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NC_012632_3
Flanking alignement tool
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NC_012632_3                                                                                                                 
top
Strain :
Sulfolobus islandicus M.16.27
RefSeq :
NC_012632 (chromosome circular)
CRISPR id :
NC_012632_3
DR consensus (24 bp) :
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
Number of repetitions :
67
Begin Position :
946465
End Position :
950691
946465
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCATTTTAGACATTGTGTCGAGGAGCATGGACTTGATGTTG
946529
946530
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTAAATATTAAAGTTTTGCATTCTTTGTACGCGTCACCAG
946593
946594
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAAAAATTACAGAATCTCTTTATAAAATTTTAGAGCAGAAG
946659
946660
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCAGAGTTGATTATTTGCCAACTGGTGCAGTTCTTATAGG
946724
946725
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATGGTTGAAAGTACGTCATGGAAAGTACTACCGTAT
946784
946785
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTCTAATTCTTCTTTTAGCCTTGATGCAATCAGTATCA
946847
946848
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTATTGAACGCAGATATTAAAGCAGCATCTTCATATTCCGT
946912
946913
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CGGCGGTTACAACAACAAGTACTGCATACGTGATGGTGGGTTA
946979
946980
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTGATTAACACTAGAAATCGCATTTGAAATAATCGTTACGG
947044
947045
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTCTCTGTTCTGCCATATCGCTATCCAGTAATCACT
947105
947106
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACCTAGTGGTAATGGGGGATTCGCGTTAAACGTCACCTT
947168
947169
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTTATAACAAACTCCAAGAATGGGAGAGAGTAAACAT
947230
947231
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTTTCTGTAATCGCTGGGATTCCTCATTATCAGATAAT
947293
947294
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGGCTTGTTAAGCCAGGGAACTTACACACGTAACGTTT
947355
947356
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAATCTTTCGCTAACGGAGAGGTTAGATCTGCGGCT
947415
947416
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CCAGTTGTCGCTTCATATGCAACATCTATCCAATACGTT
947478
947479
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATGGCAAAAGGAACTAGTTGAATCTTCTCTTAAGTTAAA
947542
947543
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTACCATCCAGTCCCTACAATTTACCGGGTACAGGTCTAC
947607
947608
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTGAAGTTGTGCCCCCCTCACTTTCACTTTCCTCCTC
947669
947670
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTAACGGTTGAATATATTAATCACGTACACACGTATGT
947732
947733
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGGGAAATACTCATCCGCCATGTTTTCACTAAAACATA
947794
947795
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATTACTAAAAGGTCGTTCTTGGGATCGTATCTATATC
947855
947856
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACAAATAGAATTGCGACCGGGTACAATTTTGACAACAAAACTA
947922
947923
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTACTTTATGGTCCCTTTCTAATTATGCTGACTTCAG
947984
947985
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATATTATCATCATTGAATATCTCTACTGTATATGTTTG
948046
948047
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTAGCATATGTTAGATTTAGCGATTGAATTACAGTTCCCGCT
948112
948113
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTAGCAGAAATAATAGCTACATATGACCCTAACAATGT
948175
948176
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAAGTTATTGGGGACAATACGGGGGATTTTTATTCAAT
948238
948239
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTAAATCCATATGAGTTCTATCAACTACTTCAGCAAACTGGA
948304
948305
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGAAATAGTATTTCCGTCGGTGGTAGTTAAGTGCTCAAAAAA
948371
948372
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCTTTGGGAGGGCGAGCGGGTTTATCCCGAAGTTCGGG
948434
948435
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAACCGCATCACAGTGGTTTTGAAGAAGTAAATATTTA
948496
948497
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTGTGAGTTGGAGACCGTTACGGCCACGCATTCCACGCGT
948561
948562
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATAATACGGTACCTACGTCCATTTGCGACGTCTCATTAAT
948625
948626
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGAACGGGTAAGCATTCCTCTACCTTATGCACCACATCAATCT
948692
948693
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGGGTTTGGGATAGCTAATGCCAATCTAAGTCATCTAT
948755
948756
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAACAGGTCGAAAGAGCTGAGCTTTGGCATGCAATTTA
948817
948818
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTAGTTTGAACAAGTTGGACATAACGTCCGTAGAACC
948878
948879
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATTGTCCTGCAGTCTCGTAATATACTTTAGTCCCATACA
948942
948943
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTATATTGAATTCTATGCATATTCAATATTTCTCAACACCTT
949009
949010
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCTACAATTTTGGAGGAATTTGGATTAGATTTAACTTTAT
949073
949074
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAATTTTTTCGTTGTTTTTATCAAAACACAAAGCACTA
949135
949136
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GAAGAAGAGTTAGCAATATTAGATCTATATTGCGCAAATATG
949201
949202
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATCTACGGTGCAGCAGGTCTATTTTTTGGAGTATTGA
949263
949264
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGTACAGGGACGTTCAATGAGTAAGGCTCCGCAAGGTAG
949326
949327
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTTGTAACCACCTTTTCGGTTACGCTCTCAAACTTACCACTAAT
949394
949395
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AATTCTTTCAATCTTTCTCTTATTGCCTCGTTAACAAATTC
949459
949460
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TAGACCCTTCTTATCTACTTAGGAAGTTAGACGGTTACC
949522
949523
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AGAAAGAAACTGGGCAGAACTAAGAAACTTTATATCAA
949584
949585
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCATTTGTATACAATCTTATACATATTTCTTCATTATTCT
949648
949649
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACGTACATAAAAATTGCTATAGCATTTGGAGCTGCGGCA
949711
949712
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCCAGGACGGAACAAAGCTAGGGGAATTATTTGCAACGTCC
949776
949777
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TTATTTCTCAGAATATCAGAGAAATGGGATCGACAAACGGG
949841
949842
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TATAATAATTAAATACTTTGGTGTTAGACTGAAATCTCTT
949905
949906
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TACCACCGTTGCATTTGTTATCTCTCGGTAGTATACTTT
949968
949969
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAAAAATTTGTTCTTGACAGGTCAGAAAAGGACTGGTAAG
950033
950034
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TCAACTACTACAACTCCTGCATATGTATTTCCTACAACTCTT
950099
950100
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTGATAATAATCCAGTTGAAGTTGAAGTAGTCATAGATGT
950163
950164
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
TGTACTCTGGATAGGGGAACCCGACAATGAAGATAGCCTT
950227
950228
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTCTAATAGCTTCTGTTTCAGAGATGGGTTAGCTAA
950288
950289
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAGCCCTATTTAGGGGGTAAACCCCCTAAAACCCCACGT
950351
950352
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
CTTGACATTATTCTTATACAATCTAAACAATAACTATGTG
950415
950416
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
GTTTTATTAGATAAAAATGAAGTTGAAGAAAAAATTATTA
950479
950480
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ACTGATACTCTATCCCATATATTGCAAGATCCCTATC
950540
950541
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
ATCTTCATCTCCAAACTACTGCTATTAACTTATCTCACTC
950604
950605
GATAATCTACTATAGAATTGAAAG
AAACGAAATATCGAAGGCGTCAGATGAGGAAAGGAAGAA
950667
950668
GATAATCTACTATAGAATTGAAAT
950691
Left flanking sequence : Till position 946465 (length
bp)
GTGAAAGGATGAGGAGAAAAATTGAAAAGATAATACAGAGTAAAGCTTATAAATAACGAAGAGAGAACAA
GATATTAGATAAAAGTTAATAAACCCTCAG
Right flanking sequence : From position 950691 (length
bp)
ACTATAATGTAAGTTGGATTTTGTAAGTAGAGTCTTTATTTACAATAGTTACAATAGAGTAAGAGGACTA
GTTTTAGCTTAAGATGTTGAAAATGAGCGA
Print the CRISPR sequence : From position
bp To position
bp