTTAAAAATAAAAATCTCGTTGGAGCAAAG 620588
620589CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGAGGTCGACTTGGATACGATACAAAATGCACAAAGACTGAT 620653
620654CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTGTTATTACAAGGTACTATACAAAACACAAATACGTCAG 620717
620718CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAAAGCTTATCAAGAAATTGTTAAAAATGTAAATTTATC 620781
620782CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGGCAAGTCTTAAGGAAATATTAGATCAATTGGAAAAAC 620845
620846CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGAAACGATAATTAGGAGAAGAGTTACTATACTAACATA 620909
620910CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGGAAAACTTCGACACTTTATATGTGTTTAGTTTTTCTTCTGGA 620976
620977CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGAAAGGAACTTAGAAAAAATATTGAAGAGATATTCGTCTAA 621042
621043CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAATTGATTCATGTCAAACGGTGGTGTGGCATTTATCTGT 621106
621107CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGGTTAAGTTGTCCTTACTCGTCACATTGGTCTAAGAAGAATA 621174
621175CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGTTATAGAGTATCTGCCAGCCGTATTCCGATACCCCAT 621237
621238CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTATGATGAGTATAAAAGCAGAATCGAACAGAATTATAATTTT 621305
621306CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAAAGAAATTTCATAAAGCCTTTTTATGGTGATACAAAGGA 621370
621371CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCAATTTAGGCTATTCAAATCATTTTTGTGTAAATATAGAC 621436
621437CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTGTTTCTTTTTCTCTTTCCCATCACAAAAAATTGTAA 621498
621499CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTATTTCACGGGATAAATTTTGAAATCGTGAAAAAAGCAG 621562
621563CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCATATGAAAGGACTTCTCATAAATGGAAAAATACTTAATCA 621628
621629CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAAAGAAAACTTTAAATATGAGAGTTGGCATAGATAAAATT 621693
621694CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTAATGAGGGGAAAAGAGTGGTGGATCATTATTATATTAT 621757
621758CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGAGATAAAGAAACAACTCAAAATGAAAAAAGAAGAGTTTTAAAA 621825
621826CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTCTTTTTCCATCTTCTGTTATGATATCTATTCGATCAGA 621889
621890CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGCTAATAGTTTTTAATTCTATTAGGTCATTATTGCATATT 621953
621954CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCCGTGAACTTAGGAAATGCAGAGGCTGAGCTTAGAAAAAT 622018
622019CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTCCTTCCACGCCCCTACAAGAAGGATGAGTTTTTG 622078
622079CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACTAAATAATTGGTATAGCGTGGTGTACACGTATAAGTAC 622142
622143CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAATTGGCTCAGAATTCCCAATAAAATTACGAAGTGGAATG 622206
622207CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTTGTTGATTTGCAGTTGCAATAAATCCAGCGATATAAATT 622272
622273CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTGAGTTTGATGAAGGAATTAATGAAGAAGAAAGAGAAA 622335
622336CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCACAGACTTTCATGGTGTAGAAGTCATCCTGATAAATGTA 622399
622400CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGTATGTATCAGTCACGTATTCAATTTCCTTCCTTGGTTC 622464
622465CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGTACATTCCTTTCCTATATGCCATCCAGAAATTACCAA 622528
622529CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAATTAAAGTATTAATGAAGATGAAACTTAAGAACCATAA 622591
622592CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGTCGTTAACCGCCCTAGTCAAGGTGCCGGTCAACTGAT 622655
622656CTTTCAATTCTATACTAGATTAACCCCAGGTCGGCTCCAGTACTTCCCCTTGCGTATAAATTGA 622719
622720CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTAGACGCGGTGCCTTATCCGCGGGTAAGTTTGTATTTAGG 622785
622786CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTCAAACATCTGCTTGAGTACATCAAACGTTACGATGAGAAC 622852
622853CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCGTAGCTGTGTTCAGCTTTGCGTTATCCAAACTGTTCA 622915
622916CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTTTTGCCCGCTCCTCCTCCTATCGGCATACCCTGACTA 622979
622980CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGTAAAGTCGGTGTTATACAATATTCTTTCTCAAAAATTT 623043
623044CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACAAGTTTGATACATTGTTTTTGGTCATCAATTTCAACATT 623108
623109CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAATCCGCCATGTCGTGTGTGTGATCGAATGGGAACATGTCT 623173
623174CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGCTATCTTTGTGTACATGGCTTTCTTTGCTAACTCGA 623236
623237CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAACTACGGTATTAGTAAATTAAGGGAAGGTGAAGAGGAAA 623300
623301CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATAAAACATAATAATTAGATCTGCTTGTTTGTAGACAAT 623364
623365CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGAAACTTAGTGACATGATCAATTATCACAGTATAAAT 623427
623428CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGCTTAGTTATGAAACCTGCGAGAACATTGGAGATGTTAAT 623491
623492CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGATTAGTTTGTCGATACAGTCCTGCAGTACGGGGGAAT 623555
623556CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGAGGTGACCTGACGATGAAGGTCGCAATATGGATTTCTA 623619
623620CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGCTTACACTTATTTTATTACAATTGCTACTAATTATCGATA 623685
623686CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCGCCGTTCATGGTTTTCAAGAAAATTTGAGTTTGAAA 623747
623748CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAACACTGGGATTGGCAAATGTCCTTCGCCAGTATTAACAA 623811
623812CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTTAAATATCCCGGAAGCCAAAGATTATTAAGGTTAGTGGA 623876
623877CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGGGCATCATTACCACCTACCTCCCTACCTCGGTAAACTG 623940
623941CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGCGTAAATTATCCACCTATAGGAGAATGTTCGATAGATA 624004
624005CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTCTACTTGTTAGATGCTTGCTACTTACGCTATATTCAA 624067
624068CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGACGAGTATACTTATTGCACTGATGTTGATCATTGTTTT 624132
624133CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAAACCAAAGCAAGAGCTGGAAACCACATGAGGAGTTTT 624196
624197CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACAGAGCGCCCTCTGGTATGATGTCCGGATACTTATAAAATA 624262
624263CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAATTTATACGCCAGTACGCGGCAGATCTACGAATATCGTG 624327
624328CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGCTAAATTATTAAGAGCTGAAAGCAAAGATGAAATAATTG 624392
624393CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATTCGATATGGTGAATTAGCAGTCGACGTTGACCTGTG 624455
624456CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACATAATTATTTGATGAAAGATGGAAGTCGATTATAA 624518
624519CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAATAGATAACGGAGCGGAAATACATTACGAGAATGGATATA 624583
624584CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAATATCCCAAATTGAAATATATTGCAACAGTTTATAATGT 624647
624648CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTAACTTGTACGAAAGAAGAGGAAGTATCCTGTCAACCAGA 624712
624713CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAATGGCACCGCAACTGTAGTGGATGCTGAGGTAATATAC 624777
624778CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTACCATAGCGTGGACTGAAAGCATATCTACACAAGTACCACT 624844
624845CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTGATGAAGTCCAGAGTACCGACTGCGACTCCGCATTATGC 624909
624910CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGCGTCTAAAAGAATGAGTAGTCTCTCTTTAGTCCT 624969
624970CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGGATCATAGCCAAACGCCTGAAGTAATAAAGCCCAAAGT 625032
625033CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCGGCATAGATAAATTGCCTGAGGAATCGCTCCGCGGGTAT 625096
625097CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACATTATTTTGACGTAGCAAACGAAGTCCCGTCTCTACT 625159
625160CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAGGTAACTGGTACATTTACTTAGAGGAGGGAATAAACGT 625223
625224CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTAATTCATCATTTTCCAGATGGAAATGTAGTCATAG 625284
625285CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACAATCTAATTTTGTGAATGTTTGTTTTTTGTTAATAGAC 625348
625349CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTACAGAATGCTAAAATGATAAAGACAGAAAAAGAGACAT 625413
625414CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTATGTAATCGTGGGTAATTACACTAGTAGAATTCGATTG 625476
625477CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATAGGACAAATAGCGAGCACGTTAGCGGTATGGACAGAAC 625540
625541CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGGAACCAACACTATTATCGTAGAAGTATCAAGTGTACAAAA 625605
625606CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCAGTTTTACCATCTCCACTTGAGAATATCCAAATTCCTCA 625669
625670CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACACGGGACATTTTATTCCCCTTAAAACGGCGTATAAAAGAGT 625734
625735CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTAAGTGCCGAGCTTTGCTAGACTCCCCTCAAGTGCGGAAC 625798
625799CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGCATATAACCCCCTGTTTTCTCCCCAACAAGAAAATGTCATCA 625867
625868CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGGGTTGTCGTCTATTAGCACGACGTCTCCCAGACCCTTA 625931
625932CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTAAAGTTAATGAGGATGGAACGATGGAGACACTTCAAGAA 625997
625998CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGCTAGTTAGCTAGTTATATAATATAGTAACTTATAAAT 626060
626061CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATTATTATCTTGTACATGTGACACATCATTATACAT 626120
626121CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGTAATAATTTAGGTCACCTAACGCTATGTACTTCTTTTCCA 626187
626188CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAAGAATGGATGTACCTAGCTATCCCCCTAATCCACAGAATCT 626253
626254CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTATATAAATCTCTTTACGCTCTTACTTTACGTGAATCTA 626317
626318CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATACAAATATTTCAACATTAAATGCAATAAGTGTAGATAT 626381
626382CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTGAAAAAGTTATTAAATTCAATATTACAATGGCTTATGG 626445
626446CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACAGAAGAAAAGTTAAATCAAGAACAAAATTTAAATCAGGAGAT 626511
626512CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTCGTTGTTAACTCTGCCTTTCCATTATCAACAAAGAATTAA 626576
626577CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTCCATTCTCGTGGAGCCAGATTGGTTACGTGGGGATAAG 626640
626641CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTTATCGAGGTCTACAACTAGGACTTTCATAAGAAAAAAT 626703
626704CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACATGCTAATCATTACATTTAAGATAATACACAAATATATAATT 626769
626770CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGTAGTTTGTCAATCTTTTCATATGGTAACGGAATAGTCAACCT 626837
626838CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCCAACACCTACAACAAACGGGCTGGAAATGATAAATAACCA 626902
626903CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACCTCATCATGGGATTTCAAGAGCTATATCTCACGCCGTCAA 626966
626967CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACGTGAATTTTCTAATTGATTTAGCTAAGAAATTAAAGAATGA 627031
627032CTTTCAATTCTATAGTAGATTAACTGCTTTACAATTTTTTTCATCGCTGCATATAAAAAAT 627092
627093CTTTCAATTCTATAGTAGATTAAC627116
Left flanking sequence : Till position 619171 (length bp)
AGAATAGCGAGAAAAAGACTGAAAATTCCCTACATAAAACCCTACAAGATCGACAAGAAGAGACCAATAG
ATGCCGACAATATACTTAGGGAGAGGTTGA
Right flanking sequence : From position 627116 (length bp)
TGAGGGTTTTTATAACCCTCTATTCTATCTTTTCTTCTCCCTTTCTTATAAGTTTTTCTTCTCTACTCTT
TCCATTAGTATTATATTACTCTTTCTTATC
Print the CRISPR sequence : From position bp To position bp